ChemComp-ATF: PHOSPHODIFLUOROMETHYLPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ATF
• 名称: 名称: phosphodifluoromethylphosphonic acid-adenylate ester; 日化辞名称: アデノシン5′-[ジフルオロ-[β,γ-メチレン]三りん酸]

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₆F₂N₅O₁₂P₃ / 原子数: 49 / 化学式量: 541.189 / 形式電荷: 0

その他

1dvr

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: ATF / モデル座標のPDB-ID: 1DVR

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / BindingDB / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: FC(F)(P(=O)(O)O)P(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(C(F)(F)P(=O)(O)O)O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@@](=O)(O)O[P@@](=O)(C(F)(F)P(=O)(O)O)O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H16F2N5O12P3/c12-11(13,31(21,22)23)32(24,25)30-33(26,27)28-1-4-6(19)7(20)10(29-4)18-3-17-5-8(14)15-2-16-9(5)18/h2-4,6-7,10,19-20H,1H2,(H,24,25)(H,26,27)(H2,14,15,16)(H2,21,22,23)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ODWAWOIUPXBZKQ-KQYNXXCUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-[(R)-{[(R)-[difluoro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]-difluoro-methyl]phosphonic acid

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1bwf:
ESCHERICHIA COLI GLYCEROL KINASE MUTANT WITH BOUND ATP ANALOG SHOWING SUBSTANTIAL DOMAIN MOTION

PDB-1dvr:
STRUCTURE OF A MUTANT ADENYLATE KINASE LIGATED WITH AN ATP-ANALOGUE SHOWING DOMAIN CLOSURE OVER ATP

PDB-2vr1:
Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with ATP analog, ADPCF2P.