ChemComp-4CC: N-[(2-{[(4-carbamimidoylphenyl)amino]methyl}-1-methyl-1H-benzimid...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 4CC
• 名称: 名称: N-[(2-{[(4-carbamimidoylphenyl)amino]methyl}-1-methyl-1H-benzimidazol-5-yl)carbonyl]-N-pyridin-2-yl-beta-alanine; 日化辞名称: ダビガトラン

Chemical information

組成

組成式: C₂₅H₂₅N₇O₃ / 原子数: 60 / 化学式量: 471.511 / 形式電荷: 0

その他

4yhi

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 4CC / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4YHI

履歴

作成	2015年2月27日
公開	2015年3月11日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: n2(C)c(CNc1ccc(cc1)/C(N)=N)nc3cc(ccc23)C(N(c4ncccc4)CCC(=O)O)=O
• CACTVS 3.385: Cn1c(CNc2ccc(cc2)C(N)=N)nc3cc(ccc13)C(=O)N(CCC(O)=O)c4ccccn4
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: Cn1c2ccc(cc2nc1CNc3ccc(cc3)C(=N)N)C(=O)N(CCC(=O)O)c4ccccn4

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Cn1c(CNc2ccc(cc2)C(N)=N)nc3cc(ccc13)C(=O)N(CCC(O)=O)c4ccccn4
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: [H]/N=C(\c1ccc(cc1)NCc2nc3cc(ccc3n2C)C(=O)N(CCC(=O)O)c4ccccn4)/N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C25H25N7O3/c1-31-20-10-7-17(25(35)32(13-11-23(33)34)21-4-2-3-12-28-21)14-19(20)30-22(31)15-29-18-8-5-16(6-9-18)24(26)27/h2-10,12,14,29H,11,13,15H2,1H3,(H3,26,27)(H,33,34)

InChIKey

• InChI 1.03: YBSJFWOBGCMAKL-UHFFFAOYSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-[(2-{[(4-carbamimidoylphenyl)amino]methyl}-1-methyl-1H-benzimidazol-5-yl)carbonyl]-N-pyridin-2-yl-beta-alanine
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: 3-[[2-[[(4-carbamimidoylphenyl)amino]methyl]-1-methyl-benzimidazol-5-yl]carbonyl-pyridin-2-yl-amino]propanoic acid

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-4jn2:
An Antidote for Dabigatran

PDB-4yhi:
Reversal Agent for Dabigatran

PDB-4yhk:
Reversal Agent for Dabigatran

PDB-4yhm:
Reversal Agent for Dabigatran

PDB-4yho:
Reversal Agent for Dabigatran

PDB-8tqs:
Complex of human thrombin (S195A) bound to a bivalent inhibitor comprised of DNA Aptamer HD22 conjugated to Dabigatran with a linker.