登録情報 | データベース: PDB / ID: 5brd |
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タイトル | Crystal structure of Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor BENZ-GlcN |
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要素 | Glucokinase 1, putative |
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キーワード | Transferase/Transferase Inhibitor / Transferase / Hexose Kinase / Transferase-Transferase Inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
glucokinase / glucokinase activity / D-glucose binding / glycolytic process / ATP binding類似検索 - 分子機能 Glucokinase / Glucokinase / Hexokinase; domain 1 / Hexokinase; domain 1 - #20 / ATPase, nucleotide binding domain / ATPase, nucleotide binding domain / Nucleotidyltransferase; domain 5 / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2-(benzoylamino)-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / Glucokinase 1, putative類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_eukaryote.gif) Trypanosoma cruzi (トリパノソーマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å |
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データ登録者 | D'Antonio, E.L. / Perry, K. / Deinema, M.S. / Kearns, S.P. / Frey, T.A. |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM103499 | 米国 | University of South Carolina Office of the Vice President for Research | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Mol.Biochem.Parasitol. / 年: 2016 タイトル: Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase. 著者: D'Antonio, E.L. / Deinema, M.S. / Kearns, S.P. / Frey, T.A. / Tanghe, S. / Perry, K. / Roy, T.A. / Gracz, H.S. / Rodriguez, A. / D'Antonio, J. |
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履歴 | 登録 | 2015年5月30日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2015年6月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年12月23日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年2月3日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2016年2月10日 | Group: Database references |
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改定 1.4 | 2016年7月20日 | Group: Data collection |
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改定 1.5 | 2017年9月27日 | Group: Advisory / Author supporting evidence ...Advisory / Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: diffrn_detector / pdbx_audit_support ...diffrn_detector / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / software Item: _diffrn_detector.detector / _pdbx_audit_support.funding_organization ..._diffrn_detector.detector / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.classification |
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改定 1.6 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / diffrn_radiation_wavelength / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.type 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年9月27日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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