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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1agx | ||||||
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タイトル | REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF ACINETOBACTER GLUTAMINASIFICANS GLUTAMINASE-ASPARAGINASE | ||||||
![]() | GLUTAMINASE-ASPARAGINASE | ||||||
![]() | BACTERIAL AMIDOHYDROLASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() glutamin-(asparagin-)ase / glutamin-(asparagin-)ase activity / asparagine metabolic process / asparaginase activity / periplasmic space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Lubkowski, J. / Wlodawer, A. / Housset, D. / Weber, I.T. / Ammon, H.L. / Murphy, K.C. / Swain, A.L. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined crystal structure of Acinetobacter glutaminasificans glutaminase-asparaginase. 著者: Lubkowski, J. / Wlodawer, A. / Housset, D. / Weber, I.T. / Ammon, H.L. / Murphy, K.C. / Swain, A.L. #1: ![]() タイトル: Structural Characterization of Pseudomonas 7A Glutaminase-Asparaginase 著者: Lubkowski, J. / Wlodawer, A. / Ammon, H.L. / Copeland, T.D. / Swain, A.L. #2: ![]() タイトル: A Left-Handed Crossover Involved in Amidohydrolysis Catalysis: Crystal Structure of Erwinia Chrysanthemi L-Asparaginase with Bound L-Aspartate 著者: Miller, M. / Rao, J.K.M. / Wlodawer, A. / Gribskov, M.R. #3: ![]() タイトル: Crystal Structure of E. Coli L-Asparaginase, an Enzyme Used in Cancer Therapy 著者: Swain, A.L. / Jaskolski, M. / Housset, D. / Rao, J.K.M. / Wlodawer, A. #4: ![]() タイトル: Preliminary Crystal Structure of Acinetobacter Glutaminasificans Glutaminase-Asparaginase 著者: Ammon, H.L. / Weber, I.T. / Wlodawer, A. / Harrison, R.W. / Gilliland, G.L. / Murphy, K.C. / Sjolin, L. / Roberts, J. #5: ![]() タイトル: Structures of Amidohydrolases: Amino Acid Sequence of a Glutaminase-Asparaginase from Acinetobacter Glutaminasificans and Preliminary Crystallographic Data for an Asparaginase from Erwinia Chrysanthemi 著者: Tanaka, S. / Robinson, E.A. / Appella, E. / Miller, M. / Ammon, H.L. / Roberts, J. / Wlodawer, A. #6: ![]() タイトル: The Molecular Symmetry of Glutaminase-Asparaginases: Rotation Function Studies of the Pseudomonas 7A and Acinetobacter Enzymes 著者: Ammon, H.L. / Murphy, K.C. / Sjolin, L. / Wlodawer, A. / Holcenberg, J.S. / Roberts, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 67.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 50.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 416.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 440.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 15.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 35523.352 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P10172, asparaginase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.72 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.81 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.9→10 Å / σ(F): 3 詳細: RESIDUES 10 - 35 ARE DISORDERED; SOLVENT WAS NOT INCLUDED IN THE REFINEMENT BECAUSE OF THE LIMITED RESOLUTION OF THE DATA (2.9 A) AND BECAUSE OF THE DISORDER OF RESIDUES 10 - 35.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR/PROFFT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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