登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ogl |
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タイトル | Structure of bacterial oligosaccharyltransferase PglB in complex with an acceptor peptide and an lipid-linked oligosaccharide analog |
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要素 | - Substrate mimicking peptide
- Undecaprenyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase
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キーワード | MEMBRANE PROTEIN / Oligosaccharyltransferase / Complex / Protein N-glycosylation / Bacteria |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
undecaprenyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase / dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity / protein N-linked glycosylation via asparagine / glycosyltransferase activity / post-translational protein modification / magnesium ion binding / plasma membrane類似検索 - 分子機能 STT3 subunit PglB, C-terminal beta-barrel domain / STT3/PglB C-terminal beta-barrel domain / : / STT3/PglB/AglB core domain / : / Oligosaccharyl transferase, STT3 subunit / Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-9UB / : / Undecaprenyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Campylobacter lari (カンピロバクター)
![](img/tx_bacteria.gif) Campylobacter jejuni (カンピロバクター) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7 Å |
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データ登録者 | Napiorkowska, M. / Boilevin, J. / Sovdat, T. / Darbre, T. / Reymond, J.-L. / Aebi, M. / Locher, K.P. |
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引用 | ジャーナル: Nat. Struct. Mol. Biol. / 年: 2017 タイトル: Molecular basis of lipid-linked oligosaccharide recognition and processing by bacterial oligosaccharyltransferase. 著者: Napiorkowska, M. / Boilevin, J. / Sovdat, T. / Darbre, T. / Reymond, J.L. / Aebi, M. / Locher, K.P. |
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履歴 | 登録 | 2017年7月13日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2017年10月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月1日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2017年12月20日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2024年1月17日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id |
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