登録情報 | データベース: PDB / ID: 4e8z |
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タイトル | Crystal Structure of Burkholderia cenocepacia HldA in Complex with an ATP-competitive Inhibitor |
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要素 | D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase |
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キーワード | Transferase/Transferase Inhibitor / LPS-heptose Biosynthesis / Beta-clasp Dimerization Region / PfkB Carbohydrate Kinase / Phosphorylation / Transferase-Transferase Inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor / nucleotidyltransferase activity / kinase activity / carbohydrate metabolic process類似検索 - 分子機能 RfaE bifunctional protein, domain I / Carbohydrate kinase PfkB / pfkB family carbohydrate kinase / Ribokinase / Ribokinase-like / UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-IHC / : / D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Burkholderia cenocepacia (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.05 Å |
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データ登録者 | Lee, T.-W. / Verhey, T.B. / Junop, M.S. |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2013 タイトル: Structural-functional studies of Burkholderia cenocepacia D-glycero-beta-D-manno-heptose 7-phosphate kinase (HldA) and characterization of inhibitors with antibiotic adjuvant and antivirulence properties. 著者: Lee, T.W. / Verhey, T.B. / Antiperovitch, P.A. / Atamanyuk, D. / Desroy, N. / Oliveira, C. / Denis, A. / Gerusz, V. / Drocourt, E. / Loutet, S.A. / Hamad, M.A. / Stanetty, C. / Andres, S.N. / ...著者: Lee, T.W. / Verhey, T.B. / Antiperovitch, P.A. / Atamanyuk, D. / Desroy, N. / Oliveira, C. / Denis, A. / Gerusz, V. / Drocourt, E. / Loutet, S.A. / Hamad, M.A. / Stanetty, C. / Andres, S.N. / Sugiman-Marangos, S. / Kosma, P. / Valvano, M.A. / Moreau, F. / Junop, M.S. |
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履歴 | 登録 | 2012年3月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年12月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年6月26日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2013年8月28日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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