登録情報 | データベース: PDB / ID: 3pcw |
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タイトル | Endothiapepsin in complex with a fragment |
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要素 | Endothiapepsin |
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase activity / ferulate metabolic process / cinnamic acid catabolic process / ubiquinone biosynthetic process / metal ion binding / plasma membrane / cytosol類似検索 - 分子機能 UbiD decarboxylyase, bacteria / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain / Eukaryotic aspartyl protease / Cathepsin D, subunit A; domain 1 ...UbiD decarboxylyase, bacteria / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain / Eukaryotic aspartyl protease / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Beta Barrel / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 4-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Cryphonectria parasitica (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.25 Å |
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データ登録者 | Koester, H. / Heine, A. / Klebe, G. |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2011 タイトル: A small nonrule of 3 compatible fragment library provides high hit rate of endothiapepsin crystal structures with various fragment chemotypes. 著者: Koster, H. / Craan, T. / Brass, S. / Herhaus, C. / Zentgraf, M. / Neumann, L. / Heine, A. / Klebe, G. |
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履歴 | 登録 | 2010年10月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年10月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年11月2日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2011年11月30日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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