ChemComp-8YF: (2R)-2-[(2S,3R)-1,3-bis(oxidanyl)-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-4-(...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 8YF
• 名称: 名称: (2R)-2-[(2S,3R)-1,3-bis(oxidanyl)-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-4-(2-methanimidamidoethylsulfanyl)-2,3-dihydro-1H-pyrrole; 別称: Imipenem, hydrolyzed form; 日化辞名称: (5R)-3-[[2-[(イミノメチル)アミノ]エチル]チオ]-5α-[(1S,2R)-1-カルボキシ-2-ヒドロキシ(以下略)
• コメント: 抗生剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₉N₃O₅S / 原子数: 40 / 化学式量: 317.361 / 形式電荷: 0

その他

5ypi

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 8YF / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5YPI

履歴

作成	2017年11月8日
公開	2018年2月21日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: C[CH](O)[CH]([CH]1CC(=C(N1)C(O)=O)SCCNC=N)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: CC(C(C1CC(=C(N1)C(=O)O)SCCNC=N)C(=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@@H](O)[C@H]([C@H]1CC(=C(N1)C(O)=O)SCCNC=N)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [H]/N=C/NCCSC1=C(N[C@H](C1)[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H19N3O5S/c1-6(16)9(11(17)18)7-4-8(10(15-7)12(19)20)21-3-2-14-5-13/h5-7,9,15-16H,2-4H2,1H3,(H2,13,14)(H,17,18)(H,19,20)/t6-,7-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KSLAOLVLEKIZMQ-ZXFLCMHBSA-N

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-5ypi:
Crystal structure of NDM-1 bound to hydrolyzed imipenem representing an EI1 complex

PDB-6rzr:
Structure of IMP-13 metallo-beta-lactamase complexed with hydrolysed imipenem

PDB-6xj8:
KPC-2 N170A mutant bound to hydrolyzed imipenem at 2.05 A

PDB-7lnl:
Crystal structure of KPC-2 S70G/T215P mutant with hydrolyzed imipenem

PDB-7lr9:
Crystal structure of KPC-2 S70G/T215P mutant with hydrolyzed imipenem

PDB-8qnz:
OXA-48 with carbamylated Lys73 in complex with hydrolysed Imipenem and bromide ion competing for binding with Arg250 at neutral pH