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- EMDB-26036: Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptid... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-26036
タイトルMammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20
マップデータRabbit 80S ribosome with GR20
試料
  • 複合体: Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20
    • RNA: x 6種
    • タンパク質・ペプチド: x 78種
  • リガンド: x 1種
機能・相同性
機能・相同性情報


regulation of G1 to G0 transition / exit from mitosis / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / regulation of translation involved in cellular response to UV / protein-DNA complex disassembly / positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator / optic nerve development / mammalian oogenesis stage / retinal ganglion cell axon guidance / G1 to G0 transition ...regulation of G1 to G0 transition / exit from mitosis / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / regulation of translation involved in cellular response to UV / protein-DNA complex disassembly / positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator / optic nerve development / mammalian oogenesis stage / retinal ganglion cell axon guidance / G1 to G0 transition / activation-induced cell death of T cells / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / ubiquitin ligase inhibitor activity / phagocytic cup / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / TOR signaling / T cell proliferation involved in immune response / ribosomal small subunit export from nucleus / erythrocyte development / translation regulator activity / cellular response to actinomycin D / cytosolic ribosome / rough endoplasmic reticulum / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / gastrulation / MDM2/MDM4 family protein binding / DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest / negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / rescue of stalled ribosome / 90S preribosome / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of SSU-rRNA / positive regulation of translation / small-subunit processome / positive regulation of apoptotic signaling pathway / protein kinase C binding / positive regulation of protein-containing complex assembly / placenta development / cellular response to gamma radiation / mRNA 5'-UTR binding / transcription coactivator binding / modification-dependent protein catabolic process / cytoplasmic ribonucleoprotein granule / spindle / G1/S transition of mitotic cell cycle / rRNA processing / protein tag activity / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / rhythmic process / positive regulation of canonical Wnt signaling pathway / ribosome binding / glucose homeostasis / retina development in camera-type eye / regulation of translation / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / cell body / T cell differentiation in thymus / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / perikaryon / cytosolic small ribosomal subunit / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / cytosolic large ribosomal subunit / mitochondrial inner membrane / tRNA binding / cytoplasmic translation / postsynaptic density / cell differentiation / protein stabilization / rRNA binding / ribosome / protein ubiquitination / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / cell cycle / translation / positive regulation of protein phosphorylation / positive regulation of apoptotic process / cell division / DNA repair / mRNA binding / apoptotic process / ubiquitin protein ligase binding / synapse / dendrite / positive regulation of cell population proliferation / positive regulation of gene expression / nucleolus / negative regulation of apoptotic process / protein kinase binding / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus
類似検索 - 分子機能
: / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal ...: / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / : / Ribosomal protein S26e signature. / : / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S12e signature. / metallochaperone-like domain / Ribosomal protein S12e / TRASH domain / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / S27a-like superfamily / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / : / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein S6, eukaryotic / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal protein S4e, N-terminal / RS4NT (NUC023) domain / Ribosomal S24e conserved site / Ribosomal protein S24e signature. / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein L30e signature 2. / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / Ribosomal protein L36e signature. / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein S4, KOW domain
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL31 ...Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Large ribosomal subunit protein eL6 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein eL15 / 40S ribosomal protein S24 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / 40S ribosomal protein S4 / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein eS26 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / 40S ribosomal protein SA / Small ribosomal subunit protein eS8 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein eS21 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein eS10 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / rabbit (ウサギ) / Escherichia coli K-12 (大腸菌) / Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å
データ登録者Loveland AB / Svidritskiy E / Susorov D / Lee S / Park A / Zvornicanin S / Demo G / Gao FB / Korostelev AA
資金援助 米国, 4件
OrganizationGrant number国
Other privateDan and Diane Riccio Fund for Neuroscience
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01GM107465 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R35GM127094 米国
National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)R01NS101986 米国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Ribosome inhibition by C9ORF72-ALS/FTD-associated poly-PR and poly-GR proteins revealed by cryo-EM.
著者: Anna B Loveland / Egor Svidritskiy / Denis Susorov / Soojin Lee / Alexander Park / Sarah Zvornicanin / Gabriel Demo / Fen-Biao Gao / Andrei A Korostelev /
要旨: Toxic dipeptide-repeat (DPR) proteins are produced from expanded GC repeats in the C9ORF72 gene, the most common genetic cause of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD). ...Toxic dipeptide-repeat (DPR) proteins are produced from expanded GC repeats in the C9ORF72 gene, the most common genetic cause of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD). Two DPR proteins, poly-PR and poly-GR, repress cellular translation but the molecular mechanism remains unknown. Here we show that poly-PR and poly-GR of ≥20 repeats inhibit the ribosome's peptidyl-transferase activity at nanomolar concentrations, comparable to specific translation inhibitors. High-resolution cryogenic electron microscopy (cryo-EM) reveals that poly-PR and poly-GR block the polypeptide tunnel of the ribosome, extending into the peptidyl-transferase center (PTC). Consistent with these findings, the macrolide erythromycin, which binds in the tunnel, competes with poly-PR and restores peptidyl-transferase activity. Our results demonstrate that strong and specific binding of poly-PR and poly-GR in the ribosomal tunnel blocks translation, revealing the structural basis of their toxicity in C9ORF72-ALS/FTD.
履歴
登録2022年1月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年5月25日-
マップ公開2022年5月25日-
更新2022年6月1日-
現状2022年6月1日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_26036.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_26036.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.4 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Rabbit 80S ribosome with GR20
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.83 Å
密度
表面レベル登録者による: 6.0
最小 - 最大-11.053553 - 45.28508
平均 (標準偏差)0.015870988 (±1.9632393)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ720720720
Spacing720720720
セルA=B=C: 597.6 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: Half map 1

ファイルemd_26036_half_map_1.map
注釈Half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map 2

ファイルemd_26036_half_map_2.map
注釈Half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide...

全体名称: Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20
要素
  • 複合体: Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20
    • RNA: 18S rRNA
    • RNA: 28S rRNA
    • RNA: 5.8S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: eL8
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: uL11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: uL13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: eL18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: eL20
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: eL22
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: uL23
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • タンパク質・ペプチド: eL29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: eL38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: eL40
    • タンパク質・ペプチド: eL41
    • タンパク質・ペプチド: eL42
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 60S acidic ribosomal protein P0
    • タンパク質・ペプチド: Receptor of activated protein C kinase 1
    • タンパク質・ペプチド: 40S_SA_C domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: eS7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: uS11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: uS9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: eS19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: eS21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: eS26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27a
    • RNA: tRNAfMet bound to E-site
    • タンパク質・ペプチド: GR20, ALS/FTD dipeptide repeat protein
    • RNA: mRNA
  • リガンド: ZINC ION

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超分子 #1: Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide...

超分子名称: Mamalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20
タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#84
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 4 MDa

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分子 #1: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 548.040188 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG CCGACGGGCG CUGACCCCCU UCGCGGGGGG GAUGCGUGCA UUUAUCAGUG GUGACUCUAG AUAACCUCGG GC CGAUCGC ACGCCCGGCG GCGACGACCC AUUCGAACGU CUGCCCUAUC AACUUUCGAU GGUAGUCGCC GUGCCUACCA UGG UGACCA CGGGUGACGG GGAAUCAGGG UUCGAUUCCG GAGAGGGAGC CUGAGAAACG GCUACCACAU CCAAGGAAGG CAGC AGGCG CGCAAAUUAC CCACUCCCGA CCCGGGGAGG UAGUGACGAA AAAUAACAAU ACAGGACUCU UUCGAGGCCC UGUAA UUGG AAUGAGUCCA CUUUAAAUCC UUUAACGAGG AUCCAUUGGA GGGCAAGUCU GGUGCCAGCA GCCGCGGUAA UUCCAG CUC CAAUAGCGUA UAUUAAAGUU GCUGCAGUUA AAAAGCUCGU AGUUGGAUCU UGGGAGCGGC CGUCCCCUGC UCGGCGC CG GCCCGAAGCG UUUACUUUGA AAAAAUUAGA GUGUUCAAAG CAGGCCGCCU GGAUACCGCA GCUAGGAAUA AUGGAAUA G GACCGCGGUU CUAUUUUGUU GGUUUUCGGA ACUGAGGCCA UGAUUAAGAG GGACGGCCGG GGGCAUUCGU AUUGCGCCG CUAGAGGUGA AAUUCUUGGA CCGGCGCAAG ACGGACCAGA GCGAAAGCAU UUGCCAAGAA UGUUUUCAUU AAUCAAGAAC GAAAGUCGG AGGUUCGAAG ACGAUCAGAU ACCGUCGUAG UUCCGACCAU AAACGAUGCC GACUGGCGAU GCGGCGGCGU U AUUCCCAU GACCCGCCGG GCAGCUUCCG GGAAACCAAA GUCUUUGGGU UCCGGGGGGA GUAUGGUUGC AAAGCUGAAA CU UAAAGGA AUUGACGGAA GGGCACCACC AGGAGUGGAG CCUGCGGCUU AAUUUGACUC AACACGGGAA ACCUCACCCG GCC CGGACA CGGACAGGAU UGACAGAUUG AUAGCUCUUU CUCGAUUCCG UGGGUGGUGG UGCAUGGCCG UUCUUAGUUG GUGG AGCGA UUUGUCUGGU UAAUUCCGAU AACGAACGAG ACUCUGGCAU GCUAACUAGU UACGCGACCC CGGUCGGCGU AACUU CUUA GAGGGACAAG UGGCGUUCAG CCACCCGAGA UUGAGCAAUA ACAGGUCUGU GAUGCCCUUA GAUGUCCGGG GCUGCA CGC GCGCUACACU GACUGGCUCA GCGUGUGCCU ACCCUACGCC GGCAGGCGCG GGUAACCCGU UGAACCCCAU UCGUGAU GG GGAUCGGGGA UUGCAAUUAU UCCCCAUGAA CGAGGAAUUC CCAGUAAGUG CGGGUCAUAA GCUUGCGUUG AUUAAGUC C CUGCCCUUUG UACACACCGC CCGUCGCUAC UACCGAUUGG AUGGUUUAGU GAGGCCCUCG GAUCGGCCCC GCCGGGGUG CCCUGGCGGA GCGCUGAGAA GACGGUCGAA CUUGACUAUC UAGAGGAAGU AAAAGUCGUA ACAAGGUUUC CGUAGGUGAA CCUGCGGAA GGAUCAUUA

+
分子 #2: 28S rRNA

分子名称: 28S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.1512915 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCGGGGGCCC AAGUCCUUCU GAUCGAGGCC CAGCCCGUGG ACGGUGUGAG GCCGGUAGCG GC CCCCGGC GCGCCGGGCC CGGGUCUUCC CGGAGUCGGG UUGCUUGGGA AUGCAGCCCA AAGCGGGUGG UAAACUCCAU CUA AGGCUA AAUACCGGCA CGAGACCGAU AGUCAACAAG UACCGUAAGG GAAAGUUGAA AAGAACUUUG AAGAGAGAGU UCAA GAGGG CGUGAAACCG UUAAGAGGUA AACGGGUGGG GUCCGCGCAG UCCGCCCGGA GGAUUCAACC CGGCGGCGCG GUCCG GCCG UGCCGGCGGG GCGGAUCCCC GCUCUCGGCG GGGGACCGCC CCCCGGCCGG CGACCGGCCG CCGCCGGGCG CAUUUC CAC CGCGGCGGUG CGCCGCGACC GGCUCCGGGA CGGCUGGGAA GGCCCCGGCG GGGAAGGUGG CCCGGGGGCC CCGGGUG UU ACAGCCCCGC CCCGGCAGCA GCAGCUCGCC GAAUCCCGGG GCCGAGGGAG CGAGACCCGU GCGCCGCGCU CUCCCCCC G GGGGGCCGGG CCACCCCUCC CACGGCGCGA CCGCUGGGGC GGACUGUCCA GUGCGCCCCG GGCGGGUCGC GCCGUCGGG CCCGGGGGGC CACGCGUCCA GCGCACGGGG UCGGCGGCGA UGUCGGCUAC CCACCCGACC CGUCUUGAAA CACGGACCAA GGAGUCUAA CACGUGCGCG AGUCGGGGGC UACGAAAGCC GCCGUGGCGC AAUGAAGGUG AAGGCCGGCC GGCCGAGGUG G GAUCCCGA GGCAGUCCGC CGAGGGCGCA CCACCGGCCC GUCUCGCCCG CCGCGCCGGG GAGGUGGAGC ACGAGCGCAC GU GUUAGGA CCCGAAAGAU GGUGAACUAU GCCUGGGCAG GGCGAAGCCA GAGGAAACUC UGGUGGAGGU CCGUAGCGGU CCU GACGUG CGAAUCGGUC GUCCGACCUG GGUAUAGGGG CGAAAGACUA AUCGAACCAU CUAGUAGCUG GUUCCCUCCA AAGU UUCCC UCAGGAUAGC UGGCGCUCUC CGCAGUUUUA UCCGGUAAAG CGAAUGAUUA GAGGUCUUGG GGCCGAAACG AUCUC AACC UAUUCUCAAA CUUUAAAUGG GUAAGAAGCC CGGCUCGCUG GUGUGGAGCC GGGCGUGGAA UGCGAGUGCC UAGUGG GCC ACUUUUGGUA AGCAGAACUG GCGCUGCGGG AUGAACCGAA CGCCGGGUUA AGGCGCCCGA UGCCGACGCU CAUCAGA CC CCAGAAAAGG UGUUGGUUGA UAUAGACAGC AGGAUGGUGG CCAUGGAAGU CGGAAUCCGC UAAGGAGUGU GUAACAAC U CACCUGCCGA AUCAACUAGC CCUGAAAAUG GAUGGCGCUG GAGCGUCGGG CCCAUACCCG GCCGUCGCUG GCAGUCGGC AGAGCGAGAA AGAGAGGGAC GCUACGCCGC GACGAGUAGG AGGGCCGCUG CGGUGAGCCU UGAAGCCUAG GGCGCGGGCC CGGGUGGAG CCGCCGCAGG UGCAGAUCUU GGUGGUAGUA GCAAAUAUUC AAACGAGAAC UUUGAAGGCC GAAGUGGAGA A GGGUUCCA UGUGAACAGC AGUUGAACAU GGGUCAGUCG GUCCUGAGAG AUGGGCGAGC GCCGUUCCGA AGGGACGGGC GA UGGCCUC CGUUGCCCUC AGCCGAUCGA AAGGGAGUCG GGUUCAGAUC CCCGAAUCCG GAGUGGCGGA GAUGGGCGCC GCG AGGCGU CCAGUGCGGU AACGCGACCG AUCCCGGAGA AGCCGGCGGG AGCCCCGGGG AGAGUUCUCU UUUCUUUGUG AAGG GCAGG GCGCCCUGGA AUGGGUUCGC CCCGAGAGAG GGGCCCGUGC CUUGGAAAGC GUCGCGGUUC CGGCGGCGUC CGGUG AGCU CUCGCUGGCC CUUGAAAAUC CGGGGGAGAG GGUGUAAAUC UCGCGCCGGG CCGUACCCAU AUCCGCAGCA GGUCUC CAA GGUGAACAGC CUCUGGCAUG UUGGAACAAU GUAGGUAAGG GAAGUCGGCA AGCCGGAUCC GUAACUUCGG GAUAAGG AU UGGCUCUAAG GGCUCAGCCG ACUUAGAACU GGUGCGGACC AGGGGAAUCC GACUGUUUAA UUAAAACAAA GCAUCGCG A AGGCCCGCGG CGGGUGUUGA CGCGAUGUGA UUUCUGCCCA GUGCUCUGAA UGUCAAAGUG AAGAAAUUCA AUGAAGCGC GGGUAAACGG CGGGAGUAAC UAUGACUCUC UUAAGGUAGC CAAAUGCCUC GUCAUCUAAU UAGUGACGCG CAUGAAUGGA UGAACGAGA UUCCCACUGU CCCUACCUAC UAUCCAGCGA AACCACAGCC AAGGGAACGG GCUUGGCGGA AUCAGCGGGG A AAGAAGAC CCUGUUGAGC UUGACUCUAG UCUGGCACGG UGAAGAGACA UGAGAGGUGU AGAAUAAGUG GGAGGCCGGC CG CCGGUGA AAUACCACUA CUCUGAUCGU UUUUUCACUG ACCCGGUGAG GCGGGGGGGC GAGGGCUCUC GCUUCUGGCG CCA AGCGCC CGGCGCCGGG CGCGACCCGC UCCGGGGACA GUGCCAGGUG GGGAGUUUGA CUGGGGCGGU ACACCUGUCA AACG GUAAC GCAGGUGUCC UAAGGCGAGC UCAGGGAGGA CAGAAACCUC CCGUGGAGCA GAAGGGCAAA AGCUCGCUUG AUCUU GAUU UUCAGUACGA AUACAGACCG UGAAAGCGGG GCCUCACGAU CCUUCUGACC UUUUGGGUUU UAAGCAGGAG GUGUCA GAA AAGUUACCAC AGGGAUAACU GGCUUGUGGC GGCCAAGCGU UCAUAGCGAC GUCGCUUUUU GAUCCUUCGA UGUCGGC UC UUCCUAUCAU UGUGAAGCAG AAUUCACCAA GCGUUGGAUU GUUCACCCAC UAAUAGGGAA CGUGAGCUGG GUUUAGAC C GUCGUGAGAC AGGUUAGUUU UACCCUACUG AUGAUGUGUU GUUGCCAUGG UAAUCCUGCU CAGUACGAGA GGAACCGCA GGUUCAGACA UUUGGUGUAU GUGCUUGGCU GAGGAGCCAA UGGGGCGAAG CUACCAUCUG UGGGAUUAUG ACUGAACGCC UCUAAGUCA GAAUCCCGCC CAGGCGGAAC GAUAGCCGGA GCCUCGGUUG GCCUCGGAUA GCCGGUCCCC CGGGGGUCCG G UGCGGAGA GCCCUUCGUC CCGGGAAACG GGGCGGCCGG AAAGGGGGCC GCCCUCUCGC CCGUCACGCA CCGCACGUUC GU GGGGAAC CUGGCGCUAA ACCAUUCGUA GACGACCUGC UUCUGGGUCG GGGUUUCGUA CGUAGCAGAG CAGGCUGCGA UCU AUUGAA AGUCAGCCCU CGACACAAGG GUUUGU

+
分子 #3: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 48.545672 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGU UGAUCAUCG ACACUUCGAA CGCACUUGCG GCCCCGGGUU CCUCCCGGGG CUACGCCUGU CUGAGCGUCG CU

+
分子 #4: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

+
分子 #82: tRNAfMet bound to E-site

分子名称: tRNAfMet bound to E-site / タイプ: rna / ID: 82 / コピー数: 2
由来(天然)生物種: Escherichia coli K-12 (大腸菌)
分子量理論値: 24.802785 KDa
配列文字列:
CGCGGGGUGG AGCAGCCUGG UAGCUCGUCG GGCUCAUAAC CCGAAGGUCG UCGGUUCAAA UCCGGCCCCC GCAACCA

+
分子 #84: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 84 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
分子量理論値: 8.591155 KDa
配列文字列:
CCACAUGUUC CCCCCCCCCC CCCCCCCC

+
分子 #5: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.998613 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGRLRG T

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 45.119812 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVSQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKD

+
分子 #7: 60S ribosomal protein L4

分子名称: 60S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 41.101414 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCV IYNEDNGIVK AFRNIPGITL LNVTKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDDLYGTWR KAASLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYAKTMRR NTILRQARNH KLRVERAAAA LAAKSD

+
分子 #8: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.077391 KDa
配列文字列: FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG ...文字列:
FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIM GQNVADYMRY LMEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKR EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQERAA

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 28.818293 KDa
配列文字列: KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKREK VLATVTKPVG GDKNGGTRVV KLRKMPRYYP TEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR HRGKRVVFLK QLSSGLLLVT GPLSLNRVPL RRTHQKFVIA T STKIDISG ...文字列:
KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKREK VLATVTKPVG GDKNGGTRVV KLRKMPRYYP TEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR HRGKRVVFLK QLSSGLLLVT GPLSLNRVPL RRTHQKFVIA T STKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EKEKYEITEQ RKVDQKAVDS QILPKIKAVP QLQGYLRSVF AL TNGVYPH KLVF

+
分子 #10: 60S ribosomal protein L7

分子名称: 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.658754 KDa
配列文字列: NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI ...文字列:
NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI HEIYTVGKHF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGG DAGNREDQIN RLIRRMN

+
分子 #11: eL8

分子名称: eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.695654 KDa
配列文字列: VVNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET KQEKKQRLL ARAEKKAAKR PPVLRAGVNT VTTLVENKKA QLVVIAHDVD PIELVVFLPA LCRKMGVPYC ILKGKARLGR L VHRKTCTT ...文字列:
VVNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET KQEKKQRLL ARAEKKAAKR PPVLRAGVNT VTTLVENKKA QLVVIAHDVD PIELVVFLPA LCRKMGVPYC ILKGKARLGR L VHRKTCTT VAFTQVNSED KGALAKLVEA IRTNYNDRYD EIRRHWGGNV LGPKSVARIA KLEKAKAKEL ATKLG

+
分子 #12: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

+
分子 #13: Ribosomal protein L10

分子名称: Ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.736992 KDa
配列文字列: GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLQTGMRGA FGKPQGTVAR VHIGQVIMSI RTKLQNKEHV VEALRRAKFK FPGRQKIHIS K KWGFTKFN ...文字列:
GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLQTGMRGA FGKPQGTVAR VHIGQVIMSI RTKLQNKEHV VEALRRAKFK FPGRQKIHIS K KWGFTKFN ADEFEDMVAE KRLIPDGCGV KYIPNRGPLD KWRALHS

+
分子 #14: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 19.399498 KDa
配列文字列:
KENPMRELRI RKLCLNICVG ESGDRLTRAA KVLEQLTGQT PVFSKARYTV RSFGIRRNEK IAVHCTVRGA KAEEILEKGL KVREYELRK NNFSDTGNFG FGIQEHIDLG IKYDPSIGIY GLDFYVVLGR PGFSIADKKR RTGCIGAKHR ISKEEAMRWF Q QKYDGIIL PG

+
分子 #15: uL11

分子名称: uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.561117 KDa
配列文字列:
EIKVVYLRCT GGEVGATSAL APKIGPLGLS PKKVGDDIAK ATGDWKGLRI TVKLTIQNRQ AQIEVVPSAS ALIIKALKEP PRDRKKQKN IKHSGNITFD EIVNIARQMR HRSLARELSG TIKEILGTAQ SVGCNVDGRH PHDIIDDINS GAVE

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.200525 KDa
配列文字列: APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI ...文字列:
APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

+
分子 #17: 60S ribosomal protein L14

分子名称: 60S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.217355 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTRVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRY KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QRAALLKAS

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L15

分子名称: 60S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

+
分子 #19: uL13

分子名称: uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.144859 KDa
配列文字列: QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK ...文字列:
QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKISKF TDVLKTHGLL V

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.758678 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLKKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #21: eL18

分子名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 22.099139 KDa
配列文字列: GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQRVVLKR LFMSRTNRKP PLSLSRMIRK MKLPGRESNK TAVVVGTVR TDDVRVQEVP KLKVCALRVT SRARSRILKA GGKILTFDQL ALDSPKGRGT VLLSGPRKGR EVYRHFGKAP G TPHSHTKP ...文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQRVVLKR LFMSRTNRKP PLSLSRMIRK MKLPGRESNK TAVVVGTVR TDDVRVQEVP KLKVCALRVT SRARSRILKA GGKILTFDQL ALDSPKGRGT VLLSGPRKGR EVYRHFGKAP G TPHSHTKP YVRSKGRKFE RARGRRASRG YKN

+
分子 #22: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #23: eL20

分子名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 20.827561 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

+
分子 #24: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

+
分子 #25: eL22

分子名称: eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.495275 KDa
配列文字列:
QLLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVSLERS KSKITVTSEV PFSKRYLKYL TKKYLKKNNL RDWLRVVAN TKESYELRYF

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

+
分子 #27: Ribosomal protein L24

分子名称: Ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.131536 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QA

+
分子 #28: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.727181 KDa
配列文字列:
KIRTSPTFRR PKTLRLRRQP KYPRKSAPRR NKLDHYAIIK FPLTTESAMK KIEDNNTLVF IVDVKANKHQ IKQAVKKLYD IDVAKVNTL IRPDGEKKAY VRLAPDYDAL DVANKIGII

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L26

分子名称: 60S ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

+
分子 #32: eL29

分子名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.093424 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMAARAEA IKALVVSRKL HRLAYIAHP KLGRRARARI ARGLR

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.914756 KDa
配列文字列:
SLESINSRLQ LVMKSGKYVL GYKQSLKMIR QGKAKLVILA NNCPALRKSE IEYYAMLAKT GVHHYSGNNI ELGTACGKYY RVCTLSIID PGDSDIIRS

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.449612 KDa
配列文字列:
SGRLWCKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #38: 60S ribosomal protein L35

分子名称: 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.435403 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE SLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.888371 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SSVLAAMRKA AAK

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L37

分子名称: 60S ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.090891 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPKPK

+
分子 #41: eL38

分子名称: eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.324579 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIWMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #43: eL40

分子名称: eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.199574 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC RKCYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK VK

+
分子 #44: eL41

分子名称: eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #45: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.198603 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVIQ

+
分子 #46: 60S ribosomal protein L37a

分子名称: 60S ribosomal protein L37a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.220686 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVMKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYHPDLRMAA IRRASAILRS QKPVM

+
分子 #48: 60S acidic ribosomal protein P0

分子名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.298991 KDa
配列文字列:
RATWKSNYFL KIIQLLDTMM RKAIRGH

+
分子 #49: Receptor of activated protein C kinase 1

分子名称: Receptor of activated protein C kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.669113 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTI

+
分子 #50: 40S_SA_C domain-containing protein

分子名称: 40S_SA_C domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.361861 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE IEKEEQAAA

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分子 #51: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.759145 KDa
配列文字列: VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL ...文字列:
VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHG

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.441846 KDa
配列文字列: KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ...文字列:
KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ARGCTATLGN FAKATFDAIS KTYSYLTPDL WKETVFTKSP YQEFTDHLVK THT

+
分子 #53: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 25.215586 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQKG

+
分子 #54: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 29.523674 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI TDFIKFDTGN LCMVTGGANL GRIGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG KGNKPWISLP RG KGIRLTI AEERDKRLAA KQSSG

+
分子 #55: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.525941 KDa
配列文字列: TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA ...文字列:
TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA KGSSNSYAIK KKDELERVAK SNR

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.471535 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSL

+
分子 #57: eS7

分子名称: eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.629309 KDa
配列文字列: AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF ...文字列:
AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF SGVYKKLTGK DVNFEFPEFQ L

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.003012 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKG

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分子 #59: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.649633 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK KGQGGAG

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.529682 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRR

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分子 #61: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.586766 KDa
配列文字列:
DIQTERAYQK QPTIFQNKKR VLLGETGKEK LPRYYKNIGL GFKTPKEAIE GTYIDKKCPF TGNVSIRGRI LSGVVTKMKM QRTIVIRRD YLHYIRKYNR FEKRHKNMSV HLSPCFRDVQ IGDIVTVGEC RPLSKTVRFN VLKVTKAAGT KK

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.048244 KDa
配列文字列:
VNTALQEVLK TALIHDGLAR GIREAAKALD KRQAHLCVLA SNCDEPMYVK LVEALCAEHQ INLIKVDDNK KLGEWVGLCK IDREGKPRK VVGCSCVVVK DYGKESQAKD VIEEYFKC

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

+
分子 #64: uS11

分子名称: uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.4315 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRR

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.246854 KDa
配列文字列:
FRKFTYRGVD LDQLLDMSYE QLMQLYSARQ RRRLSRGLRR KQHSLLKRLR KAKKEAPPME KPEVVKTHLR DMIILPEMVG SMVGVYNGK TFNQVEIKPE MIGHYLGEFS ITYKPVKHGR P

+
分子 #66: uS9

分子名称: uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.032804 KDa
配列文字列:
GPLQSVQVFG RKKTATAVAH CKRGNGLIKV NGRPLEMIEP RTLQYKLLEP VLLLGKERFA GVDIRVRVKG GGHVAQIYAI RQSISKALV AYYQKYVDEA SKKEIKDILI QYDRTLLVAD PRRCESKKFG GPGARARYQK SYR

+
分子 #67: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.250714 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGMNFKT PRG

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.898648 KDa
配列文字列:
SLVIPEKFQH ILRVLNTNID GRRKIAFAIT AIKGVGRRYA HVVLRKADID LTKRAGELTE DEVERVITIM QNPRQYKIPD WFLNRQKDV KDGKYSQVLA NGLDNKLRED LERLKKIRAH RGLRHFWGLR VRGQHTKTTG RRGRT

+
分子 #69: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.611003 KDa
配列文字列:
GVTVKDVNQQ EFVRALAAFL KKSGKLKVPE WVDTVKLAKH KELAPYDENW FYTRAASTAR HLYLRGGAGV GSMTKIYGGR QRNGVMPSH FSRGSKSVAR RVLQALEGLK MVEKDQDGGR KLTPQGQRDL DRIAGQVAAA KK

+
分子 #70: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.395489 KDa
配列文字列:
HRIRITLTSR NVKSLEKVCA DLIRGAKEKN LKVKGPVRMP TKTLRITTRK TPCGEGSKTW DRFQMRIHKR LIDLHSPSEI VKQITSISI EPGVEVEVTI A

+
分子 #71: eS21

分子名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

+
分子 #72: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.626392 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER PR

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.432125 KDa
配列文字列:
TVTIRTRKFM TNRLLQRKQM VIDVLHPGKA TVPKTEIREK LAKMYKTTPD VIFVFGFRTH FGGGKTTGFG MIYDSLDYAK KNEPKHRLA RHGLYEKKKT SRKQRKERKN RMKKVRGTAK ANVGA

+
分子 #75: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.526119 KDa
配列文字列:
RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKG

+
分子 #76: eS26

分子名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.645794 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.34899 KDa
配列文字列:
PLAKDLLHPS PEEEKRKHKK KRLVQSPNSY FMDVKCPGCY KITTVFSHAQ TVVLCVGCST VLCQPTGGKA RLTEGCSFRR KQH

+
分子 #78: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.007069 KDa
配列文字列:
QPIKLARVTK VLGRTGSQGQ CTQVRVEFMD DTSRSIIRNV KGPVREGDVL TLLESEREAR RL

+
分子 #79: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.559625 KDa
配列文字列:
GHQQLYWSHP RKFGQGSRSC RVCSNRHGLI RKYGLNMCRQ CFRQYAKDIG FIKLD

+
分子 #80: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.317539 KDa
配列文字列:
SLARVGKVRG QTLKVAKQEK KKKRTGRAKR RMQYNRRFVN VVPTFGKKKG PNANS

+
分子 #81: 40S ribosomal protein S27a

分子名称: 40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.98644 KDa
配列文字列:
KSYTTPKKNK HKRKKVKLAV LKYYKVDENG KISRLRRECP SDECGAGVFM ASHFDRHYCG KCCLTYCF

+
分子 #83: GR20, ALS/FTD dipeptide repeat protein

分子名称: GR20, ALS/FTD dipeptide repeat protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 4.302926 KDa
配列文字列:
GRGRGRGRGR GRGRGRGRGR GRGRGRGRGR GRGRGRGRGR

+
分子 #85: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 85 / コピー数: 6 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 95 %

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 30.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

最終 再構成使用したクラス数: 12 / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: FREALIGN (ver. 9.11) / 使用した粒子像数: 20284
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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