ChemComp-18T: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 18T
• 名称: 名称: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl; 別称: dTDP-6-deoxy-d-allose; 日化辞名称: チミジン5′-二りん酸β-(6-デオキシ-α-D-グルコピラノシル)

Chemical information

組成

組成式: C₁₆H₂₆N₂O₁₅P₂ / 原子数: 61 / 化学式量: 548.33 / 形式電荷: 0

その他

4hmz

タイプ: D-SACCHARIDE / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: 18T / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4HMZ

履歴

作成	2012年11月5日
Other modification	2012年11月16日
Other modification	2013年2月14日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C(=CN(C(=O)N1)C2OC(C(O)C2)COP(=O)(OP(=O)(OC3OC(C(O)C(O)C3O)C)O)O)C
• CACTVS 3.370: C[CH]1O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH](C[CH]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1C(C(C(C(O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(CC(O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: C[C@H]1O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2O)N3C=C(C)C(=O)NC3=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H](O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N3C=C(C(=O)NC3=O)C)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C16H26N2O15P2/c1-6-4-18(16(24)17-14(6)23)10-3-8(19)9(31-10)5-29-34(25,26)33-35(27,28)32-15-13(22)12(21)11(20)7(2)30-15/h4,7-13,15,19-22H,3,5H2,1-2H3,(H,25,26)(H,27,28)(H,17,23,24)/t7-,8+,9-,10-,11-,12+,13-,15-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ZOSQFDVXNQFKBY-LPGAPTBISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[(2R,3S,5R)-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3R,4S,5S,6R)-6-methyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-4hmz:
Crystal Structure of ChmJ, a 3'-monoepimerase from Streptomyces bikiniensis in complex with dTDP-quinovose