ChemComp-AMO: ASPARTYL-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AMO
• 名称: 名称: aspartyl-adenosine-5'-monophosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₄H₁₉N₆O₁₀P / 原子数: 50 / 化学式量: 462.309 / 形式電荷: 0

その他

1il2

A

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AMO / モデル座標のPDB-ID: 1IL2 / 親要素: A

履歴

作成	2000年11月16日
記述子を修正	2011年6月4日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)CC(N)C(=O)OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: N[CH](CC(O)=O)C(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OC(=O)C(CC(=O)O)N)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)O[P@](O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)OC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C14H19N6O10P/c15-5(1-7(21)22)14(25)30-31(26,27)28-2-6-9(23)10(24)13(29-6)20-4-19-8-11(16)17-3-18-12(8)20/h3-6,9-10,13,23-24H,1-2,15H2,(H,21,22)(H,26,27)(H2,16,17,18)/t5-,6+,9+,10+,13+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: QPBSGQWTJLPZNF-VWJPMABRSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-[(S)-{[(2S)-2-amino-3-carboxypropanoyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (3S)-3-amino-4-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-4-oxo-butanoic acid

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1c0a:
CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE : TRNAASP : ASPARTYL-ADENYLATE COMPLEX

PDB-1g51:
ASPARTYL TRNA SYNTHETASE FROM THERMUS THERMOPHILUS AT 2.4 A RESOLUTION

PDB-1il2:
Crystal Structure of the E. coli Aspartyl-tRNA Synthetase:Yeast tRNAasp:aspartyl-Adenylate Complex

PDB-3nem:
Aspartyl-tRNA synthetase complexed with aspartyl adenylate

PDB-9m5n:
Plasmodium vivax aspartyl-tRNA synthetase in complex with aspartyl-adenylate (Asp-AMP) Complex.