ChemComp-2RG: (2S,3R,4S)-4-({(3S,5S)-5-[(3-carboxyphenyl)carbamoyl]pyrrolidin-3...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 2RG
• 名称: 名称: (2S,3R,4S)-4-({(3S,5S)-5-[(3-carboxyphenyl)carbamoyl]pyrrolidin-3-yl}sulfanyl)-2-[(1S,2R)-1-formyl-2-hydroxypropyl]-3-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrole-5-carboxylic acid; 別称: ERTAPENEM, bound form POST-ISOMERIZED
• コメント: 薬剤, 抗生剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₂₂H₂₇N₃O₇S / 原子数: 60 / 化学式量: 477.531 / 形式電荷: 0

その他

3m6h

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 2RG / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3M6H

履歴

作成	2010年4月7日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2012年5月9日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)c1cc(ccc1)NC(=O)C3NCC(SC2C(=NC(C2C)C(C=O)C(O)C)C(=O)O)C3
• CACTVS 3.370: C[CH](O)[CH](C=O)[CH]1N=C([CH](S[CH]2CN[CH](C2)C(=O)Nc3cccc(c3)C(O)=O)[CH]1C)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1C(C(=NC1C(C=O)C(C)O)C(=O)O)SC2CC(NC2)C(=O)Nc3cccc(c3)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: C[C@@H](O)[C@@H](C=O)[C@@H]1N=C([C@@H](S[C@@H]2CN[C@@H](C2)C(=O)Nc3cccc(c3)C(O)=O)[C@@H]1C)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@H]1[C@@H](C(=N[C@H]1[C@H](C=O)[C@@H](C)O)C(=O)O)S[C@H]2C[C@H](NC2)C(=O)Nc3cccc(c3)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C22H27N3O7S/c1-10-17(15(9-26)11(2)27)25-18(22(31)32)19(10)33-14-7-16(23-8-14)20(28)24-13-5-3-4-12(6-13)21(29)30/h3-6,9-11,14-17,19,23,27H,7-8H2,1-2H3,(H,24,28)(H,29,30)(H,31,32)/t10-,11-,14+,15-,16+,17-,19+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RALHTEQYPKBGFO-SAGZMZRGSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2S,3R,4S)-4-({(3S,5S)-5-[(3-carboxyphenyl)carbamoyl]pyrrolidin-3-yl}sulfanyl)-2-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-3-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrole-5-carboxylic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (2S,3R,4S)-4-[(3S,5S)-5-[(3-carboxyphenyl)carbamoyl]pyrrolidin-3-yl]sulfanyl-3-methyl-2-[(2S,3R)-3-oxidanyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-3,4-dihydro-2H-pyrrole-5-carboxylic acid

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-3m6h:
Crystal Structure of Post-isomerized Ertapenem Covalent Adduct with TB B-lactamase

PDB-6iyv:
Crystal sturucture of L,D-transpeptidase LdtMt2 from Mycobacterium tuberculosis in complex with ertapenem adduct

PDB-6lqb:
A third intermediate state of L,D-transpeptidase LdtMt2-ertapenem adduct

PDB-6zrh:
Crystal structure of OXA-10loop24 in complex with ertapenem

PDB-6zrj:
Crystal structure of class D Beta-lactamase OXA-48 in complex with ertapenem