ChemComp-C2G: [CYTIDINE-5'-PHOSPHATE] GLYCERYLPHOSPHORIC ACID ESTER

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: C2G
• 名称: 名称: [cytidine-5'-phosphate] glycerylphosphoric acid ester; 別称: CYTIDINE 5'-DIPHOSPHOGLYCEROL

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₂₁N₃O₁₃P₂ / 原子数: 51 / 化学式量: 477.255 / 形式電荷: 0

その他

1n1d

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: C2G / モデル座標のPDB-ID: 1N1D

履歴

作成	2002年10月29日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(OCC(O)CO)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)N=C(N)C=C1)C(O)C2O
• CACTVS 3.341: NC1=NC(=O)N(C=C1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH](O)CO)[CH](O)[CH]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC(CO)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC1=NC(=O)N(C=C1)[C@@H]2O[C@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)OC[C@@H](O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO[P@](=O)(O)O[P@](=O)(O)OC[C@H](CO)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H21N3O13P2/c13-8-1-2-15(12(20)14-8)11-10(19)9(18)7(27-11)5-26-30(23,24)28-29(21,22)25-4-6(17)3-16/h1-2,6-7,9-11,16-19H,3-5H2,(H,21,22)(H,23,24)(H2,13,14,20)/t6-,7+,9+,10+,11+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: HHPOUCCVONEPRK-CNYIRLTGSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-[(S)-{[(R)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]cytidine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxo-pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl [[(2S)-2,3-dihydroxypropoxy]-hydroxy-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-1n1d:
Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase complexed with CDP-glycerol

PDB-3l7k:
Structure of the Wall Teichoic Acid Polymerase TagF, H444N + CDPG (15 minute soak)

PDB-3l7l:
Structure of the Wall Teichoic Acid Polymerase TagF, H444N + CDPG (30 minute soak)

PDB-4q7c:
Structure of AF2299, a CDP-alcohol phosphotransferase