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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lig | ||||||
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タイトル | THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THE LIGAND-BINDING DOMAIN OF THE BACTERIAL ASPARTATE RECEPTOR WITH AND WITHOUT A LIGAND | ||||||
要素 | ASPARTATE RECEPTOR | ||||||
キーワード | CHEMOTAXIS | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 chemotaxis / transmembrane signaling receptor activity / signal transduction / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Kim, S.-H. / Yeh, J.I. / Prive, G.G. / Milburn, M. / Scott, W. / Koshland Junior, D.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1991 タイトル: Three-dimensional structures of the ligand-binding domain of the bacterial aspartate receptor with and without a ligand. 著者: Milburn, M.V. / Prive, G.G. / Milligan, D.L. / Scott, W.G. / Yeh, J. / Jancarik, J. / Koshland Jr., D.E. / Kim, S.H. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1993 タイトル: The Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Domain of a Wild-Type Bacterial Chemotaxis Receptor. Structural Comparison to the Cross-Linked Mutant Forms and Conformational ...タイトル: The Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Domain of a Wild-Type Bacterial Chemotaxis Receptor. Structural Comparison to the Cross-Linked Mutant Forms and Conformational Changes Upon Ligand Binding 著者: Yeh, J.I. / Biemann, H.-P. / Pandit, J. / Koshland, D.E. / Kim, S.-H. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1993 タイトル: Refined Structures of the Ligand-Binding Domain of the Aspartate Receptor from Salmonella Typhimurium 著者: Scott, W.G. / Milligan, D.L. / Milburn, M.V. / Prive, G.G. / Yeh, J. / Koshland Junior, D.E. / Kim, S.-H. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2lig.cif.gz | 69.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2lig.ent.gz | 55.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2lig.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2lig_validation.pdf.gz | 415.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2lig_full_validation.pdf.gz | 434.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2lig_validation.xml.gz | 10.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2lig_validation.cif.gz | 15.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/li/2lig ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/li/2lig | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: PHE B 180 - ASP B 181 OMEGA = 100.60 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18371.432 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P02941 #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-ASP / | #4: 化合物 | ChemComp-PHN / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.32 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.94 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 21 ℃ / pH: 7.4 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.176 / Rfactor obs: 0.176 / 最高解像度: 2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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拘束条件 |
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