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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7qj8 | |||||||||
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タイトル | Structure of recombinant human gamma-Tubulin Ring Complex 12-spoked assembly intermediate (spokes 3-14, substoichiometric spokes 1-2) | |||||||||
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![]() | CYTOSOLIC PROTEIN / Assembly / Intermediate / Complex | |||||||||
機能・相同性 | ![]() microtubule nucleation by interphase microtubule organizing center / gamma-tubulin complex localization / equatorial microtubule organizing center / mitotic spindle microtubule / gamma-tubulin ring complex / interphase microtubule organizing center / polar microtubule / gamma-tubulin complex / meiotic spindle organization / microtubule nucleation ...microtubule nucleation by interphase microtubule organizing center / gamma-tubulin complex localization / equatorial microtubule organizing center / mitotic spindle microtubule / gamma-tubulin ring complex / interphase microtubule organizing center / polar microtubule / gamma-tubulin complex / meiotic spindle organization / microtubule nucleation / gamma-tubulin binding / non-motile cilium / microtubule organizing center / pericentriolar material / cytoplasmic microtubule / cell leading edge / mitotic sister chromatid segregation / mitotic spindle assembly / single fertilization / spindle assembly / cytoplasmic microtubule organization / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / centriole / AURKA Activation by TPX2 / mitotic spindle organization / ciliary basal body / condensed nuclear chromosome / meiotic cell cycle / neuron migration / brain development / recycling endosome / structural constituent of cytoskeleton / spindle pole / microtubule cytoskeleton organization / spindle / microtubule cytoskeleton / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / apical part of cell / mitotic cell cycle / microtubule binding / protein-containing complex assembly / microtubule / neuron projection / centrosome / GTP binding / structural molecule activity / nucleoplasm / identical protein binding / membrane / nucleus / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 8.7 Å | |||||||||
![]() | Zupa, E. / Pfeffer, S. | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Modular assembly of the principal microtubule nucleator γ-TuRC. 著者: Martin Würtz / Erik Zupa / Enrico S Atorino / Annett Neuner / Anna Böhler / Ariani S Rahadian / Bram J A Vermeulen / Giulia Tonon / Sebastian Eustermann / Elmar Schiebel / Stefan Pfeffer / ![]() 要旨: The gamma-tubulin ring complex (γ-TuRC) is the principal microtubule nucleation template in vertebrates. Recent cryo-EM reconstructions visualized the intricate quaternary structure of the γ-TuRC, ...The gamma-tubulin ring complex (γ-TuRC) is the principal microtubule nucleation template in vertebrates. Recent cryo-EM reconstructions visualized the intricate quaternary structure of the γ-TuRC, containing more than thirty subunits, raising fundamental questions about γ-TuRC assembly and the role of actin as an integral part of the complex. Here, we reveal the structural mechanism underlying modular γ-TuRC assembly and identify a functional role of actin in microtubule nucleation. During γ-TuRC assembly, a GCP6-stabilized core comprising GCP2-3-4-5-4-6 is expanded by stepwise recruitment, selective stabilization and conformational locking of four pre-formed GCP2-GCP3 units. Formation of the lumenal bridge specifies incorporation of the terminal GCP2-GCP3 unit and thereby leads to closure of the γ-TuRC ring in a left-handed spiral configuration. Actin incorporation into the complex is not relevant for γ-TuRC assembly and structural integrity, but determines γ-TuRC geometry and is required for efficient microtubule nucleation and mitotic chromosome alignment in vivo. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 2.4 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 表示 | ![]() | |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 14013MC ![]() 7qj0C ![]() 7qj1C ![]() 7qj2C ![]() 7qj3C ![]() 7qj4C ![]() 7qj5C ![]() 7qj6C ![]() 7qj7C ![]() 7qj9C ![]() 7qjaC ![]() 7qjbC ![]() 7qjcC ![]() 7qjdC ![]() 7qjeC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-Gamma-tubulin complex component ... , 5種, 17分子 lJaDFHNhjCEGMIKLc
#1: タンパク質 | 分子量: 118467.547 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q96RT8 #5: タンパク質 | 分子量: 103710.102 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q96CW5 #6: タンパク質 | 分子量: 102666.953 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q9BSJ2 #7: タンパク質 | 分子量: 76179.969 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q9UGJ1 #8: タンパク質 | 分子量: 200733.641 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q96RT7 |
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-タンパク質 , 3種, 18分子 12QRSTUVWXYZebikmd
#2: タンパク質 | 分子量: 51227.770 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: P23258 #3: タンパク質 | | 分子量: 41782.660 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: A0A6I9HGD1 #4: タンパク質 | 分子量: 8485.724 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: Q08AG7 |
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-非ポリマー , 1種, 6分子 ![](data/chem/img/HOH.gif)
#9: 水 | ChemComp-HOH / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Recombinant human Gamma-Tubulin Ring Complex / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#8 / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 2.0 MDa / 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
試料支持 | グリッドの材料: COPPER / グリッドのサイズ: 200 divisions/in. / グリッドのタイプ: Quantifoil R2/1 |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2500 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 2000 nm / Cs: 2.7 mm |
撮影 | 電子線照射量: 35 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 6127 |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
粒子像の選択 | 選択した粒子像数: 436887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 8.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 5443 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | プロトコル: FLEXIBLE FIT / 空間: REAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | 3D fitting-ID: 1 / Source name: PDB / タイプ: experimental model
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