ChemComp-6S8: (~{Z})-~{N}-[(~{E},2~{S},3~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R}...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 6S8
• 名称: 名称: (~{Z})-~{N}-[(~{E},2~{S},3~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-octadec-4-en-2-yl]octadec-9-enamide; 別称: N-(9Z-octadecenoyl)-1-beta-galactosyl-sphing-4-enine

Chemical information

組成

組成式: C₄₂H₇₉NO₈ / 原子数: 130 / 化学式量: 726.079 / 形式電荷: 0

その他

5kdi

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 6S8 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5KDI

履歴

作成	2016年6月13日
公開	2017年12月13日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / SwissLipids / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: CCCCCCCCCCCCCC=C[CH](O)[CH](CO[CH]1O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]1O)NC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 2.0.5: CCCCCCCCCCCCCC=CC(C(COC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O)NC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CCCCCCCCCCCCC/C=C/[C@@H](O)[C@H](CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O)NC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 2.0.5: CCCCCCCCCCCCC/C=C/[C@H]([C@H](CO[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)NC(=O)CCCCCCC/C=C\CCCCCCCC)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C42H79NO8/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-20-22-24-26-28-30-32-38(46)43-35(34-50-42-41(49)40(48)39(47)37(33-44)51-42)36(45)31-29-27-25-23-21-19-16-14-12-10-8-6-4-2/h17-18,29,31,35-37,39-42,44-45,47-49H,3-16,19-28,30,32-34H2,1-2H3,(H,43,46)/b18-17-,31-29+/t35-,36+,37+,39-,40-,41+,42+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MVGFIPNJBNBHNC-VTRIZHIOSA-N

PDBエントリ

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PDB-5kdi:
How FAPP2 Selects Simple Glycosphingolipids Using the GLTP-fold