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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1i48 | ||||||
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タイトル | CYSTATHIONINE GAMMA-SYNTHASE IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR CTCPO | ||||||
![]() | CYSTATHIONINE GAMMA-SYNTHASE | ||||||
![]() | LYASE / PLP-dependent enzyme / homotetramer / inhibitor complex / CTCPO | ||||||
機能・相同性 | ![]() cystathionine gamma-synthase activity / transsulfuration / methionine biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Steegborn, C. / Laber, B. / Messerschmidt, A. / Huber, R. / Clausen, T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of cystathionine gamma-synthase inhibitor complexes rationalize the increased affinity of a novel inhibitor. 著者: Steegborn, C. / Laber, B. / Messerschmidt, A. / Huber, R. / Clausen, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 882.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 738.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 931.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 116.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 163.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 48067.973 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-PLP / #3: 化合物 | ChemComp-CCO / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.64 Å3/Da / 溶媒含有率: 66.17 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 6.5 詳細: MES, magnesium acetate, PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7.8 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: used seeding | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 291 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1999年7月10日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.25→20 Å / Num. all: 119179 / Num. obs: 119179 / % possible obs: 93 % / Observed criterion σ(I): -100 / 冗長度: 1.7 % / Rmerge(I) obs: 0.138 / Net I/σ(I): 4.4 |
反射 シェル | 解像度: 3.25→3.36 Å / 冗長度: 1.6 % / Rmerge(I) obs: 0.496 / % possible all: 94 |
反射 | *PLUS % possible obs: 93 % |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 94 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB entry 1qgn 解像度: 3.25→20 Å / Isotropic thermal model: Isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.25→20 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 20 Å / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.226 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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