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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-31197 | ||||||||||||||||||
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タイトル | Structure and Activity of SLAC1 Channels for Stomatal Signaling in Leaves | ||||||||||||||||||
![]() | Map used for building. Post-processed from half maps using phenix.auto_sharpen. | ||||||||||||||||||
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機能・相同性 | ![]() response to humidity / stomatal closure / regulation of stomatal opening / voltage-gated monoatomic anion channel activity / regulation of stomatal closure / response to ozone / intracellular monoatomic ion homeostasis / organic anion transport / response to carbon dioxide / response to abscisic acid ...response to humidity / stomatal closure / regulation of stomatal opening / voltage-gated monoatomic anion channel activity / regulation of stomatal closure / response to ozone / intracellular monoatomic ion homeostasis / organic anion transport / response to carbon dioxide / response to abscisic acid / multicellular organismal-level water homeostasis / response to light stimulus / protein phosphatase binding / membrane => GO:0016020 / protein kinase binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / ネガティブ染色法 / 解像度: 2.97 Å | ||||||||||||||||||
![]() | Deng Y / Kashtoh H / Wang Q / Zhen GX / Li QY / Tang L / Gao HL / Zhang CR / Qin L / Su M ...Deng Y / Kashtoh H / Wang Q / Zhen GX / Li QY / Tang L / Gao HL / Zhang CR / Qin L / Su M / Li F / Huang XH / Wang YC / Xie Q / Clarke OB / Hendrickson WA / Chen YH | ||||||||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure and activity of SLAC1 channels for stomatal signaling in leaves. 著者: Ya-Nan Deng / Hamdy Kashtoh / Quan Wang / Guang-Xiao Zhen / Qi-Yu Li / Ling-Hui Tang / Hai-Long Gao / Chun-Rui Zhang / Li Qin / Min Su / Fei Li / Xia-He Huang / Ying-Chun Wang / Qi Xie / ...著者: Ya-Nan Deng / Hamdy Kashtoh / Quan Wang / Guang-Xiao Zhen / Qi-Yu Li / Ling-Hui Tang / Hai-Long Gao / Chun-Rui Zhang / Li Qin / Min Su / Fei Li / Xia-He Huang / Ying-Chun Wang / Qi Xie / Oliver B Clarke / Wayne A Hendrickson / Yu-Hang Chen / ![]() ![]() 要旨: Stomata in leaves regulate gas exchange between the plant and its atmosphere. Various environmental stimuli elicit abscisic acid (ABA); ABA leads to phosphoactivation of slow anion channel 1 (SLAC1); ...Stomata in leaves regulate gas exchange between the plant and its atmosphere. Various environmental stimuli elicit abscisic acid (ABA); ABA leads to phosphoactivation of slow anion channel 1 (SLAC1); SLAC1 activity reduces turgor pressure in aperture-defining guard cells; and stomatal closure ensues. We used electrophysiology for functional characterizations of SLAC1 (SLAC1) and cryoelectron microscopy (cryo-EM) for structural analysis of SLAC1 (SLAC1), at 2.97-Å resolution. We identified 14 phosphorylation sites in SLAC1 and showed nearly 330-fold channel-activity enhancement with 4 to 6 of these phosphorylated. Seven SLAC1-conserved arginines are poised in SLAC1 for regulatory interaction with the N-terminal extension. This SLAC1 structure has its pores closed, in a basal state, spring loaded by phenylalanyl residues in high-energy conformations. SLAC1 phosphorylation fine-tunes an equilibrium between basal and activated SLAC1 trimers, thereby controlling the degree of stomatal opening. | ||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 27.6 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.5 KB 15.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 7 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 56.4 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 30.5 MB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() | 28.4 MB 28.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
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注釈 | Map used for building. Post-processed from half maps using phenix.auto_sharpen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.0475 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map B
ファイル | emd_31197_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map A
ファイル | emd_31197_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Cryo-EM structure of Brachypodium distachyon SLAC1
全体 | 名称: Cryo-EM structure of Brachypodium distachyon SLAC1 |
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要素 |
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-超分子 #1: Cryo-EM structure of Brachypodium distachyon SLAC1
超分子 | 名称: Cryo-EM structure of Brachypodium distachyon SLAC1 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | ネガティブ染色法, クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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染色 | タイプ: NEGATIVE / 材質: Uranyl Acetate |
グリッド | モデル: UltrAuFoil R0.6/1 / 材質: GOLD / メッシュ: 300 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 71.3 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |