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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Mus musculus Otopetrin 2 (mOTOP2) in pH 5.0 | ||||||||||||
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![]() | Proton channel / Otop2 / Otopetrin / Mus musculus / MEMBRANE PROTEIN | ||||||||||||
機能・相同性 | Otopetrin / Otopetrin / proton channel activity / proton transmembrane transport / membrane / plasma membrane / Proton channel OTOP2![]() | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.06 Å | ||||||||||||
![]() | Gan N / Jiang Y | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural mechanism of proton conduction in otopetrin proton channel 著者: Gan N / Jiang Y | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 80.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.9 KB 12.9 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 10.3 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 30.1 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 70.2 MB 70.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8ug6 M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.83 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_42215_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_42215_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : mOTOP2
全体 | 名称: mOTOP2 |
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要素 |
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-超分子 #1: mOTOP2
超分子 | 名称: mOTOP2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: Proton channel OTOP2
分子 | 名称: Proton channel OTOP2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 62.643996 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MSEELVPHPN ESLPGPRASP REVWKKGGRL LSVLLAVNVL LLACTLISGG AFNKVAVYDT DVFALLTTMM LLAALWIVFY LLRTARCPD AVPYRDAHAG PIWLRGGLVL FGICTLVMDV FKTGYYSSFF ECQSAIKILH PIIQAVFVIV QTYFLWISAK D CIHTHLDL ...文字列: MSEELVPHPN ESLPGPRASP REVWKKGGRL LSVLLAVNVL LLACTLISGG AFNKVAVYDT DVFALLTTMM LLAALWIVFY LLRTARCPD AVPYRDAHAG PIWLRGGLVL FGICTLVMDV FKTGYYSSFF ECQSAIKILH PIIQAVFVIV QTYFLWISAK D CIHTHLDL TRCGLMFTLA TNLAIWMAAV VDESVHQAHS YSGSHGNTSH TRLNPDSKRA GGAAEEDPCL CSTAICQIFQ QG YFYLYPF NIEYSLFAST MLYVMWKNVG RLLASTHGHG HTPSRVSLFR ETFFAGPVLG LLLFVVGLAV FILYEVQVSG ERG HTRQAL VIYYSFNIVC LGLMTLVSLS GSVIYRFDRR AMDHHKNPTR TLDVALLMGA ALGQYAISYY SIVAVVVGSP RDLQ GALNL SHALLMIAQH TFQNVFIIES LHRGPPGAEP REMPPKEPCQ GITFANLDAI RTLPSCPPTP RLVIPNLESP QEAVA IISA PRCHWRRRCL KDISLFLLLC NVILWIMPAF GARPHFSNTV EVDFYGYSLW AAIVNICLPF GIFYRMHAVS SLLEVY VLS UniProtKB: Proton channel OTOP2 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: DIFFRACTION / 最大 デフォーカス(公称値): 2.2 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.9 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |