ChemComp-6WI: 3-(guanosine-5'-diphospho)-D-glycerate

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 6WI
• 名称: 名称: 3-(guanosine-5'-diphospho)-D-glycerate; 別称: 3GPPG; (2~{R})-3-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-oxidanyl-propanoic acid

Chemical information

組成

組成式: C₁₃H₁₉N₅O₁₄P₂ / 原子数: 53 / 化学式量: 531.263 / 形式電荷: 0

その他

7p97

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 6WI / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7P97

履歴

作成	2021年8月4日
Modify atom id	2021年8月26日
公開	2022年2月2日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH](O)C(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC(C(=O)O)O)O)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@@H](O)C(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@H](C(=O)O)O)O)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C13H19N5O14P2/c14-13-16-9-6(10(22)17-13)15-3-18(9)11-8(21)7(20)5(31-11)2-30-34(27,28)32-33(25,26)29-1-4(19)12(23)24/h3-5,7-8,11,19-21H,1-2H2,(H,23,24)(H,25,26)(H,27,28)(H3,14,16,17,22)/t4-,5-,7-,8-,11-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: UBONPDGCIQEDRL-QWEIRQIHSA-N

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-7p97:
Structure of 3-phospho-D-glycerate guanylyltransferase with product 3-GPPG bound