温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 16 mg/ml protein in 20mM Tris/HCl pH 8.4, 5 mM benzamidine, 0.1 M NaCl, 50 mM CaCl2 mixed 1+1 with 32-35% AMMONIUM SULPHATE, 2% PEG 4000, 0.1 M Bicine-NaOH pH 8.5, 15% glycerol
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.54178 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2008年5月16日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54178 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.85→30.6 Å / Num. obs: 46257 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 1.88 % / Rmerge(I) obs: 0.034 / Rsym value: 0.034 / Net I/σ(I): 16.87
反射 シェル
解像度: 1.85→1.95 Å / 冗長度: 1.88 % / Rmerge(I) obs: 0.228 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / Rsym value: 0.228 / Rejects: 0 / % possible all: 99.2
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
REFMAC
5.4.0067
精密化
PDB_EXTRACT
3.22
データ抽出
DENZO
データ削減
SADABS
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse model 解像度: 1.9→30.1 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.947 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.933 / SU B: 2.466 / SU ML: 0.074 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.114 / ESU R Free: 0.109 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor butyl chain is flexible, has more than one conformation Asn426 not defined by electron density. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2105
2169
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1876
-
-
-
obs
0.1888
40575
99.94 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK