ChemComp-1S0: 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)pho...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 1S0
• 名称: 名称: 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one; 日化辞名称: 1-[5-O-[[[(ホスホノオキシ)ホスホニル]オキシ]ホスホニル]-2-デオキシ-β-L-リボフラノシル]シトシン

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₆N₃O₁₃P₃ / 原子数: 44 / 化学式量: 467.157 / 形式電荷: 0

その他

4k4g

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 1S0 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4K4G

履歴

作成	2013年5月14日
公開	2014年7月16日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)N=C(N)C=C1)CC2O
• CACTVS 3.370: NC1=NC(=O)N(C=C1)[CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1C(C(OC1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC1=NC(=O)N(C=C1)[C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O2
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1[C@H]([C@@H](O[C@@H]1N2C=CC(=NC2=O)N)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H16N3O13P3/c10-7-1-2-12(9(14)11-7)8-3-5(13)6(23-8)4-22-27(18,19)25-28(20,21)24-26(15,16)17/h1-2,5-6,8,13H,3-4H2,(H,18,19)(H,20,21)(H2,10,11,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RGWHQCVHVJXOKC-CHKWXVPMSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[(2S,3R,5S)-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-4k4g:
Ternary crystal structures of human DNA POLYMERASE LAMBDA IN COMPLEX WITH DNA AND L-DCTP.

PDB-5u2r:
PRECATALYTIC TERNARY COMPLEX OF HUMAN DNA POLYMERASE BETA WITH GAPPED DNA SUBSTARTE, INCOMING L-DCTP AND CA2+

PDB-7lrx:
Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dCTP, and CA(2+) ion