登録情報 データベース : PDB / ID : 6q0z 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of Danio rerio histone deacetylase 6 catalytic domain 2 complexed with JS28 要素Hdac6 protein 詳細 キーワード HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / Histone deacetylase / metallohydrolase / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation ... Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation / epigenetic regulation of gene expression / angiogenesis / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / Histone deacetylase domain / Arginase; Chain A / : / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily ... Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / Histone deacetylase domain / Arginase; Chain A / : / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 : / Chem-P7V / Hdac6 protein / Histone deacetylase 6 類似検索 - 構成要素生物種 Danio rerio (ゼブラフィッシュ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.75 Å 詳細データ登録者 Osko, J.D. / Christianson, D.W. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI) GM49758 米国
引用ジャーナル : J.Med.Chem. / 年 : 2020タイトル : Exploring Structural Determinants of Inhibitor Affinity and Selectivity in Complexes with Histone Deacetylase 6.著者 : Osko, J.D. / Porter, N.J. / Narayana Reddy, P.A. / Xiao, Y.C. / Rokka, J. / Jung, M. / Hooker, J.M. / Salvino, J.M. / Christianson, D.W. 履歴 登録 2019年8月2日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2020年2月5日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2023年10月11日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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