登録情報 データベース : PDB / ID : 4kh2 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of human alpha-L-iduronidase complex with 2-deoxy-2-fluoro-alpha-L-idopyranosyluronic acid fluoride 要素Alpha-L-iduronidase 詳細 キーワード HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / glycoside hydrolase family 39 / TIM barrel / beta sandwich / fibronectin III domain / glycosaminoglycans / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
L-iduronidase / L-iduronidase activity / disaccharide metabolic process / MPS I - Hurler syndrome / heparin catabolic process / dermatan sulfate catabolic process / glycosaminoglycan catabolic process / CS/DS degradation / heparan sulfate proteoglycan catabolic process / HS-GAG degradation ... L-iduronidase / L-iduronidase activity / disaccharide metabolic process / MPS I - Hurler syndrome / heparin catabolic process / dermatan sulfate catabolic process / glycosaminoglycan catabolic process / CS/DS degradation / heparan sulfate proteoglycan catabolic process / HS-GAG degradation / lysosomal lumen / signaling receptor binding / extracellular exosome 類似検索 - 分子機能 : / Alpha-L-iduronidase C-terminal domain / : / Glycosyl hydrolase domain; family 39 / : / : / Glycosyl hydrolases family 39 active site. / Glycoside hydrolase, family 39 / Glycosyl hydrolases family 39 / Glycosidases ... : / Alpha-L-iduronidase C-terminal domain / : / Glycosyl hydrolase domain; family 39 / : / : / Glycosyl hydrolases family 39 active site. / Glycoside hydrolase, family 39 / Glycosyl hydrolases family 39 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / Immunoglobulins / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2,6-anhydro-5-deoxy-5-fluoro-L-idonic acid / S,R MESO-TARTARIC ACID / L(+)-TARTARIC ACID / Alpha-L-iduronidase 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.36 Å 詳細データ登録者 Bie, H. / Yin, J. / He, X. / Kermode, A.R. / Goddard-Borger, E.D. / Withers, S.G. / James, M.N.G. 引用ジャーナル : Nat.Chem.Biol. / 年 : 2013タイトル : Insights into mucopolysaccharidosis I from the structure and action of alpha-L-iduronidase.著者 : Bie, H. / Yin, J. / He, X. / Kermode, A.R. / Goddard-Borger, E.D. / Withers, S.G. / James, M.N. 履歴 登録 2013年4月29日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2013年9月18日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2013年9月25日 Group : Database references改定 1.2 2013年11月6日 Group : Database references改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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