ChemComp-6D6: 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxya...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 6D6
• 名称: 名称: 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine; 日化辞名称: (S)-2-アミノ-4-(5′-アデノシル3-アミノプロピルアミノ)ブタン酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₈N₈O₅ / 原子数: 58 / 化学式量: 424.455 / 形式電荷: 0

その他

5isg

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 6D6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5ISG

履歴

作成	2016年3月16日
公開	2017年3月15日
Modify leaving atom flag	2021年8月26日
Modify backbone	2023年11月3日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / BindingDB / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: C(CCN(CCC(C(O)=O)N)CC1C(O)C(C(O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)N
• CACTVS 3.385: NCCCN(CC[CH](N)C(O)=O)C[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)CN(CCCN)CCC(C(=O)O)N)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NCCCN(CC[C@H](N)C(O)=O)C[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CN(CCCN)CC[C@@H](C(=O)O)N)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H28N8O5/c18-3-1-4-24(5-2-9(19)17(28)29)6-10-12(26)13(27)16(30-10)25-8-23-11-14(20)21-7-22-15(11)25/h7-10,12-13,16,26-27H,1-6,18-19H2,(H,28,29)(H2,20,21,22)/t9-,10+,12+,13+,16+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NHAKJKNYYCYZBR-UOYPZJKHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](3-aminopropyl)amino}-5'-deoxyadenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-5isg:
Crystal structure of mouse CARM1 in complex with inhibitor SA0707

PDB-7p8q:
Structure of E.coli RlmJ in complex with an RNA conjugate (GA-SAM)

PDB-7p9i:
Structure of E.coli RlmJ in complex with an RNA conjugate (GAA-SAM)

PDB-8cnc:
Structure of compound 1 bound KMT9