ChemComp-2DR: 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: 2DR
名称	名称: 2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose 別称: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose; 2-deoxy-beta-D-erythro-pentose; 2-deoxy-D-erythro-pentose; 2-deoxy-erythro-pentose 日化辞名称: 2-デオキシ-β-D-リボフラノ-ス

組成

組成式: C₅H₁₀O₄ / 原子数: 19 / 化学式量: 134.13 / 形式電荷: 0

その他

2wnv

タイプ: D-saccharide, beta linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: 2DR / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2WNV

履歴

作成	2009年7月20日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify internal type	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

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ACDLabs 10.04	OCC1OC(O)CC1O
CACTVS 3.352	OC[CH]1O[CH](O)C[CH]1O
OpenEye OEToolkits 1.6.1	C1C(C(OC1O)CO)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.352	OC[C@H]1O[C@@H](O)C[C@@H]1O
OpenEye OEToolkits 1.6.1	C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1O)CO)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C5H10O4/c6-2-4-3(7)1-5(8)9-4/h3-8H,1-2H2/t3-,4+,5+/m0/s1

-
InChIKey

InChI 1.03	PDWIQYODPROSQH-VPENINKCSA-N

-
SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranose
OpenEye OEToolkits 1.6.1	(2R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)oxolane-2,4-diol

全3件を表示しています

PDB-2wnv:
Complex between C1q globular heads and deoxyribose

PDB-9f08:
Nucleoside-2'-deoxyribosyltransferase from Lactobacillus leichmannii. Covalent complex with 2-deoxyribose.

PDB-9f09:
Nucleoside-2'-deoxyribosyltransferase from Lactobacillus leichmannii. Complex with 2-deoxyribose, 7-Bromo-1H-imidazo[4,5-b]pyridine and 2'-deoxycytidine

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