ChemComp-ABF: 5-O-phosphono-beta-D-arabinofuranose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ABF
• 名称: 名称: 5-O-phosphono-beta-D-arabinofuranose; 別称: BETA-D-ARABINOFURANOSE-5'-PHOSPHATE; 5-O-phosphono-beta-D-arabinose; 5-O-phosphono-D-arabinose

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₁O₈P / 原子数: 25 / 化学式量: 230.11 / 形式電荷: 0

その他

1o8b

BXX

タイプ: D-saccharide, beta linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: ABF / モデル座標のPDB-ID: 1O8B / 親要素: BXX

履歴

作成	2002年11月26日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEBI / ChEMBL / DrugBank / Metabolights / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCC1OC(O)C(O)C1O
• CACTVS 3.341: O[CH]1O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(C1C(C(C(O1)O)O)O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@@H]1O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C([C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@@H](O1)O)O)O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H11O8P/c6-3-2(1-12-14(9,10)11)13-5(8)4(3)7/h2-8H,1H2,(H2,9,10,11)/t2-,3-,4+,5-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KTVPXOYAKDPRHY-SQOUGZDYSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5-O-phosphono-beta-D-arabinofuranose
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL

• PDB-CARE 1.0: b-D-Araf5PO3

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-1o8b:
Structure of Escherichia coli ribose-5-phosphate isomerase, RpiA, complexed with arabinose-5-phosphate.

PDB-3env:
Substrate and inhibitor complexes of ribose 5-phosphate isomerase from Vibrio vulnificus YJ016