登録情報 | データベース: PDB / ID: 5eeg |
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タイトル | Crystal structure of carminomycin-4-O-methyltransferase DnrK in complex with tetrazole-SAH |
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要素 | Carminomycin 4-O-methyltransferase DnrK |
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キーワード | TRANSFERASE / unnatural substrate / Structural Genomics / PSI-Biology / Protein Structure Initiative / Enzyme Discovery for Natural Product Biosynthesis / NatPro |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
carminomycin 4-O-methyltransferase / daunorubicin biosynthetic process / O-methyltransferase activity / methyltransferase activity / methylation類似検索 - 分子機能 Helix Hairpins - #1350 / O-methyltransferase domain / O-methyltransferase domain / SAM-dependent O-methyltransferase class II-type profile. / O-methyltransferase COMT-type / Vaccinia Virus protein VP39 / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain / Helix Hairpins / Arc Repressor Mutant, subunit A / Winged helix DNA-binding domain superfamily ...Helix Hairpins - #1350 / O-methyltransferase domain / O-methyltransferase domain / SAM-dependent O-methyltransferase class II-type profile. / O-methyltransferase COMT-type / Vaccinia Virus protein VP39 / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain / Helix Hairpins / Arc Repressor Mutant, subunit A / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-S8M / Carminomycin 4-O-methyltransferase DnrK類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptomyces peucetius (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.255 Å |
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データ登録者 | Wang, F. / Singh, S. / Thorson, J.S. / Phillips Jr., G.N. / Enzyme Discovery for Natural Product Biosynthesis (NatPro) |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | U01 GM098248 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | R37 AI52188 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2016 タイトル: Functional AdoMet Isosteres Resistant to Classical AdoMet Degradation Pathways. 著者: Huber, T.D. / Wang, F. / Singh, S. / Johnson, B.R. / Zhang, J. / Sunkara, M. / Van Lanen, S.G. / Morris, A.J. / Phillips, G.N. / Thorson, J.S. |
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履歴 | 登録 | 2015年10月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2015年12月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年7月13日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年9月28日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.4 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.5 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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