+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Cryo-EM structure of STING oligomer bound to cGAMP, NVS-STG2 and C53 | |||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||
![]() |
| |||||||||||||||
![]() | STING / ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() STING complex / STAT6-mediated induction of chemokines / protein localization to endoplasmic reticulum / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
![]() | Li J / Canham SM / Zhang X / Bai X / Feng Y | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||||||||
![]() | ![]() タイトル: Activation of human STING by a molecular glue-like compound. 著者: Jie Li / Stephen M Canham / Hua Wu / Martin Henault / Lihao Chen / Guoxun Liu / Yu Chen / Gary Yu / Howard R Miller / Viktor Hornak / Scott M Brittain / Gregory A Michaud / Antonin Tutter / ...著者: Jie Li / Stephen M Canham / Hua Wu / Martin Henault / Lihao Chen / Guoxun Liu / Yu Chen / Gary Yu / Howard R Miller / Viktor Hornak / Scott M Brittain / Gregory A Michaud / Antonin Tutter / Wendy Broom / Mary Ellen Digan / Sarah M McWhirter / Kelsey E Sivick / Helen T Pham / Christine H Chen / George S Tria / Jeffery M McKenna / Markus Schirle / Xiaohong Mao / Thomas B Nicholson / Yuan Wang / Jeremy L Jenkins / Rishi K Jain / John A Tallarico / Sejal J Patel / Lianxing Zheng / Nathan T Ross / Charles Y Cho / Xuewu Zhang / Xiao-Chen Bai / Yan Feng / ![]() 要旨: Stimulator of interferon genes (STING) is a dimeric transmembrane adapter protein that plays a key role in the human innate immune response to infection and has been therapeutically exploited for its ...Stimulator of interferon genes (STING) is a dimeric transmembrane adapter protein that plays a key role in the human innate immune response to infection and has been therapeutically exploited for its antitumor activity. The activation of STING requires its high-order oligomerization, which could be induced by binding of the endogenous ligand, cGAMP, to the cytosolic ligand-binding domain. Here we report the discovery through functional screens of a class of compounds, named NVS-STGs, that activate human STING. Our cryo-EM structures show that NVS-STG2 induces the high-order oligomerization of human STING by binding to a pocket between the transmembrane domains of the neighboring STING dimers, effectively acting as a molecular glue. Our functional assays showed that NVS-STG2 could elicit potent STING-mediated immune responses in cells and antitumor activities in animal models. | |||||||||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 4.5 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 17.8 KB 17.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 7.7 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 100 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 6.1 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 28.4 MB 28.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8flmMC ![]() 8flkC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.08 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_29282_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_29282_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
-全体 : STING tetramer
全体 | 名称: STING tetramer |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: STING tetramer
超分子 | 名称: STING tetramer / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 詳細: STING tetramer, which can further assemblies into larger oligomers, induced by cGAMP, NVS-STG2 and C53 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 300 KDa |
-分子 #1: Stimulator of interferon genes protein
分子 | 名称: Stimulator of interferon genes protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 39.553398 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MPHSSLHPSI PCPRGHGAQK AALVLLSACL VTLWGLGEPP EHTLRYLVLH LASLQLGLLL NGVCSLAEEL RHIHSRYRGS YWRTVRACL GCPLRRGALL LLSIYFYYSL PNAVGPPFTW MLALLGLSQA LNILLGLKGL APAEISAVCE KGNFNVAHGL A WSYYIGYL ...文字列: MPHSSLHPSI PCPRGHGAQK AALVLLSACL VTLWGLGEPP EHTLRYLVLH LASLQLGLLL NGVCSLAEEL RHIHSRYRGS YWRTVRACL GCPLRRGALL LLSIYFYYSL PNAVGPPFTW MLALLGLSQA LNILLGLKGL APAEISAVCE KGNFNVAHGL A WSYYIGYL RLILPELQAR IRTYNQHYNN LLRGAVSQRL YILLPLDCGV PDNLSMADPN IRFLDKLPQQ TGDRAGIKDR VY SNSIYEL LENGQRAGTC VLEYATPLQT LFAMSQYSQA GFSREDRLEQ AKLFCRTLED ILADAPESQN NCRLIAYQEP ADD SSFSLS QEVLRHLRQE EKEEVTVGTS SGLEVLFQ UniProtKB: ![]() |
-分子 #2: 4-({[4-(2-tert-butyl-5,5-dimethyl-1,3-dioxan-2-yl)phenyl]methyl}a...
分子 | 名称: 4-({[4-(2-tert-butyl-5,5-dimethyl-1,3-dioxan-2-yl)phenyl]methyl}amino)-3-methoxybenzoic acid タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 2 / 式: Y6H |
---|---|
分子量 | 理論値: 427.533 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-Y6H: |
-分子 #3: cGAMP
分子 | 名称: cGAMP / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 2 / 式: 1SY |
---|---|
分子量 | 理論値: 674.411 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-1SY: |
-分子 #4: 1-[(2-chloro-6-fluorophenyl)methyl]-3,3-dimethyl-2-oxo-N-[(2,4,6-...
分子 | 名称: 1-[(2-chloro-6-fluorophenyl)methyl]-3,3-dimethyl-2-oxo-N-[(2,4,6-trifluorophenyl)methyl]-2,3-dihydro-1H-indole-6-carboxamide タイプ: ligand / ID: 4 / コピー数: 2 / 式: 9IM |
---|---|
分子量 | 理論値: 490.877 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-9IM: |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
---|---|
![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: NITROGEN |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: EMDB MAP EMDB ID: |
---|---|
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 292483 |
FSC曲線 (解像度の算出)![]() | ![]() |
-原子モデル構築 1
精密化 | 空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL |
---|---|
得られたモデル | ![]() PDB-8flm: |