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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | PSII-Pcb Tetramer of Acaryochloris Marina | ||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||||||||
![]() | Shen LL / Gao YZ / Wang WD / Zhang X / Shen JR / Wang PY / Han GY | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of a large photosystem II supercomplex from Acaryochloris marina. 著者: Shen LL / Gao YZ / Wang WD / Zhang X / Shen JR / Wang PY / Han GY | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 40.7 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 37.7 KB 37.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 17 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 86.5 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 421.9 MB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() | 336.4 MB 336.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7ymmMC ![]() 7ymiC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_33933_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_33933_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
+全体 : PSII-Pcb Tetramer of Acaryochloris Marina
+超分子 #1: PSII-Pcb Tetramer of Acaryochloris Marina
+分子 #1: Photosystem II protein D1 2
+分子 #2: Photosystem II CP47 reaction center protein
+分子 #3: Photosystem II CP43 reaction center protein
+分子 #4: Photosystem II D2 protein 1
+分子 #5: Cytochrome b559 subunit alpha
+分子 #6: Photosystem II protein Y
+分子 #7: Photosystem II 10 kDa phosphoprotein PsbH
+分子 #8: Photosystem II protein PsbI
+分子 #9: Photosystem II reaction center protein K
+分子 #10: Photosystem II reaction center protein L
+分子 #11: Photosystem II reaction center protein M
+分子 #12: Photosystem II reaction center protein T
+分子 #13: Photosystem II reaction center X protein
+分子 #14: Photosystem II reaction center protein Ycf12
+分子 #15: Photosystem II reaction center protein Z
+分子 #16: High light inducible protein
+分子 #17: Unknown protein
+分子 #18: High light inducible protein
+分子 #19: High light inducible protein
+分子 #20: High light inducible protein
+分子 #21: CHLOROPHYLL D
+分子 #22: PHEOPHYTIN A
+分子 #23: (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta...
+分子 #24: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
+分子 #25: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
+分子 #26: 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
+分子 #27: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
+分子 #28: FE (II) ION
+分子 #29: BICARBONATE ION
+分子 #30: 2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,...
+分子 #31: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
+分子 #32: (1R,2S)-4-{(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(4S)-4-hydroxy-2,...
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 6.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |