ChemComp-759: (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophe...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 759
名称	名称: (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy] ...名称: (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: 759

名称

名称: (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy] ...

組成

組成式: C₄₉H₆₂ClN₉O₈S₂ / 原子数: 131 / 化学式量: 1004.655 / 形式電荷: 0

その他

5t35

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 759 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5T35

履歴

作成	2016年8月26日
公開	2017年3月8日

外部リンク

UniChem /

ChemSpider /

PubChem /

Wikipedia search /

Google search

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
SMILES

CACTVS 3.385	CC1=C(SCN1)c2ccc(CNC(=O)[CH]3C[CH](O)CN3C(=O)[CH](NC(=O)COCCOCCOCCNC(=O)C[CH]4N=C(c5ccc(Cl)cc5)c6c(C)c(C)sc6n7c(C)nnc47)C(C)(C)C)cc2
OpenEye OEToolkits 2.0.5	Cc1c(sc-2c1C(=NC(c3n2c(nn3)C)CC(=O)NCCOCCOCCOCC(=O)NC(C(=O)N4CC(CC4C(=O)NCc5ccc(cc5)C6=C(NCS6)C)O)C(C)(C)C)c7ccc(cc7)Cl)C

-
SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	CC1=C(SCN1)c2ccc(CNC(=O)[C@@H]3C[C@@H](O)CN3C(=O)[C@@H](NC(=O)COCCOCCOCCNC(=O)C[C@@H]4N=C(c5ccc(Cl)cc5)c6c(C)c(C)sc6n7c(C)nnc47)C(C)(C)C)cc2
OpenEye OEToolkits 2.0.5	Cc1c(sc-2c1C(=N[C@H](c3n2c(nn3)C)CC(=O)NCCOCCOCCOCC(=O)N[C@H](C(=O)N4C[C@@H](C[C@H]4C(=O)NCc5ccc(cc5)C6=C(NCS6)C)O)C(C)(C)C)c7ccc(cc7)Cl)C

-
InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C49H62ClN9O8S2/c1-28-30(3)69-48-41(28)42(33-12-14-35(50)15-13-33)54-37(45-57-56-31(4)59(45)48)23-39(61)51-16-17-65-18-19-66-20-21-67-26-40(62)55-44(49(5,6)7)47(64)58-25-36(60)22-38(58)46(63)52-24-32-8-10-34(11-9-32)43-29(2)53-27-68-43/h8-15,36-38,44,53,60H,16-27H2,1-7H3,(H,51,61)(H,52,63)(H,55,62)/t36-,37+,38+,44-/m1/s1

-
InChIKey

InChI 1.03	HJITZUXCPZGZPX-PYNGZGNASA-N

-
SYSTEMATIC NAME

OpenEye OEToolkits 2.0.5	(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide

全4件を表示しています

PDB-5t35:
The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB

PDB-8r5h:
Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2

PDB-8rwz:
Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL

PDB-8rx0:
(NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
SYSTEMATIC NAME

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-Chemical information

-構造の表示

-詳細

-SMILES

-SMILES CANONICAL

-InChI

-InChIKey

-SYSTEMATIC NAME

-PDBエントリ

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
SYSTEMATIC NAME

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)