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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2csc | ||||||
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タイトル | Structure of ternary complexes of CITRATE SYNTHASE WITH D-AND L-MALATE: mechanistic implications | ||||||
![]() | CITRATE SYNTHASE | ||||||
![]() | LYASE / OXO-ACID-LYASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() citrate (Si)-synthase / The tricarboxylic acid cycle / citrate synthase activity / citrate (Si)-synthase activity / citrate metabolic process / tricarboxylic acid cycle / carbohydrate metabolic process / mitochondrial matrix / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Karpusas, M. / Holland, D. / Remington, S.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 1.9-A structures of ternary complexes of citrate synthase with D- and L-malate: mechanistic implications. 著者: Karpusas, M. / Holland, D. / Remington, S.J. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure Analysis and Molecular Model of a Complex of Citrate Synthase with Oxaloacetate and S-Acetonyl-Coenzymea 著者: Wiegand, G. / Remington, S. / Deisenhofer, J. / Huber, R. #2: ![]() タイトル: Crystallographic Refinement and Atomic Models of Two Different Forms of Citrate Synthase at 2.7 And 1.7 Angstroms Resolution 著者: Remington, S. / Wiegand, G. / Huber, R. #3: ![]() タイトル: Primary Structure of Porcine Heart Citrate Synthase 著者: Bloxham, D.P. / Parmelee, D.C. / Kumar, S. / Wade, R.D. / Ericsson, L.H. / Neurath, H. / Walsh, K.A. / Titani, K. #4: ![]() タイトル: Crystal Structure Analysis of the Tetragonal Crystal Form and Preliminary Molecular Model of Pig-Heart Citrate Synthase 著者: Wiegand, G. / Kukla, D. / Scholze, H. / Jones, T.A. / Huber, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 98.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 458.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 482.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: SEE REMARK 3. | ||||||||
詳細 | THE MOLECULE IS A DIMER, WITH ONE MONOMER OF MOLECULAR WEIGHT 50000 IN THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT. THE SYMMETRY-RELATED MONOMER CAN BE GENERATED BY THE FOLLOWING CRYSTALLOGRAPHIC TWO-FOLD OPERATION, XS = - XO YS = YO ZS = - ZO WHERE (XO,YO,ZO) ARE THE COORDINATES IN THIS ENTRY AND (XS,YS,ZS) ARE THE SYMMETRY-RELATED SET. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 47322.172 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CMC / |
#3: 化合物 | ChemComp-MLT / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.87 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: referred to 3cts | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / Num. obs: 25075 / Num. measured all: 52144 / Rmerge(I) obs: 0.098 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.7→6 Å / Rfactor obs: 0.189 | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→6 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 6 Å / Rfactor all: 0.189 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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