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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aaf | ||||||
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タイトル | NUCLEOCAPSID ZINC FINGERS DETECTED IN RETROVIRUSES: EXAFS STUDIES ON INTACT VIRUSES AND THE SOLUTION-STATE STRUCTURE OF THE NUCLEOCAPSID PROTEIN FROM HIV-1 | ||||||
要素 | HIV-1 NUCLEOCAPSID PROTEIN | ||||||
キーワード | VIRAL PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 symbiont-mediated activation of host apoptosis => GO:0052151 / HIV-1 retropepsin / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...symbiont-mediated activation of host apoptosis => GO:0052151 / HIV-1 retropepsin / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency / viral penetration into host nucleus / symbiont-mediated suppression of host gene expression / RNA-directed DNA polymerase activity / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / 転移酵素; リンを含む基を移すもの; 核酸を移すもの / viral nucleocapsid / DNA recombination / DNA-directed DNA polymerase / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / aspartic-type endopeptidase activity / DNA-directed DNA polymerase activity / symbiont entry into host cell / lipid binding / host cell nucleus / host cell plasma membrane / virion membrane / structural molecule activity / DNA binding / RNA binding / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Summers, M.F. / Henderson, L.E. / Chance, M.R. / Bess Junior, J.W. / South, T.L. / Blake, P.R. / Sagi, I. / Perez-Alvarado, G. / Sowder, R.C. / Hare, D.R. / Arthur, L.O. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1992 タイトル: Nucleocapsid zinc fingers detected in retroviruses: EXAFS studies of intact viruses and the solution-state structure of the nucleocapsid protein from HIV-1. 著者: Summers, M.F. / Henderson, L.E. / Chance, M.R. / Bess Jr., J.W. / South, T.L. / Blake, P.R. / Sagi, I. / Perez-Alvarado, G. / Sowder 3rd., R.C. / Hare, D.R. / Arthur, L.O. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1aaf.cif.gz | 354.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1aaf.ent.gz | 294.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1aaf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1aaf_validation.pdf.gz | 358.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1aaf_full_validation.pdf.gz | 482.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1aaf_validation.xml.gz | 19 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1aaf_validation.cif.gz | 31 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aa/1aaf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aa/1aaf | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6468.604 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) 属: Lentivirus / 株: M/B_MN / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P05961 |
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#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
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-解析
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 20 |
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