温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.7 詳細: 1 microL protein solution (2.8 mg/ml protein, 50 mM Tris buffer pH 8, 200 mM sodium chloride, 2 mM dithiothreitol, 1 mM anthraquinone-2,6-disulfonic acid disodium salt, 7.5 mM GTP) and 0.4 ?L ...詳細: 1 microL protein solution (2.8 mg/ml protein, 50 mM Tris buffer pH 8, 200 mM sodium chloride, 2 mM dithiothreitol, 1 mM anthraquinone-2,6-disulfonic acid disodium salt, 7.5 mM GTP) and 0.4 ?L well solution (1.5 M sodium formate, 100 mM sodium citrate buffer pH 4.7, 10 mM dithiothreitol) was suspended over 1 mL of well solution. The crystals were transferred to a soaking solution (3.25 M sodium formate, 100 mM sodium citrate buffer pH 4.7) containing 1 mM small-molecule inhibitor. Crystals were incubated approximately 15 hours t room temperature, and then transferred to a cryo-preservative solution (soaking solution with 25 % v/v glycerol) prior to freezing in liquid nitrogen.
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データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.2 / 波長: 1 Å
検出器
タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2010年4月21日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.55→26.78 Å / Num. all: 7617 / Num. obs: 6918 / % possible obs: 98.5 % / 冗長度: 4.2 % / Biso Wilson estimate: 66.59 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.051 / Net I/av σ(I): 15.7 / Net I/σ(I): 17.1 / Num. measured all: 29301
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. measured all
Num. unique all
% possible all
2.55-2.85
4.2
0.386
4101
975
98
8.06-26.78
4.1
0.025
921
226
96.9
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
autoPROC
データスケーリング
BUSTER-TNT
精密化
PDB_EXTRACT
3.15
データ抽出
精密化
構造決定の手法: フーリエ合成 / 解像度: 2.55→26.78 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.9538 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.9502 / SU R Cruickshank DPI: 0.421 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.391 / SU Rfree Blow DPI: 0.218 / SU Rfree Cruickshank DPI: 0.223