THE LIGAND HND FORMS TWO COVALENT BONDS WITH THE DEOXY-GUANINE AT POSITION 7 OF CHAIN A. THIS ...THE LIGAND HND FORMS TWO COVALENT BONDS WITH THE DEOXY-GUANINE AT POSITION 7 OF CHAIN A. THIS LIGAND IS FORMED BY CHEMICAL REACTION OF ANOTHER LIGAND HNE
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
タイプ: 2D 1H-1H NOESY
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試料調製
詳細
内容: 1.0 mM DNA 5'-D(*DGP*DCP*DTP*DAP*DGP*DCP*DGP*DAP*DGP*DTP*DCP*DC)-3', 1.0 mM 5'-D(*DGP*DGP*DAP*DCP*DTP*DAP*DGP*DCP*DTP*DAP*DGP*DC)-3', 1.0 mM (2E,4R)-4-HYDROXYNON-2-ENAL, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料状態
イオン強度: 100 / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 288 K
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz
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解析
NMR software
名称: Amber 開発者: Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollm 分類: 精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: back calculated data agree with experimental NOESY spectrum 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 1