登録情報 データベース : PDB / ID : 3anm 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (DXR) complexed with 5-phenylpyridin-2-ylmethylphosphonic acid 要素1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / reductoisomerase / NADPH binding機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Dxr protein complex / isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway involved in terpenoid biosynthetic process / 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase / 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase activity / isopentenyl diphosphate biosynthetic process, methylerythritol 4-phosphate pathway / NADPH binding / manganese ion binding / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, N-terminal / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, C-terminal / DXP reductoisomerase C-terminal domain / DXP reductoisomerase, C-terminal domain superfamily / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase C-terminal domain / DXP reductoisomerase C-terminal domain / RNA polymerase sigma factor, region 2, helix turn helix motif / Rna Polymerase Sigma Factor; Chain: A ... 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, N-terminal / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, C-terminal / DXP reductoisomerase C-terminal domain / DXP reductoisomerase, C-terminal domain superfamily / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase C-terminal domain / DXP reductoisomerase C-terminal domain / RNA polymerase sigma factor, region 2, helix turn helix motif / Rna Polymerase Sigma Factor; Chain: A / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-NDP / [(5-phenylpyridin-2-yl)methyl]phosphonic acid / 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2 Å 詳細データ登録者 Endo, K. / Kato, M. / Deng, L. / Song, Y. / Yajima, S. 引用ジャーナル : ACS Med Chem Lett / 年 : 2011タイトル : Structures of 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphate Reductoisomerase/Lipophilic Phosphonate Complexes著者 : Deng, L. / Endo, K. / Kato, M. / Cheng, G. / Yajima, S. / Song, Y. 履歴 登録 2010年9月3日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2011年2月23日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年10月19日 Group : Database references改定 1.3 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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