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- EMDB-26445: 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harring... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-26445
タイトル80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine
マップデータConsensus map by combining local refined maps.
試料
  • 複合体: 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harringtonine
    • RNA: x 6種
    • タンパク質・ペプチド: x 73種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


ribosomal subunit / regulation of G1 to G0 transition / exit from mitosis / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / regulation of translation involved in cellular response to UV / protein-DNA complex disassembly / positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator / optic nerve development / retinal ganglion cell axon guidance / mammalian oogenesis stage ...ribosomal subunit / regulation of G1 to G0 transition / exit from mitosis / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / regulation of translation involved in cellular response to UV / protein-DNA complex disassembly / positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator / optic nerve development / retinal ganglion cell axon guidance / mammalian oogenesis stage / G1 to G0 transition / activation-induced cell death of T cells / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / ubiquitin ligase inhibitor activity / phagocytic cup / 90S preribosome / TOR signaling / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / T cell proliferation involved in immune response / erythrocyte development / cellular response to actinomycin D / negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process / ribosomal small subunit export from nucleus / translation regulator activity / rough endoplasmic reticulum / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / gastrulation / MDM2/MDM4 family protein binding / DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest / cytosolic ribosome / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / rescue of stalled ribosome / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / positive regulation of translation / small-subunit processome / protein kinase C binding / positive regulation of apoptotic signaling pathway / positive regulation of protein-containing complex assembly / placenta development / cellular response to gamma radiation / mRNA 5'-UTR binding / transcription coactivator binding / spindle / cytoplasmic ribonucleoprotein granule / G1/S transition of mitotic cell cycle / rRNA processing / ribosomal small subunit biogenesis / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / rhythmic process / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome binding / glucose homeostasis / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / retina development in camera-type eye / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / T cell differentiation in thymus / cytosolic small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / cell body / cytoplasmic translation / perikaryon / cytosolic large ribosomal subunit / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / tRNA binding / mitochondrial inner membrane / postsynaptic density / cell differentiation / protein stabilization / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / positive regulation of apoptotic process / positive regulation of protein phosphorylation / ribonucleoprotein complex / translation / cell division / DNA repair / mRNA binding / dendrite / ubiquitin protein ligase binding / positive regulation of cell population proliferation / synapse / positive regulation of gene expression / negative regulation of apoptotic process / nucleolus / apoptotic process / protein kinase binding / perinuclear region of cytoplasm / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / endoplasmic reticulum / DNA binding / RNA binding
類似検索 - 分子機能
40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L28e/Mak16 ...40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / : / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / : / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein S19A/S15e / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / Ribosomal protein L36e signature. / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / : / Ribosomal protein S6, eukaryotic / Ribosomal S24e conserved site / Ribosomal protein S24e signature. / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L34e / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal protein L14e domain / Ribosomal protein S4e, N-terminal / Ribosomal protein L35Ae, conserved site / 60S ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L14 / RS4NT (NUC023) domain / Ribosomal protein L35Ae signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 ...Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein eL6 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein eL15 / 40S ribosomal protein S24 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / 40S ribosomal protein S4 / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein eS26 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / 40S ribosomal protein SA / Small ribosomal subunit protein eS8 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein eS21 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein eS10 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / rabbit (ウサギ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
データ登録者Yang R / Arango D / Sturgill D / Oberdoerffer S
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI) 米国
引用ジャーナル: Mol Cell / 年: 2022
タイトル: Direct epitranscriptomic regulation of mammalian translation initiation through N4-acetylcytidine.
著者: Daniel Arango / David Sturgill / Renbin Yang / Tapan Kanai / Paulina Bauer / Jyoti Roy / Ziqiu Wang / Masaki Hosogane / Sarah Schiffers / Shalini Oberdoerffer /
要旨: mRNA function is influenced by modifications that modulate canonical nucleobase behavior. We show that a single modification mediates distinct impacts on mRNA translation in a position-dependent ...mRNA function is influenced by modifications that modulate canonical nucleobase behavior. We show that a single modification mediates distinct impacts on mRNA translation in a position-dependent manner. Although cytidine acetylation (ac4C) within protein-coding sequences stimulates translation, ac4C within 5' UTRs impacts protein synthesis at the level of initiation. 5' UTR acetylation promotes initiation at upstream sequences, competitively inhibiting annotated start codons. Acetylation further directly impedes initiation at optimal AUG contexts: ac4C within AUG-flanking Kozak sequences reduced initiation in base-resolved transcriptome-wide HeLa results and in vitro utilizing substrates with site-specific ac4C incorporation. Cryo-EM of mammalian 80S initiation complexes revealed that ac4C in the -1 position adjacent to an AUG start codon disrupts an interaction between C and hypermodified t6A at nucleotide 37 of the initiator tRNA. These findings demonstrate the impact of RNA modifications on nucleobase function at a molecular level and introduce mRNA acetylation as a factor regulating translation in a location-specific manner.
履歴
登録2022年3月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年6月1日-
マップ公開2022年6月1日-
更新2022年8月17日-
現状2022年8月17日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_26445.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_26445.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Consensus map by combining local refined maps.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.36 Å/pix.
x 480 pix.
= 651.84 Å		1.36 Å/pix.
x 480 pix.
= 651.84 Å		1.36 Å/pix.
x 480 pix.
= 651.84 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.358 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.037
最小 - 最大-0.002372316 - 0.19658603
平均 (標準偏差)0.0005640061 (±0.0047312803)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 651.84 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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追加マップ: Composite map from ribosome large submit (LSU).

ファイルemd_26445_additional_1.map
注釈Composite map from ribosome large submit (LSU).
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Composite map from ribosome small submit (SSU).

ファイルemd_26445_additional_2.map
注釈Composite map from ribosome small submit (SSU).
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Composite map on mRNA focus refinement.

ファイルemd_26445_additional_3.map
注釈Composite map on mRNA focus refinement.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harring...

全体名称: 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harringtonine
要素
  • 複合体: 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harringtonine
    • RNA: P-site tRNA
    • RNA: mRNA
    • RNA: 28s rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • RNA: 5.8S rRNA
    • RNA: 18S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L18_c domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: eL41
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 40S_SA_C domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: eS21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: eS26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: Receptor of activated protein C kinase 1
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: Harringtonine
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harring...

超分子名称: 80S translation initiation complex with ac4C(-1) mRNA and Harringtonine
タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#79
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

+
分子 #1: P-site tRNA

分子名称: P-site tRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.721828 KDa
配列文字列:
GAGCAGAGUG GCGCAGCGGA AGCGUGCUGG GCCCAU(T6A)ACC CAGAGGUCGA UGGAUCGAAA CCAUCCUCUG CUACCA

+
分子 #2: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.95725 KDa
配列文字列:
AG(4AC)AUG

+
分子 #3: 28s rRNA

分子名称: 28s rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.15075175 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCCGGGGGGC CCAAGUCCUU CUGAUCGAGG CCCAGCCCGU GGACGGUGUG AG(B9B)CCGGU A GCGGCCCCCG GCGCGCCGGG CCCGGGUCUU CCCGGAGUCG GGUUGCUUGG GAAUGCAGCC CAAAGCGGGU GGUAAACUC CAUCUAAGGC UAAAUACCGG CACGAGACCG AUAGUCAACA AGUACCGUAA (OMG)GGAAAGUUG AAAAGAACUU UGAAG (A2M)GAG AGUUCAAGAG GGCGUGAAAC CGUUAAGAGG UAAACGGGUG GGGUCCGCGC AGUCCGCCCG GAGGAUUCAA CC CGGCGGC CGGUCCGGCC GUGCCGGCGG GGCGGAUCUC CCGCUCCCGU CGGCGGGGGA CCGCCCCCCG GCCGGCGACC GGC CGCCGC CGGGCGCAUU UCCACCGCGG CGGUGCGCCG CGACCGGCUC CGGGACGGCU (2MG)GGAAGGCCC CGGCGGGGAA GGUGGCCCG GGGGCCCCGG GUGUUACAGC CCCGCCCCGG CAGCAGCAGC UCGCCGAAUC CCGGGGCCGA GGGAGCGAGA C CCGUGCCG CCGCGCUCUC CCCCCUGGGG GGGCCGGGCC ACCCCUCCCA CGGCGCGACC GCUGGGGCGG ACUGUCCAGU GC GCCCCGG GCGGGUCGCG CCGUCGGGCC CGGGGGCCAC GGCGUCCCCC GCGAGCGCAC GGGGUCGGCG GCGAUGUCGG CUA CCCACC CGACCC(OMG)UCU UG(1MA)AAC(A2M)CGG ACCAAGGAGU CUAACACG(P4U)G CGCGAGUCGG GGGCUACG A AAGCCGCCGU GGCGCAAUGA AGGUGAAGGC CGGCGGCGCC GCCGGCCGAG GUGGGAUCCC GAGGCCUUCC AGUCCGCCG AGGG(B8Q)GCACC ACCGGCCCGU CUCGCCCGCC GCGCCGGGGA GGUGGAGCAC GAGCGCACGU GUUAG(2MG)ACCC (OMG)A(A2M)AGAUGG UGA(A2M)CUAUGC CUGGGCAGGG CGAAGCCAGA GGAAACUCUG GUG(B9B)AGGUCC G (PSU)AGCGGUC CUGACGUGCG AAUCG(7MG)UCGU CCGACCUGGG UAUAG(OMG)GGCG AAAGACUAAU CGAACCAUCU AGUAGCUGG (I4U)UCCCUCCAA AGUUUCCC(PSU)C AGGA(PSU)AGCUG GCGCUCUCCG CAGUUUUAUC CGGUAAAGC GAAUGAUUAG AGGUCUUGGG GCCGAAACGA UCUCAACCUA UUCUCAAACU UUAAAU(E7G)GGU AAGAAGCCCG GCUCGC UGG UGUGGAGCCG GGCGUGGAAU GCGAGUGCCU AGUGGGCCAC (B8H)UUUGG(UR3)AAG C(A2M)GAACUGGC GCU (OMG)CGGGA UGAACCGAAC GCCGGGUUAA (P7G)GCGCCCGAU GCCGACGCUC AUCAGACCCC AGAAAAGGUG UUGGUU GAU AUAGACAGCA GGAUGGUGGC CAUGGAAGUC GGAAUCCGCU AAGGAGUGUG UAACAACUCA CCUGCCGAAU CAACUAG CC CUGAAAAUGG AUG(OMG)CGCUGG AGCGUCGGGC CCAUACCCGG CCGUCGCUGG CAGUCGGCAG AGCGAGAAAG AGAG UGGCG CGGACGCUAC GCCGCGACGA GUAGGAGGGC CGCUGCG(E7G)UG AGCCUUGAAG CCUAGGGCGC GGGCCCGGGU G GAGCCGCC GCAGGUGCAG AUCUUGGUGG UAGU(A2M)(OMG)(OMC)AAA UAUUCAAACG A(B8W)AACUUUGA AGGCCG AAG UGG(A2M)GAAGGG UUCCAUGUGA ACAG(OMC)A(OMG)UUG AACAUGGGUC AGUCGGUCCU GAGAGAUGGG CGAGC GCCG UUCCGAAGGG ACGGGCGAUG GCCUCCGUUG CCCUCAGCCG A(PSU)CGAAAGGG AGUCG(7MG)GUUC AGAUCCCC G AAUCCGGAGU GGCGGAGAUG GGCGCCGCGA GGCGUCCAGU GCGGUAACGC GACCGAUCCC GGAGAAGCCG GCGGGAGCC CCGGGGAGAG UUCUCUUUUC UUUGUGAAGG GCAGGGCGCC CUGGAAUGGG UUCGCCCCGA GAGAGGGGCC CGUGCCUUGG AAAGCGUCG CGGUUCCGGC GGCGUCCGGU GAGCUCUCGC UGGCCCUUGA AAAUCCGGGG (B9B)AGAGGGUGU AAAUCUC GC (OMG)CCGGGCCGU ACC(B9H)AUAUCC GCAGCAGGUC U(OMC)CAAGGUGA ACAGCCUCUG GCAUGUUGGA ACAAUG UAG GUAAGGGAAG UCGGCAAGC(OMC) GGAUCCGUAA CUUCGGGAUA AGGAUUGGCU CUAAGGGCUG GCAGCCGACU UAG AACUGG UGCGGACCAG GGGAAUCCGA CUGUUUAAUU AAAACAAAGC AUCGCGAAGG CCCGCGGCGG GUGUUGACGC GAUG UGAUU UCUGCC(OMC)AGU GCUCUGAAUG (PSU)CA(A2M)AGUG(A2M)A GAAA(PSU)UCAAU GAAGCGCGGG UAAAC GGCG GGAGUAAC(B8H)A (PSU)GACUCUCUU AAGGUAGC(5MC)A A(A2M)UGCCUC(OMG)U CAUCUAAUUA GUGACG CGC AUGAAUGGAU GA(A2M)CGAGAUU CCCACUGUCC CUACCUACUA UCCAGCGAAA CCAC(A2M)G(OMC)CAA GGGAA CG(P7G)G CUUGG(OMC)GGAA UCAGC(B8K)G(BGH)GA AAGAAGA(OMC)CC UGUUGAGCUU GACUCUAGUC UGGCAC GGU GAAGAGACAU GAUCGUUUUU UCACUGACCC GG(5MU)GAGGCGG GGGGGCGAGC CGGGCUCUCG CUUCUGGCGC CAA (B8W)CGCCC GGCCGGCCGG GCGCGACCCG CUCCGGGGAC AGUGCCAGGU GGG(B8W)AGUUUG AC(I4U)G(OMG)GGC G GUACACCUGU CAAACGGUA(6MZ) CGCAGGUGUC CUAAGGCGAG CUCAGGGAGG ACAGAAACCU CCCGUGGAGC AGAAG GGCA AAAGCUCGCU UGA(PSU)CU(B8H)GAU UUUCAG(OMU)ACG AAUACAGACC GUGAAAGCGG GGCCU(5MC)ACGA UCCUUCUGA CCUUUU(E6G)GGU UUUAAGCAGG A(OMG)(MHG)UGUCAGA AAAGUUACCA CAGGGAUAAC UGGC(PSU) UGUG GCGGCCA(1MA)GC GUUCAUAGCG ACGUCGCUUU UUGA(PSU)CCUU(5MC) GA(PSU)GUCGGCU CUUCCUAUCA UUGU(B8W)AAGC AGAAUU(B8T)ACC AAGCGUU(OMG)GA UUG(PSU)UCACCC ACUAAUAGGG AACGUG(A2M)GCU G G(B8W)(UR3)(PSU)UAGA (OMC)CGUCGUGAG ACAG(7MG)UUAGU UUUACCCU(M7A)C UGAUG(A2M)UGUG UUGU UGCCA UGGUAAUCCU GC(UR3)CAGUACG AGAGGAACCG CAGGU(OMU)CA(OMG)A CAU(PSU)UGGUGU A(PSU) (OMG)UGCUUG GCUGAGGAGC CAAUGGGGCG AAGCUAC(B8T)AU CUGUGGGAUU AUGACU(B8K)AAC GCCUCUAAGU C AGAAUCCC GCCCAGGCGG AACGAUAGCG CCGGAGCCUC GGUUGGCCUC GGAUAGCCGG UCCCCCGCCG GGGUCCGGU (OMG)C(2MG)GAGAGCC CUUCGUCCCG GGAAACGGGG CGGCCGGAAA GGGGGCCGCC CUCUCGCCCG UCACGCACCG CA CGUUCGU GGGGAACCUG GCGCUAAACC AUUCGUAGAC GACCUGCUUC UGGGUCGGGG UUUCGUACGU AGCAGAGCAG CUG CUGCGA UCUAUUGAAA GUCAGCCCUC GACACAAGGG UUUGU

+
分子 #4: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

+
分子 #5: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 49.540168 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGG(OMU)GGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGC AGG (N)(N)(N)(N)(N)UUGAU CAUCGACACU UCGAACGCAC UUGCGGCCCC GGGUUCCUCC CGGGGCUACG CCUGUCU GA GCGUCGCU

+
分子 #6: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 6 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 548.640125 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAU(A2M)UGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGU ACA GUGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGU(OMU)CC(PSU) U(OMU)GGUCGCUC GUACUUGGAU AACUG UGGU A(A2M) ...文字列:
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+
分子 #7: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.998613 KDa
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+
分子 #8: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 45.119812 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
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+
分子 #9: 60S ribosomal protein L4

分子名称: 60S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 40.91227 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCV IYNEDNGIVK AFRNIPGITL LNVTKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDDLYGTWR KAASLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYA(MLZ)TMRR NTILRQARNH KLRVERAAAA LAAK

+
分子 #10: Ribosomal_L18_c domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L18_c domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 33.935234 KDa
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FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIM GQNVADYMRY LMEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKR EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQER

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 28.818293 KDa
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KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKREK VLATVTKPVG GDKNGGTRVV KLRKMPRYYP TEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR HRGKRVVFLK QLSSGLLLVT GPLSLNRVPL RRTHQKFVIA T STKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EKEKYEITEQ RKVDQKAVDS QILPKIKAVP QLQGYLRSVF AL TNGVYPH KLVF

+
分子 #12: 60S ribosomal protein L7

分子名称: 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.658754 KDa
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NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI HEIYTVGKHF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGG DAGNREDQIN RLIRRMN

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L7a

分子名称: 60S ribosomal protein L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.766646 KDa
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VVNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET KQEKKQRLL ARAEKKAAGK GDVPTKRPPV LRAGVNTVTT LVENKKAQLV VIAHDVDPIE LVVFLPALCR KMGVPYCILK G KARLGRLV HRKTCTTVAF TQVNSEDKGA LAKLVEAIRT NYNDRYDEIR RHWGGNVLGP KSVARIAKLE KAKAKE

+
分子 #14: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
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MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

+
分子 #15: Ribosomal protein L10

分子名称: Ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.511861 KDa
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GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNKEHVVE ALRRAKFKFP G RQKIHISK KWGFTKFNAD EFEDMVAEKR LIPDGCGVKY IPNRGPLDKW RALHS

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 19.399498 KDa
配列文字列:
KENPMRELRI RKLCLNICVG ESGDRLTRAA KVLEQLTGQT PVFSKARYTV RSFGIRRNEK IAVHCTVRGA KAEEILEKGL KVREYELRK NNFSDTGNFG FGIQEHIDLG IKYDPSIGIY GLDFYVVLGR PGFSIADKKR RTGCIGAKHR ISKEEAMRWF Q QKYDGIIL PG

+
分子 #17: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.200525 KDa
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APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L14

分子名称: 60S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.217355 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTRVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRY KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QRAALLKAS

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L15

分子名称: 60S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
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+
分子 #20: 60S ribosomal protein L13a

分子名称: 60S ribosomal protein L13a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.144859 KDa
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QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKISKF TDVLKTHGLL V

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.758678 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLKKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #22: 60S ribosomal protein L18

分子名称: 60S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.568492 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGRENKTAV VVGTVTDDV RVQEVPKLKV CALRVTSRAR SRILKAGGKI LTFDQLALDS PKGRGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #24: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 20.827561 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

+
分子 #25: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L22

分子名称: 60S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.367146 KDa
配列文字列:
LLKFTLDCTH PVEDGIMDAA NFEQFLQERI KVNGKAGNLG GGVVSLERSK SKITVTSEVP FSKRYLKYLT KKYLKKNNLR DWLRVVANT KESYELRYF

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

+
分子 #28: Ribosomal protein L24

分子名称: Ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.131536 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QA

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L23a

分子名称: 60S ribosomal protein L23a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.727181 KDa
配列文字列:
KIRTSPTFRR PKTLRLRRQP KYPRKSAPRR NKLDHYAIIK FPLTTESAMK KIEDNNTLVF IVDVKANKHQ IKQAVKKLYD IDVAKVNTL IRPDGEKKAY VRLAPDYDAL DVANKIGII

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L26

分子名称: 60S ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

+
分子 #32: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.401047 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMAARAEA IKALVKPKEV KPTIPKGVS RKLHRLAYIA HPKLGRRARA RIARGLR

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.914756 KDa
配列文字列:
SLESINSRLQ LVMKSGKYVL GYKQSLKMIR QGKAKLVILA NNCPALRKSE IEYYAMLAKT GVHHYSGNNI ELGTACGKYY RVCTLSIID PGDSDIIRS

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.449612 KDa
配列文字列:
SGRLWCKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #38: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L35

分子名称: 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.435403 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE SLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.888371 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SSVLAAMRKA AAK

+
分子 #41: 60S ribosomal protein L37

分子名称: 60S ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.090891 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPKPK

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #43: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.324579 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIWMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L40

分子名称: 60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.083414 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC R(MLZ)CYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK V

+
分子 #45: eL41

分子名称: eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #46: 60S ribosomal protein L36a

分子名称: 60S ribosomal protein L36a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.070474 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVI

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L37a

分子名称: 60S ribosomal protein L37a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #48: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.220686 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVMKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYHPDLRMAA IRRASAILRS QKPVM

+
分子 #49: 40S_SA_C domain-containing protein

分子名称: 40S_SA_C domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.361861 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE IEKEEQAAA

+
分子 #50: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.759145 KDa
配列文字列: VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL ...文字列:
VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHG

+
分子 #51: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.441846 KDa
配列文字列: KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ...文字列:
KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ARGCTATLGN FAKATFDAIS KTYSYLTPDL WKETVFTKSP YQEFTDHLVK THT

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 25.215586 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQKG

+
分子 #53: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 29.523674 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI TDFIKFDTGN LCMVTGGANL GRIGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG KGNKPWISLP RG KGIRLTI AEERDKRLAA KQSSG

+
分子 #54: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.525941 KDa
配列文字列: TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA ...文字列:
TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA KGSSNSYAIK KKDELERVAK SNR

+
分子 #55: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.471535 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSL

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.629309 KDa
配列文字列: AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF ...文字列:
AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF SGVYKKLTGK DVNFEFPEFQ L

+
分子 #57: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.003012 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKG

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.649633 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK KGQGGAG

+
分子 #59: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.529682 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRR

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.586766 KDa
配列文字列:
DIQTERAYQK QPTIFQNKKR VLLGETGKEK LPRYYKNIGL GFKTPKEAIE GTYIDKKCPF TGNVSIRGRI LSGVVTKMKM QRTIVIRRD YLHYIRKYNR FEKRHKNMSV HLSPCFRDVQ IGDIVTVGEC RPLSKTVRFN VLKVTKAAGT KK

+
分子 #61: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.544659 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.246854 KDa
配列文字列:
FRKFTYRGVD LDQLLDMSYE QLMQLYSARQ RRRLSRGLRR KQHSLLKRLR KAKKEAPPME KPEVVKTHLR DMIILPEMVG SMVGVYNGK TFNQVEIKPE MIGHYLGEFS ITYKPVKHGR P

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.032804 KDa
配列文字列:
GPLQSVQVFG RKKTATAVAH CKRGNGLIKV NGRPLEMIEP RTLQYKLLEP VLLLGKERFA GVDIRVRVKG GGHVAQIYAI RQSISKALV AYYQKYVDEA SKKEIKDILI QYDRTLLVAD PRRCESKKFG GPGARARYQK SYR

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.250714 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGMNFKT PRG

+
分子 #66: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.898648 KDa
配列文字列:
SLVIPEKFQH ILRVLNTNID GRRKIAFAIT AIKGVGRRYA HVVLRKADID LTKRAGELTE DEVERVITIM QNPRQYKIPD WFLNRQKDV KDGKYSQVLA NGLDNKLRED LERLKKIRAH RGLRHFWGLR VRGQHTKTTG RRGRT

+
分子 #67: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.611003 KDa
配列文字列:
GVTVKDVNQQ EFVRALAAFL KKSGKLKVPE WVDTVKLAKH KELAPYDENW FYTRAASTAR HLYLRGGAGV GSMTKIYGGR QRNGVMPSH FSRGSKSVAR RVLQALEGLK MVEKDQDGGR KLTPQGQRDL DRIAGQVAAA KK

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.395489 KDa
配列文字列:
HRIRITLTSR NVKSLEKVCA DLIRGAKEKN LKVKGPVRMP TKTLRITTRK TPCGEGSKTW DRFQMRIHKR LIDLHSPSEI VKQITSISI EPGVEVEVTI A

+
分子 #69: eS21

分子名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

+
分子 #70: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.626392 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER PR

+
分子 #72: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.432125 KDa
配列文字列:
TVTIRTRKFM TNRLLQRKQM VIDVLHPGKA TVPKTEIREK LAKMYKTTPD VIFVFGFRTH FGGGKTTGFG MIYDSLDYAK KNEPKHRLA RHGLYEKKKT SRKQRKERKN RMKKVRGTAK ANVGA

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.526119 KDa
配列文字列:
RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKG

+
分子 #74: eS26

分子名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.645794 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

+
分子 #75: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.34899 KDa
配列文字列:
PLAKDLLHPS PEEEKRKHKK KRLVQSPNSY FMDVKCPGCY KITTVFSHAQ TVVLCVGCST VLCQPTGGKA RLTEGCSFRR KQH

+
分子 #76: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.007069 KDa
配列文字列:
QPIKLARVTK VLGRTGSQGQ CTQVRVEFMD DTSRSIIRNV KGPVREGDVL TLLESEREAR RL

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.559625 KDa
配列文字列:
GHQQLYWSHP RKFGQGSRSC RVCSNRHGLI RKYGLNMCRQ CFRQYAKDIG FIKLD

+
分子 #78: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.317539 KDa
配列文字列:
SLARVGKVRG QTLKVAKQEK KKKRTGRAKR RMQYNRRFVN VVPTFGKKKG PNANS

+
分子 #79: Receptor of activated protein C kinase 1

分子名称: Receptor of activated protein C kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.669113 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTI

+
分子 #80: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 80 / コピー数: 297 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #81: Harringtonine

分子名称: Harringtonine / タイプ: ligand / ID: 81 / コピー数: 1 / 式: MQ6
分子量理論値: 531.595 Da
Chemical component information

ChemComp-MQ6:
Harringtonine

+
分子 #82: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 82 / コピー数: 7 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: OTHER / 詳細: By 3D volumes from negative staining dataset.
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 107057
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL
得られたモデル

PDB-7uck:
80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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