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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ahv | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of helical ANTH and ENTH tubules on PI(4,5)P2-containing membranes | |||||||||
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![]() | CLATHRIN-BINDING PROTEIN / CLATHRIN BINDING PROTEIN / ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / actin cortical patch assembly / clathrin vesicle coat / clathrin light chain binding / negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation / actin cortical patch / incipient cellular bud site / cellular bud tip / clathrin coat assembly / clathrin adaptor activity ...Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / actin cortical patch assembly / clathrin vesicle coat / clathrin light chain binding / negative regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation / actin cortical patch / incipient cellular bud site / cellular bud tip / clathrin coat assembly / clathrin adaptor activity / cellular bud neck / mating projection tip / phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding / phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Skruzny, M. / Desfosses, A. / Prinz, S. / Dodonova, S.O. / Gieras, A. / Uetrecht, C. / Jakobi, A.J. / Abella, M. / Hagen, W.J.H. / Schulz, J. ...Skruzny, M. / Desfosses, A. / Prinz, S. / Dodonova, S.O. / Gieras, A. / Uetrecht, C. / Jakobi, A.J. / Abella, M. / Hagen, W.J.H. / Schulz, J. / Meijers, R. / Rybin, V. / Briggs, J.A.G. / Sachse, C. / Kaksonen, M. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: An organized co-assembly of clathrin adaptors is essential for endocytosis. 著者: Michal Skruzny / Ambroise Desfosses / Simone Prinz / Svetlana O Dodonova / Anna Gieras / Charlotte Uetrecht / Arjen J Jakobi / Marc Abella / Wim J H Hagen / Joachim Schulz / Rob Meijers / ...著者: Michal Skruzny / Ambroise Desfosses / Simone Prinz / Svetlana O Dodonova / Anna Gieras / Charlotte Uetrecht / Arjen J Jakobi / Marc Abella / Wim J H Hagen / Joachim Schulz / Rob Meijers / Vladimir Rybin / John A G Briggs / Carsten Sachse / Marko Kaksonen / ![]() 要旨: Clathrin-mediated endocytosis, the main trafficking route from the plasma membrane to the cytoplasm, is critical to many fundamental cellular processes. Clathrin, coupled to the membrane by adaptor ...Clathrin-mediated endocytosis, the main trafficking route from the plasma membrane to the cytoplasm, is critical to many fundamental cellular processes. Clathrin, coupled to the membrane by adaptor proteins, is thought to play a major structural role in endocytosis by self-assembling into a cage-like lattice around the forming vesicle. Although clathrin adaptors are essential for endocytosis, little is known about their structural role in this process. Here we show that the membrane-binding domains of two conserved clathrin adaptors, Sla2 and Ent1, co-assemble in a PI(4,5)P2-dependent manner to form organized lattices on membranes. We determined the structure of the co-assembled lattice by electron cryo-microscopy and designed mutations that specifically impair the lattice formation in vitro. We show that these mutations block endocytosis in vivo. We suggest that clathrin adaptors not only link the polymerized clathrin to the membrane but also form an oligomeric structure, which is essential for membrane remodeling during endocytosis. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 144.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 116.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 78
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18005.471 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 5-272 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() プラスミド: PETM30 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 30700.961 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 1-154 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() プラスミド: PETM30 / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: FILAMENT / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: ANTH AND ENTH DOMAINS OF THE CLATHRIN ADAPTORS SLA2 AND ENT1, RESPECTIVELY タイプ: ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT |
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緩衝液 | 名称: 20 MM HEPES, PH 7.5, 100 MM KCL / pH: 7.5 / 詳細: 20 MM HEPES, PH 7.5, 100 MM KCL |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
試料支持 | 詳細: HOLEY CARBON |
急速凍結![]() | 装置: HOMEMADE PLUNGER / 凍結剤: ETHANE 詳細: VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 80, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- , APPLIED ON C-FLAT HOLEY CARBON COATED GRIDS (PROTOCHIPS) AND VITRIFIED, |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS / 日付: 2013年3月1日 |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() ![]() |
撮影 | 電子線照射量: 10 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN ULTRASCAN 4000 (4k x 4k) |
画像スキャン | デジタル画像の数: 1419 |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正![]() | 詳細: EACH PARTICLE | |||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 13.6 Å / 粒子像の数: 457344 / ピクセルサイズ(公称値): 1.78 Å / ピクセルサイズ(実測値): 1.78 Å 詳細: SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-2896. (DEPOSITION ID: 13053). 対称性のタイプ: HELICAL | |||||||||||||||
原子モデル構築 | プロトコル: FLEXIBLE FIT / 空間: REAL 詳細: METHOD--FLEXIBLE REFINEMENT PROTOCOL--HOMOLOGY MODEL | |||||||||||||||
原子モデル構築 | PDB-ID: 1H0A | |||||||||||||||
精密化 | 最高解像度: 13.6 Å | |||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 13.6 Å
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