PDB-5ufx: Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain in Complex with OP1074

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ufx

タイトル

Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain in Complex with OP1074

要素

Estrogen receptor

キーワード

TRANSCRIPTION / Breast Cancer / Estrogen / Steroid / Acquired Resistance

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of epithelial cell apoptotic process / antral ovarian follicle growth / G protein-coupled estrogen receptor activity / regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis / RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling / RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription / regulation of toll-like receptor signaling pathway / prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis / nuclear estrogen receptor activity / epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation ...regulation of epithelial cell apoptotic process / antral ovarian follicle growth / G protein-coupled estrogen receptor activity / regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis / RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling / RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription / regulation of toll-like receptor signaling pathway / prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis / nuclear estrogen receptor activity / epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation / epithelial cell development / prostate epithelial cord elongation / negative regulation of smooth muscle cell apoptotic process / mammary gland branching involved in pregnancy / uterus development / vagina development / TFIIB-class transcription factor binding / androgen metabolic process / steroid hormone receptor signaling pathway / mammary gland alveolus development / estrogen receptor signaling pathway / cellular response to estrogen stimulus / estrogen response element binding / : / nuclear receptor-mediated steroid hormone signaling pathway / negative regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / Nuclear signaling by ERBB4 / RNA polymerase II preinitiation complex assembly / protein localization to chromatin / 14-3-3 protein binding / TBP-class protein binding / nitric-oxide synthase regulator activity / steroid binding / TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors / ESR-mediated signaling / transcription corepressor binding / negative regulation of miRNA transcription / positive regulation of nitric-oxide synthase activity / cellular response to estradiol stimulus / transcription coregulator binding / stem cell differentiation / nuclear estrogen receptor binding / SUMOylation of intracellular receptors / euchromatin / negative regulation of DNA-binding transcription factor activity / beta-catenin binding / transcription coactivator binding / positive regulation of DNA-binding transcription factor activity / Nuclear Receptor transcription pathway / response to estrogen / Regulation of RUNX2 expression and activity / Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer / nuclear receptor activity / male gonad development / positive regulation of nitric oxide biosynthetic process / sequence-specific double-stranded DNA binding / positive regulation of fibroblast proliferation / Ovarian tumor domain proteases / PIP3 activates AKT signaling / response to estradiol / phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / ATPase binding / regulation of inflammatory response / fibroblast proliferation / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling / DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific / Estrogen-dependent gene expression / transcription regulator complex / Extra-nuclear estrogen signaling / calmodulin binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / chromatin remodeling / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of gene expression / chromatin binding / regulation of DNA-templated transcription / chromatin / regulation of transcription by RNA polymerase II / protein kinase binding / positive regulation of DNA-templated transcription / Golgi apparatus / enzyme binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / signal transduction / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / protein-containing complex / zinc ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / membrane / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.5503 Å

データ登録者

Fanning, S.W. / Hodges-Gallagher, L. / Myles, D.C. / Sun, R. / Fowler, C.E. / Green, B.D. / Harmon, C.L. / Greene, G.L. / Kushner, P.J.

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2018
タイトル: Specific stereochemistry of OP-1074 disrupts estrogen receptor alpha helix 12 and confers pure antiestrogenic activity.
著者: Fanning, S.W. / Hodges-Gallagher, L. / Myles, D.C. / Sun, R. / Fowler, C.E. / Plant, I.N. / Green, B.D. / Harmon, C.L. / Greene, G.L. / Kushner, P.J.

履歴

登録	2017年1月6日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年1月10日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年6月27日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2023年10月4日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ufx.cif.gz	216.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ufx.ent.gz	173.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ufx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5ufx_validation.pdf.gz	963.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5ufx_full_validation.pdf.gz	973.6 KB	表示
XML形式データ	5ufx_validation.xml.gz	26.6 KB	表示
CIF形式データ	5ufx_validation.cif.gz	39.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uf/5ufx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uf/5ufx	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5ufwC 6c42C 5accS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6c42-d 6vjd-2 5ufw-d 6vgh-d 6vpf-1 7kbs-d 5ex3-d 6df6-2 6vmu-1 5ex0-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#45 - 2003年9月エストロゲン受容体 (Estrogen Receptor) 類似性 (11) #126 - 2010年6月上皮成長因子 (Epidermal Growth Factor) 類似性 (1) #267 - 2022年3月血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF) 類似性 (1) #43 - 2003年7月 Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase) 類似性 (1) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#45 - 2003年9月
エストロゲン受容体 (Estrogen Receptor)
類似性 (11)
#126 - 2010年6月
上皮成長因子 (Epidermal Growth Factor)
類似性 (1)
#267 - 2022年3月
血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF)
類似性 (1)
#43 - 2003年7月
Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase)
類似性 (1)
#60 - 2004年12月
ユビキチン (Ubiquitin)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Estrogen receptor

B: Estrogen receptor

ヘテロ分子

57.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	102.722, 58.015, 87.834
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 102.89, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-1046- HOH

#1: タンパク質	Estrogen receptor / ER / ER-alpha / Estradiol receptor / Nuclear receptor subfamily 3 group A member 1 分子量: 28355.207 Da / 分子数: 2 / 変異: C381S, C417S, C530S, L536S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ESR1, ESR, NR3A1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P03372
#2: 化合物	ChemComp-86Y / (2S)-3-(4-hydroxyphenyl)-4-methyl-2-(4-{2-[(3R)-3-methylpyrrolidin-1-yl]ethoxy}phenyl)-2H-1-benzopyran-7-ol 分子量: 457.561 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₉H₃₁NO₄
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 616 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.25 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.43 %
結晶化	温度: 298.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 10% PEG 3,350, Bis-Tris pH 6.2, 200 mM MgCl2

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-BM / 波長: 0.97 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2016年6月15日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.55→20 Å / Num. obs: 70195 / % possible obs: 96.2 % / 冗長度: 3.6 % / Net I/σ(I): 8.07
反射シェル	解像度: 1.55→1.58 Å / 冗長度: 3.2 % / R_merge(I) obs: 0.53 / Mean I/σ(I) obs: 15.18 / CC_1/2: 0.75 / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
PHENIX	1.9_1692	データ削減
PHENIX	1.9_1692	データスケーリング
PHENIX	1.9_1692	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5ACC

5acc

解像度: 1.5503→19.988 Å / SU ML: 0.16 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 21.83

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2299	3441	5 %
R_work	0.1952	-	-
obs	0.1969	68880	94.24 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.5503→19.988 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3657	0	68	616	4341

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	3889
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.121	5282
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.586	1430
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.042	618
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	654

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.5503-1.5716	0.2769	96	0.2399	2033	X-RAY DIFFRACTION	74
1.5716-1.594	0.2534	138	0.2261	2496	X-RAY DIFFRACTION	90
1.594-1.6178	0.2718	134	0.2326	2696	X-RAY DIFFRACTION	97
1.6178-1.643	0.2359	143	0.2149	2732	X-RAY DIFFRACTION	99
1.643-1.67	0.2642	140	0.2078	2749	X-RAY DIFFRACTION	100
1.67-1.6988	0.2473	148	0.2038	2763	X-RAY DIFFRACTION	100
1.6988-1.7296	0.2252	143	0.1938	2780	X-RAY DIFFRACTION	100
1.7296-1.7629	0.2235	129	0.1964	2776	X-RAY DIFFRACTION	100
1.7629-1.7988	0.2166	137	0.1945	2779	X-RAY DIFFRACTION	100
1.7988-1.8379	0.1974	140	0.194	2783	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8379-1.8806	0.2925	143	0.2446	2735	X-RAY DIFFRACTION	99
1.8806-1.9276	0.5103	157	0.4453	2588	X-RAY DIFFRACTION	94
1.9276-1.9797	0.4433	136	0.3226	2693	X-RAY DIFFRACTION	96
1.9797-2.0379	0.2308	155	0.194	2745	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0379-2.1036	0.2112	155	0.1758	2793	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1036-2.1787	0.2002	138	0.1698	2762	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1787-2.2658	0.2434	73	0.2104	1282	X-RAY DIFFRACTION	50
2.2658-2.3688	0.1996	123	0.1816	2381	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3688-2.4935	0.2274	140	0.1757	2779	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4935-2.6494	0.2375	135	0.1812	2808	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6494-2.8534	0.2152	183	0.1805	2751	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8534-3.1396	0.2097	135	0.1754	2813	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1396-3.5916	0.1943	150	0.1663	2742	X-RAY DIFFRACTION	98
3.5916-4.5164	0.1708	112	0.1467	2155	X-RAY DIFFRACTION	76
4.5164-19.9901	0.1791	158	0.1676	2825	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.09	3.4331	-2.0119	5.4501	-1.3703	2.8958	-0.1549	0.4069	0.5621	-0.2736	0.196	0.1883	-0.3451	-0.0992	-0.074	0.3459	0.0151	-0.0516	0.1112	0.0512	0.2396	8.4619	-5.252	17.7484
2	4.1181	1.3927	-2.4966	3.8333	-2.0531	4.6392	0.0043	-0.1154	0.0943	0.1561	0.1	0.4277	0.1986	-0.2553	-0.1098	0.1236	0.0537	0.005	0.1325	-0.0072	0.1427	-12.0942	-22.4926	30.3969
3	3.8713	2.6376	-1.9123	3.3419	-1.7462	2.3533	0.0327	0.2151	-0.0483	-0.0328	-0.0548	0.0373	0.0396	-0.0727	0.0257	0.0901	0.0745	-0.0176	0.1116	-0.0077	0.0853	-5.8497	-24.5644	21.3429
4	1.8332	0.3648	-0.5649	0.816	-0.3346	3.1237	-0.0235	0.0156	-0.0739	0.0081	0.0084	-0.0212	0.033	-0.0778	0.0209	0.0688	0.0488	-0.017	0.058	-0.0039	0.083	1.6378	-24.9242	24.9691
5	5.2918	3.815	-0.339	2.7597	-0.3584	2.9484	-0.0213	-0.2705	-0.3186	-0.057	-0.0178	-0.2575	0.2573	0.1749	-0.0173	0.1385	0.0686	-0.0108	0.1269	0.0203	0.1098	7.6961	-27.4669	35.4955
6	1.4664	0.8569	0.803	1.4887	-0.1808	4.5296	-0.0323	0.1397	-0.0126	-0.1353	-0.0141	-0.101	0.0783	0.1597	-0.0193	0.0891	0.0467	-0.0001	0.0986	0.0106	0.1004	11.233	-19.1046	19.7197
7	2.4299	0.9023	1.8615	3.2845	2.5312	8.0936	-0.0446	0.2484	0.2928	-0.1422	0.0502	-0.2044	-0.2767	0.047	0.0086	0.1359	0.0422	-0.012	0.1217	0.0624	0.1566	17.4346	-13.0684	15.0916
8	3.6639	3.0284	0.4282	5.8278	0.7039	1.0407	-0.0096	-0.0833	-0.132	0.0474	-0.0774	-0.0102	0.0566	0.047	0.0867	0.1005	0.0708	-0.0024	0.0906	0.001	0.1074	13.389	-26.2447	26.6265
9	3.224	2.4672	2.484	4.2946	0.2288	3.1179	0.0704	0.4297	-0.4436	0.325	0.16	0.2834	-0.0807	0.0789	-0.1513	0.4305	-0.1083	0.0585	0.47	-0.1917	0.4045	-4.3908	-37.3937	15.6172
10	1.1191	-0.1646	1.1414	1.7232	-1.9631	5.162	-0.0157	0.3261	-0.0512	-0.296	-0.0259	0.1599	0.2408	-0.4889	-0.088	0.2978	-0.1605	-0.0072	0.7278	-0.0524	0.1446	-4.417	-24.6774	5.7134
11	1.9586	-0.0309	0.4671	5.381	0.6985	1.5013	0.0486	0.1107	0.1059	0.017	-0.0139	-0.3893	0.0509	0.1246	-0.0007	0.1156	0.0589	0.0254	0.1982	0.0707	0.2221	38.1239	-37.2879	23.2512
12	3.2318	0.5878	0.9494	6.8266	3.6295	3.5223	0.0695	0.2061	-0.168	-0.1363	-0.1023	-0.0392	0.0763	0.0431	0.0118	0.0857	0.0769	0.0152	0.1414	0.0395	0.1097	31.7987	-44.7742	24.845
13	1.2779	-0.2471	0.4578	1.8523	-0.2535	2.3301	0.0548	-0.0223	0.0504	0.0801	-0.0864	-0.0539	-0.0184	-0.0299	0.0418	0.0977	0.0721	0.0044	0.1098	0.0158	0.1006	27.1287	-36.2836	30.7345
14	1.2691	-0.2729	-0.8914	1.5176	0.1532	0.9856	0.1239	0.5525	-0.1487	-0.5281	-0.2775	0.139	0.0283	-0.2981	0.1933	0.3238	0.2489	0.0471	0.4357	-0.0455	0.15	28.0127	-42.9301	8.1376
15	2.3369	1.232	0.839	5.394	0.4475	2.951	0.1663	0.3213	0.091	-0.7703	-0.2228	0.1482	-0.1513	-0.2572	0.0288	0.2911	0.1855	-0.0074	0.3889	0.0321	0.1403	23.2208	-33.7521	10.5104
16	2.2925	0.5561	0.1963	3.4121	-1.2129	2.2726	0.2074	0.1155	0.4139	-0.1238	-0.1565	-0.1322	-0.1705	-0.0533	-0.0532	0.1391	0.0809	0.0216	0.1392	0.0259	0.1723	27.9085	-27.9471	26.3277
17	3.488	0.7403	-1.1083	6.0478	-3.8774	7.2354	-0.0501	-0.2929	0.3186	0.2827	-0.0502	-0.3163	-0.0656	0.361	0.0543	0.1104	0.0445	-0.0321	0.2017	-0.0023	0.2096	30.0327	-19.5552	30.7656
18	2.0103	2.1873	0.1285	8.7733	-0.4512	0.9162	0.0664	0.1944	-0.0904	-0.1548	-0.0977	-0.0902	0.0327	0.065	0.0289	0.1062	0.0821	0.0104	0.1327	-0.0006	0.0965	20.3441	-29.4084	19.9355
19	8.2549	2.4408	7.7332	5.3169	3.3573	9.4916	0.3935	0.1746	-0.8648	-0.4151	-0.1232	0.2413	1.0262	-0.1545	-0.3525	0.2583	-0.0086	-0.0527	0.2492	-0.0047	0.2645	19.0969	-51.1198	27.439
20	8.4641	0.1673	1.134	7.1122	0.6526	5.1109	0.0852	-0.2809	-0.1339	0.3355	-0.1379	-0.3068	-0.0226	0.3945	0.0653	0.16	0.0317	-0.0012	0.1758	0.0538	0.0764	30.04	-45.9758	39.0069

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 309 through 321 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 322 through 338 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 339 through 363 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 364 through 420 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 421 through 438 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 439 through 465 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 466 through 496 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 497 through 528 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 529 through 536 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 537 through 547 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 306 through 341 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 342 through 363 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 364 through 394 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 395 through 420 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 421 through 438 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 439 through 469 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 470 through 496 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 497 through 528 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'B' and (resid 529 through 536 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'B' and (resid 537 through 547 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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