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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1csr | ||||||
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タイトル | Alpha-fluoro acid and alpha-fluoro amide analogs of acetyl-coa as inhibitors of of citrate synthase: effect of pka matching on binding affinity and hydrogen bond length | ||||||
![]() | CITRATE SYNTHASE | ||||||
![]() | OXO-ACID-LYASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() citrate (Si)-synthase / The tricarboxylic acid cycle / citrate synthase activity / citrate (Si)-synthase activity / citrate metabolic process / tricarboxylic acid cycle / carbohydrate metabolic process / mitochondrial matrix / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Usher, K.C. / Remington, S.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: alpha-Fluoro acid and alpha-fluoro amide analogs of acetyl-CoA as inhibitors of citrate synthase: effect of pKa matching on binding affinity and hydrogen bond length. 著者: Schwartz, B. / Drueckhammer, D.G. / Usher, K.C. / Remington, S.J. #1: ![]() タイトル: A Very Short Hydrogen Bond Provides Only Moderate Stabilization of an Enzyme-Inhibitor Complex of Citrate Synthase 著者: Usher, K.C. / Remington, S.J. / Martin, D.P. / Drueckhammer, D.G. #2: ![]() タイトル: Proposed Mechanism for the Condensation Reaction of Citrate Synthase: 1.9-Angstroms Structure of the Ternary Complex with Oxaloacetate and Carboxymethyl Coenzyme A 著者: Karpusas, M. / Branchaud, B. / Remington, S.J. #3: ![]() タイトル: Crystal Structure Analysis and Molecular Model of a Complex of Citrate Synthase with Oxaloacetate and S-Acetonyl-Coenzyme A 著者: Wiegand, G. / Remington, S. / Deisenhofer, J. / Huber, R. #4: ![]() タイトル: Crystallographic Refinement and Atomic Models of Two Different Forms of Citrate Synthase at 2.7 And 1.7 Angstroms Resolution 著者: Remington, S. / Wiegand, G. / Huber, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 102.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 77.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 48174.934 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-OAA / |
#3: 化合物 | ChemComp-FAM / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.51 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.54 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS II / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1994年12月15日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | 冗長度: 1.7 % / Rmerge(I) obs: 0.077 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 25 Å / Num. obs: 38748 / % possible obs: 75 % / Num. measured all: 67827 / Rmerge(I) obs: 0.077 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 2 Å / % possible obs: 52 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→25 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→25 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |