+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Linker domain of Nexin-dynein regulatory complex from Tetrahymena thermophila | |||||||||
![]() | Primary map | |||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | nexin-dynein regulatory complex / ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() axonemal dynein complex assembly / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Ghanaeian AG / Bui KH | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Integrated modeling of the Nexin-dynein regulatory complex reveals its regulatory mechanism. 著者: Avrin Ghanaeian / Sumita Majhi / Caitlyn L McCafferty / Babak Nami / Corbin S Black / Shun Kai Yang / Thibault Legal / Ophelia Papoulas / Martyna Janowska / Melissa Valente-Paterno / Edward M ...著者: Avrin Ghanaeian / Sumita Majhi / Caitlyn L McCafferty / Babak Nami / Corbin S Black / Shun Kai Yang / Thibault Legal / Ophelia Papoulas / Martyna Janowska / Melissa Valente-Paterno / Edward M Marcotte / Dorota Wloga / Khanh Huy Bui / ![]() ![]() ![]() 要旨: Cilia are hairlike protrusions that project from the surface of eukaryotic cells and play key roles in cell signaling and motility. Ciliary motility is regulated by the conserved nexin-dynein ...Cilia are hairlike protrusions that project from the surface of eukaryotic cells and play key roles in cell signaling and motility. Ciliary motility is regulated by the conserved nexin-dynein regulatory complex (N-DRC), which links adjacent doublet microtubules and regulates and coordinates the activity of outer doublet complexes. Despite its critical role in cilia motility, the assembly and molecular basis of the regulatory mechanism are poorly understood. Here, using cryo-electron microscopy in conjunction with biochemical cross-linking and integrative modeling, we localize 12 DRC subunits in the N-DRC structure of Tetrahymena thermophila. We also find that the CCDC96/113 complex is in close contact with the DRC9/10 in the linker region. In addition, we reveal that the N-DRC is associated with a network of coiled-coil proteins that most likely mediates N-DRC regulatory activity. | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 31.9 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 33.1 KB 33.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 5.4 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() ![]() | 372.5 KB 70.2 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 12.9 MB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() | 9.8 MB 9.8 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8th8MC ![]() 8tekC ![]() 8tidC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | Primary map | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.74 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: half map 1
ファイル | emd_41251_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | half map 1 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: half map 2
ファイル | emd_41251_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | half map 2 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
+全体 : Linker domain of Nexin-dynein regulatory complex from Tetrahymena...
+超分子 #1: Linker domain of Nexin-dynein regulatory complex from Tetrahymena...
+分子 #1: Dynein regulatory complex protein 1/2 N-terminal domain-containin...
+分子 #2: Coiled-coil protein, putative
+分子 #3: LRRC48 protein
+分子 #4: Growth-arrest-specific microtubule-binding protein
+分子 #5: Growth-arrest-specific microtubule-binding protein
+分子 #6: Flagellar associated protein
+分子 #7: Kinase domain protein
+分子 #8: Coiled-coil lobo-like protein, putative
+分子 #9: EF-hand calcium-binding domain protein
+分子 #10: Dynein regulatory complex protein 9
+分子 #11: Dynein regulatory complex protein 10
+分子 #12: AAA family ATPase CDC48 subfamily protein
+分子 #13: DUF4201 domain-containing protein
+分子 #14: Calmodulin 7-2
+分子 #15: Coiled-coil domain-containing protein 153
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
---|---|
![]() | ![]() |
試料の集合状態 | cell |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 45.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |