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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Icosahedral Reconstructed map of Car4-bound state AAV9P31 at 1.76 Angstroms | |||||||||
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![]() | Adeno-associated virus != Adeno-associated virus 9 Adeno-associated virus
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![]() | Adeno-associated virus 9P31 / complex / Cryo-EM / VIRUS | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 1.76 Å | |||||||||
![]() | Zhang R / Liu Y / Yu F / Xu G / Li L / Li B / Lou Z | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Icosahedral Reconstructed map of Car4-bound state AAV9P31 at 1.76 Angstroms 著者: Zhang R / Liu Y / Yu F / Xu G / Li L / Li B / Lou Z | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 304.9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 11.7 KB 11.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 59.2 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 259.5 MB 259.5 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1021.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1021.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.8433 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_38672_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_38672_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Adeno-associated virus
全体 | 名称: ![]() ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Adeno-associated virus 9
超分子 | 名称: Adeno-associated virus 9 / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / NCBI-ID: 235455 / 生物種: Adeno-associated virus 9 / Sci species strain: 9P31 / ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: SEROTYPE / ウイルス・エンベロープ: No / ウイルス・中空状態: No |
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宿主 | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.6 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 1.76 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 226745 |
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |