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- EMDB-14127: Bovine complex I in the active state at 3.1 A -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-14127
タイトルBovine complex I in the active state at 3.1 A
マップデータConsensus map locally sharpened
試料
  • 複合体: NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 12種
機能・相同性
機能・相同性情報


Complex I biogenesis / Mitochondrial protein import / RHOG GTPase cycle / ubiquinone biosynthetic process / Respiratory electron transport / cellular response to oxygen levels / mitochondrial large ribosomal subunit binding / gliogenesis / Neutrophil degranulation / neural precursor cell proliferation ...Complex I biogenesis / Mitochondrial protein import / RHOG GTPase cycle / ubiquinone biosynthetic process / Respiratory electron transport / cellular response to oxygen levels / mitochondrial large ribosomal subunit binding / gliogenesis / Neutrophil degranulation / neural precursor cell proliferation / [2Fe-2S] cluster assembly / oxygen sensor activity / NADH dehydrogenase activity / Mitochondrial protein degradation / ubiquinone binding / electron transport coupled proton transport / acyl binding / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / acyl carrier activity / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / respiratory chain complex I / response to cAMP / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / neurogenesis / reactive oxygen species metabolic process / aerobic respiration / fatty acid binding / respiratory electron transport chain / electron transport chain / circadian rhythm / brain development / mitochondrial intermembrane space / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / mitochondrial membrane / NAD binding / fatty acid biosynthetic process / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / oxidoreductase activity / mitochondrial inner membrane / mitochondrial matrix / negative regulation of DNA-templated transcription / apoptotic process / protein-containing complex binding / mitochondrion / nucleoplasm / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Complex1_LYR-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family ...Complex1_LYR-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit (NDUFB4) / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / Deoxynucleoside kinase domain / Deoxynucleoside kinase / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / : / SLBB domain / : / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / : / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / Acyl carrier protein, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
類似検索 - 構成要素
生物種Bos taurus (ウシ) / cattle (哺乳類)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å
データ登録者Bridges HR / Blaza JN / Yin Z / Chung I / Hirst J
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_U105663141 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_UU_00015/2 英国
引用
ジャーナル: Science / 年: 2023
タイトル: Structural basis of mammalian respiratory complex I inhibition by medicinal biguanides.
著者: Hannah R Bridges / James N Blaza / Zhan Yin / Injae Chung / Michael N Pollak / Judy Hirst /
要旨: The molecular mode of action of biguanides, including the drug metformin, which is widely used in the treatment of diabetes, is incompletely characterized. Here, we define the inhibitory drug-target ...The molecular mode of action of biguanides, including the drug metformin, which is widely used in the treatment of diabetes, is incompletely characterized. Here, we define the inhibitory drug-target interaction(s) of a model biguanide with mammalian respiratory complex I by combining cryo-electron microscopy and enzyme kinetics. We interpret these data to explain the selectivity of biguanide binding to different enzyme states. The primary inhibitory site is in an amphipathic region of the quinone-binding channel, and an additional binding site is in a pocket on the intermembrane-space side of the enzyme. An independent local chaotropic interaction, not previously described for any drug, displaces a portion of a key helix in the membrane domain. Our data provide a structural basis for biguanide action and enable the rational design of medicinal biguanides.
#1: ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Cryo-EM structures define ubiquinone-10 binding to mitochondrial complex I and conformational transitions accompanying Q-site occupancy
著者: Chung I / Wright JJ / Bridges HR / Ivanov BS / Biner O / Pereira CS / Arantes GM / Hirst J
履歴
登録2022年1月13日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年3月2日-
マップ公開2022年3月2日-
更新2023年3月8日-
現状2023年3月8日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 5.08
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 5.08
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-7qsd
  • 表面レベル: 5.08
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_14127.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_14127.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 347.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Consensus map locally sharpened
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸X (Sec.)Y (Row.)Z (Col.)
1.06 Å/pix.
x 450 pix.
= 475.2 Å		1.06 Å/pix.
x 450 pix.
= 475.2 Å		1.06 Å/pix.
x 450 pix.
= 475.2 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.056 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 5.08 / ムービー #1: 5.08
最小 - 最大-13.287265 - 27.341368
平均 (標準偏差)-0.0025951287 (±0.9726079)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ450450450
Spacing450450450
セルA=B=C: 475.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0561.0561.056
M x/y/z450450450
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z475.200475.200475.200
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ450450450
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS450450450
D min/max/mean-13.28727.341-0.003

-
添付データ

-
マスク #1

ファイルemd_14127_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Consensus map globally sharpened

ファイルemd_14127_additional_1.map
注釈Consensus map globally sharpened
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Consensus halfmap1

ファイルemd_14127_half_map_1.map
注釈Consensus halfmap1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Consensus halfmap2

ファイルemd_14127_half_map_2.map
注釈Consensus halfmap2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

全体名称: NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
要素
  • 複合体: NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

+
超分子 #1: NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

超分子名称: NADH Ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
由来(天然)生物種: Bos taurus (ウシ) / 器官: Heart
分子量理論値: 1 MDa

+
分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 13.086531 KDa
配列文字列:
(FME)NLMLALLTN FTLATLLVII AFWLPQLNVY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLP WAS QTANLNTMLT MALFLIILLA VSLAYEWTQK GLEWTE

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 23.802926 KDa
配列文字列: MAALAALRLL HPILAVRSGV GAALQVRGVH SSMAADSPSS TQPAVSQARA VVPKPAALPS SRGEYVVAKL DDLINWARRS SLWPMTFGL ACCAVEMMHM AAPRYDMDRF GVVFRASPRQ SDVMIVAGTL TNKMAPALRK VYDQMPEPRY VVSMGSCANG G GYYHYSYS ...文字列:
MAALAALRLL HPILAVRSGV GAALQVRGVH SSMAADSPSS TQPAVSQARA VVPKPAALPS SRGEYVVAKL DDLINWARRS SLWPMTFGL ACCAVEMMHM AAPRYDMDRF GVVFRASPRQ SDVMIVAGTL TNKMAPALRK VYDQMPEPRY VVSMGSCANG G GYYHYSYS VVRGCDRIVP VDIYVPGCPP TAEALLYGIL QLQKKIKREK RLRIWYRR

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 30.323445 KDa
配列文字列: MAAAVAAAAR GCWQRLVGSA APARVAGRPS VLLLPVRRES SAADTRPTVR PRNDVAHKQL SAFGEYVAEI LPKYVQQVQV SCFNELEIC IHPDGVIPVL TFLRDHSNAQ FKSLADLTAV DIPTRQNRFE IVYNLLSLRF NSRIRVKTYT DELTPIESSV P VYKAANWY ...文字列:
MAAAVAAAAR GCWQRLVGSA APARVAGRPS VLLLPVRRES SAADTRPTVR PRNDVAHKQL SAFGEYVAEI LPKYVQQVQV SCFNELEIC IHPDGVIPVL TFLRDHSNAQ FKSLADLTAV DIPTRQNRFE IVYNLLSLRF NSRIRVKTYT DELTPIESSV P VYKAANWY EREIWDMFGV FFANHPDLRR ILTDYGFEGH PFRKDFPLSG YVELRYDDEV KRVVAEPVEL AQEFRKFDLN SP WEAFPAY RQPPESLKLE AGDTKPEAK

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 52.678547 KDa
配列文字列: MAALRALCRL RGAAAQVLRP GAGVRLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQYGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVE KL ...文字列:
MAALRALCRL RGAAAQVLRP GAGVRLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQYGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVE KL LNIRPPPRAQ WIRVLFGEIT RLLNHIMAVT THALDIGAMT PFFWMFEERE KMFEFYERVS GARMHAAYVR PGGVHQDL P LGLMDDIYEF SKNFSLRIDE LEEMLTNNRI WRNRTVDIGI VTAEDALNYG FSGVMLRGSG IQWDLRKTQP YDVYDQVEF DVPIGSRGDC YDRYLCRVEE MRQSIRIISQ CLNKMPPGEI KVDDAKVSPP KRAEMKTSME SLIHHFKLYT EGYQVPPGAT YTAIEAPKG EFGVYLVSDG SSRPYRCKIK APGFAHLAGL DKMSKGHMLA DVVAIIGTQD IVFGEVDR

+
分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 27.341496 KDa
配列文字列: MFLSAALRAR AAGLAAHWGK HIRNLHKTAV QNGAGGALFV HRDTPENNPE TPFDFTPENY KRIEAIVKNY PEGHKAAAVL PVLDLAQRQ NGWLPISAMN KVAEILQVPP MRVYEVATFY TMYNRKPVGK YHIQVCTTTP CMLRNSDSIL EAIQKKLGIK V GETTPDKL ...文字列:
MFLSAALRAR AAGLAAHWGK HIRNLHKTAV QNGAGGALFV HRDTPENNPE TPFDFTPENY KRIEAIVKNY PEGHKAAAVL PVLDLAQRQ NGWLPISAMN KVAEILQVPP MRVYEVATFY TMYNRKPVGK YHIQVCTTTP CMLRNSDSIL EAIQKKLGIK V GETTPDKL FTLIEVECLG ACVNAPMVQI NDNYYEDLTP KDIEEIIDEL KAGKIPKPGP RSGRFSCEPA GGLTSLTEPP KG PGFGVQA GL

+
分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 50.718777 KDa
配列文字列: MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN ...文字列:
MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG SGYDFDVFVV RGAGAYICGE ETALIESIEG KQGKPRLKPP FPADVGVFGC PT TVANVET VAVSPTICRR GGAWFASFGR ERNSGTKLFN ISGHVNNPCT VEEEMSVPLK ELIEKHAGGV TGGWDNLLAV IPG GSSTPL IPKSVCETVL MDFDALIQAQ TGLGTAAVIV MDRSTDIVKA IARLIEFYKH ESCGQCTPCR EGVDWMNKVM ARFV RGDAR PAEIDSLWEI SKQIEGHTIC ALGDGAAWPV QGLIRHFRPE LEERMQQFAQ QHQARQAAF

+
分子 #7: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 79.532219 KDa
配列文字列: MLRIPVRKAL VGLSKSSKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKT KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL ...文字列:
MLRIPVRKAL VGLSKSSKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKT KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL VKTIMTRCIQ CTRCIRFASE IAGVDDLGTT GRGNDMQVGT YIEKMFMSEL SGNIIDICPV GALTSKPYAF TA RPWETRK TESIDVMDAV GSNIVVSTRT GEVMRILPRM HEDINEEWIS DKTRFAYDGL KRQRLTEPMV RNEKGLLTHT TWE DALSRV AGMLQSFQGN DVAAIAGGLV DAEALIALKD LLNRVDSDTL CTEEVFPTAG AGTDLRSNYL LNTTIAGVEE ADVV LLVGT NPRFEAPLFN ARIRKSWLHN DLKVALIGSP VDLTYRYDHL GDSPKILQDI ASGSHPFSQV LQEAKKPMVI LGSSA LQRN DGAAILAAVS NIAQKIRTSS GVTGDWKVMN ILHRIASQVA ALDLGYKPGV EAIQKNPPKM LFLLGADGGC ITRQDL PKD CFIVYQGHHG DVGAPIADVI LPGAAYTEKS ATYVNTEGRA QQTKVAVTPP GLAREDWKII RALSEIAGMT LPYDTLD QV RNRLEEVSPN LVRYDDVEGA NYFQQASELS KLVNQQLLAD PLVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGAHA V EEPSIC

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 35.716785 KDa
配列文字列: (FME)FMINILMLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSASM FILAPI MAL GLALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLM SG ...文字列:
(FME)FMINILMLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSASM FILAPI MAL GLALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLM SG SFTLSTLITT QEQMWLILPA WPLAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFALFFMAEY ANIIMMNI F TAILFLGTSH NPHMPELYTI NFTIKSLLLT MSFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKNFLPLT LALCMWHVSL PILTSGIPP QT

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 23.9264 KDa
配列文字列: MRCLTMPMLL RALAQAQAAR AGHASVRGLH SSAVAATYKY VNLREPSMDM KSVTDRAAQT LLWTELIRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV ...文字列:
MRCLTMPMLL RALAQAQAAR AGHASVRGLH SSAVAATYKY VNLREPSMDM KSVTDRAAQT LLWTELIRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV EGPNFEFSTE THEELLYNKE KLLNNGDKWE AEIAANIQAD YLYR

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 19.110488 KDa
配列文字列:
(FME)MLYIVFILS VIFVMGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMMVVFGY TTAMAT EQY PEIWLSNKAV LGAFVTGLLM EFFMVYYVLK DKEVEVVFEF NGLGDWVIYD TGDSGFFSEE AMGIAALYSY GTWLVIV TG WSLLIGVVVI MEITRGN

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 10.828195 KDa
配列文字列:
(FME)SMVYMNIMM AFTVSLVGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FVMAALTILN SHFTLASMMP IILLVFAACE AALGLS LLV MVSNTYGTDY VQNLNLLQC

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 68.35593 KDa
配列文字列: (FME)NMFSSLSLV TLLLLTMPIM MMSFNTYKPS NYPLYVKTAI SYAFITSMIP TMMFIHSGQE LIISNWHWLT IQTLKL SLS FKMDYFSMMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMY SDPNINKFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW ...文字列:
(FME)NMFSSLSLV TLLLLTMPIM MMSFNTYKPS NYPLYVKTAI SYAFITSMIP TMMFIHSGQE LIISNWHWLT IQTLKL SLS FKMDYFSMMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMY SDPNINKFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW YGRADANTAA LQAILYNRIG DIGFILAMAW FLTNLNTWDL QQIFMLNPSD SNMPLIGLAL AATGKSAQFG LHPWLPSA M EGPTPVSALL HSSTMVVAGI FLLIRFYPLT ENNKYIQSIT LCLGAITTLF TAMCALTQND IKKIIAFSTS SQLGLMMVT IGINQPYLAF LHICTHAFFK AMLFMCSGSI IHSLNDEQDI RKMGGLFKAM PFTTTALIVG SLALTGMPFL TGFYSKDLII EAANTSYTN AWALLMTLIA TSFTAIYSTR IIFFALLGQP RFPTLVNINE NNPLLINSIK RLLIGSLFAG YIISNNIPPT T IPQMTMPY YLKTTALIVT ILGFILALEI SNMTKNLKYH YPSNAFKFST LLGYFPTIMH RLAPYMNLSM SQKSASSLLD LI WLEAILP KTISLAQMKA STLVTNQKGL IKLYFLSFLI TILISMILFN FHE

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 52.158758 KDa
配列文字列: (FME)LKYIIPTIM LMPLTWLSKN NMIWVNSTAH SLLISFTSLL LMNQFGDNSL NFSLLFFSDS LSTPLLILTM WLLPLM LMA SQHHLSKENL TRKKLFITML ISLQLFLIMT FTAMELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL ...文字列:
(FME)LKYIIPTIM LMPLTWLSKN NMIWVNSTAH SLLISFTSLL LMNQFGDNSL NFSLLFFSDS LSTPLLILTM WLLPLM LMA SQHHLSKENL TRKKLFITML ISLQLFLIMT FTAMELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL PLLVALIYIQ NTVGSLNFLM LQYWVQPVHN SWSNVFMWLA CMMAFMVKMP LYGLHLWLPK AHVEAPIAGS MVLAAVLL K LGGYGMLRIT LILNPMTDFM AYPFIMLSLW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IVAILIQTPW SYMGATALM IAHGLTSSML FCLANSNYER IHSRTMILAR GLQTLLPLMA TWWLLASLTN LALPPTINLI GELFVVMSTF SWSNITIILM GVNMVITAL YSLYMLIMTQ RGKYTYHINN ISPSFTRENA LMSLHILPLL LLTLNPKIIL GPLY

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 39.302941 KDa
配列文字列: (FME)NPIIFIIIL LTIMLGTIIV MISSHWLLVW IGFEMNMLAI IPIMMKNHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAVII NLM FSGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQIFPSI NLNLILT LS ...文字列:
(FME)NPIIFIIIL LTIMLGTIIV MISSHWLLVW IGFEMNMLAI IPIMMKNHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAVII NLM FSGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQIFPSI NLNLILT LS VLSILIGGWG GLNQTQLRKI MAYSSIAHMG WMTAVLPYNP TMTLLNLIIY IIMTSTMFTM FMANSTTTTL SLSHTWNK T PIMTVLILAT LLSMGGLPPL SGFMPKWMII QEMTKNNSII LPTFMAITAL LNLYFYMRLT YSTTLTMFPS TNNMKMKWQ FPLMKKMTFL PTMVVLSTMM LPLTPMLSVL E

+
分子 #15: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 39.330984 KDa
配列文字列: MALRLLRLVP PRVGGIHTSV QFKLQYGPLA YILGEKATKK MTEKSKLITV DGNICSGKSK LAKEIAEKLG LKHFPEAGIH YVDSTTGDG KPLPVQFSGN CSLEKFYDDP KSNDGNSYRL QAWLYASRLL QYADALEHLL STGQGVVLER SIYSDFVFLE A MYRQGFIR ...文字列:
MALRLLRLVP PRVGGIHTSV QFKLQYGPLA YILGEKATKK MTEKSKLITV DGNICSGKSK LAKEIAEKLG LKHFPEAGIH YVDSTTGDG KPLPVQFSGN CSLEKFYDDP KSNDGNSYRL QAWLYASRLL QYADALEHLL STGQGVVLER SIYSDFVFLE A MYRQGFIR KQCVDHYNQV KKVTICEYLP PHVVVYVDVP VPEVQSRIQK KGNPHEMKIT SAYLQDIENA YKGTFLPEMS EK CEVLQYS AWEAQDAEKV VEDIEYLKYD KGPWLDQNDR KLHKLRMLVQ DKLEVLNYTS IPVFLPEVTV GAHQSDQVFQ EFT ELPGRK YRAGYNEDVG DKWIWLK

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 42.91343 KDa
配列文字列: MAAAVHPRVV RVLPMSRSSV PALAASVFHS PPQRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPHRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMDWN GRDKDSIRRA VEHSSVVINL VGREWETQNF DFEDVFVKIP QAIAQVSKEA G VEKFIHIS ...文字列:
MAAAVHPRVV RVLPMSRSSV PALAASVFHS PPQRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPHRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMDWN GRDKDSIRRA VEHSSVVINL VGREWETQNF DFEDVFVKIP QAIAQVSKEA G VEKFIHIS HLNADIKSSS KYLRSKAVGE KEVRETFPEA TIIKPAEIFG REDRFLNYFA NIRWFGGVPL ISLGKKTVKQ PV YIVDVTK GIINAIKDPD ARGKTFAFVG PSRYLLFDLV QYVFAVAHRP FLPYPLPHFA YRWIGRLFEI SPFEPWTTRD KVE RIHTTD KILPHLPGLE DLGVEATPLE LKAIEVLRRH RTYRWLSSEI EDVQPAKTIP TSGP

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 19.841555 KDa
配列文字列:
MAAVSMSVAL RQALWGRRVA TVAAVSVSKV STRSLSTSTW RLAQDQTRDT QLITVDEKLD ITTITGVPEE HIKTRKARIF VPARNNMQS GVNNTKKWKM EFDTRERWEN PLMGWASTAD PLSNLVLTFS TKEDAVAFAE KNGWSYDVEE RKVPKPKSKS Y GANFSWNK RTRVSTK

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 13.433194 KDa
配列文字列:
MAAVLTFLRF LGRGGAVTRG LPGGARCFGV RTSPTGEKVT HTGQVYDDGD YRKVRFVGRQ KEVNENFAID LIAEQPVSQV GSRVISCDG GGGALGHPRV YINLDKETKT GTCGYCGLQF RQQHH

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 11.097824 KDa
配列文字列:
MAAAAAIRGV RGKLGLREIR IHLCQRSPGS QGVRDFIEKR YVELKKANPD LPILIRECSD VQPKLWARYA FGQEKNVSLN NFSADQVTR ALENVLSSKA

+
分子 #20: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 17.42134 KDa
配列文字列:
MAVRVLCACV RRLPTAFAPL PRLPTLAAAR PLSTTLFAAE TRTRPGAPLP ALVLAQVPGR VTQLCRQYSD APPLTLEGIK DRVLYVLKL YDKIDPEKLS VNSHFMKDLG LDSLDQVEII MAMEDEFGFE IPDIDAEKLM CPQEIVDYIA DKKDVYE

+
分子 #21: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 13.334608 KDa
配列文字列:
MAGLLKKTTG LVGLAVCETP HERLKILYTK ILDVLGHIPK NAAYRKYTEQ ITNEKLSMVK AEPDVKKLEE RLQGGQIEEV ILQAENELS LARKMIQWKP WEPLVEEPPA SQWKWPI

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 15.083544 KDa
配列文字列:
MAASGLRQAA VAASTSVKPI FSRDMNEAKR RVRELYRAWY REVPNTVHLF QLDISVKQGR DKVREMFKKN AHITDPRVVD LLVIKGKME LEETIKVWKQ RTHVMRFFHE TEAPRPKDFL SKFYVGHDP

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 20.124133 KDa
配列文字列:
MPGIVELPSL EDLKVQEVKV SSSVLKAAAH HYGAQCDKPN KEFMLCRWEE KDPRRCLEEG KLVNQCALEF FRQIKRHCAE PFTEYWTCI DYSGLQLFRR CRKQQAQFDE CVLDKLGWVR PDLGDLSKVT KVKTDRPLPE NPYHSRARPE PNPEVEGDLK P ARHGSRLF FWTM

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 14.814058 KDa
配列文字列:
M(AYA)KTVLRQYW DIPEGTECHR KTYATTSIGG AAGLVVSAYS VALKTPTSFL EGVARTGRYT FTAAAIGAIF GLTSCI SAQ VREKPDDPLN YLIGGCAGGL ILGARTRSYG IGAAACAYMG LTAALVKMGQ LEGWQVFAEP KV

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 16.694395 KDa
配列文字列:
MAASKVKQDM PPVGGYGPID YKRNLPRRGL SGYSMFAVGI GALLFGYWSM MKWNRERRRL QIEDFEARIA LMPLLQAEKD RRVLQMLRE NLEEEATVMK DVPGWKVGES VFHTTRWVTP MMGELYGLRA SEEVLSATYG FIWYT

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 8.117445 KDa
配列文字列:
MWFEVLPGIA VMGVCLFIPG MATARIHRFS NGGKEKRVAH YPYQWYLMER DRRVSGVNRS YVSKGLENID

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 9.35785 KDa
配列文字列:
MAERVAAFLK NVWAKEPVLV ASFAIAGLAV ILPTLSPYTK YSLMINRATP YNYPVPLRDD GNMPDVPSHP QDPQGPSLEW LKRL

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 8.796211 KDa
配列文字列:
MAPSALLRPF WKLLAPARFP SVSSSRSKFY IQEPPHGSPN WLKVGLTLGT SVFLWIYLIK QHNEDVLEYK RRNGLE

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 14.159332 KDa
配列文字列:
(AME)MTGRQGRAT FQFLPDEARS LPPPKLTDPR LAFVGFLGYC SGLIDNAIRR RPVLLAGLHR QLLYITSFVF VGYYLL KRQ DYMYAVRDHD MFSYIKSHPE DFPEKDKKTY GEVFEEFHPV R

+
分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 12.694671 KDa
配列文字列:
MPFFDVQKRL GVDLDRWMTI QSAEQPHKIP SRCHAFEKEW IECAHGIGSI RAEKECKIEF EDFRECLLRQ KTMKRLHAIR RQREKLIKE GKYTPPPHHS GQEEPRS

+
分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 6.978148 KDa
配列文字列:
MNLLQVVRDH WVHVLVPMGF VFGYYLDRKN DEKLTAFRNK SLLYKRELKP NEEVTWK

+
分子 #32: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 17.594945 KDa
配列文字列:
MAARMLGLCG RRLLAVAATR GLPAARVRWE SSSSRAVIAP STLAGKRPSE PTLRWQEDPE PEDENLYEKN PDSHGYDKDP AVDIWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWAR REAERLVKYR EAHGLPIMES NCFDPSKIQL PEDED

+
分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 21.624135 KDa
配列文字列: MAAMSLLHRA SVSAVAALSG RRLGTRLGFG GFLTRDFPKT VAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDKRFLKL LRFYILLTGI PVAIGITLI NVFIGEAELA EIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFFDGP EKNYERTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW ...文字列:
MAAMSLLHRA SVSAVAALSG RRLGTRLGFG GFLTRDFPKT VAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDKRFLKL LRFYILLTGI PVAIGITLI NVFIGEAELA EIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFFDGP EKNYERTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW FHYPTIDKEL IDHSPKATPD N

+
分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 15.460927 KDa
配列文字列:
(SAC)GYTPEEKLR LQQLRELRRR WLKDQELSPR EPVLPPQRVS PVERFWNKFL QDGALWKNVI YKTYRHSIFA FTHVLI PVW IIHYYLKYHV TTKPYTIVEK KPRIFPGDTI LETGEVIPPM KEFPDQHH

+
分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 12.298858 KDa
配列文字列:
MAGMSALKRL APFAHVGGHL FRGRCARAAG ARGVRRAGGG AHIEPRYRQF PQLTRSQVIQ AEFFSATMWF WILWRFWHDS DAVLGHFPY PDPSQWTDEE LGIPPDDED

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 11.160705 KDa
配列文字列:
MAHGHGHEHG PSKMELPDYK QWKIEGTPLE TVQEKLAARG LRDPWGRNEA WRYMGGFANN VSFVGALLKG FKWGFAAFVV AIGAEYYLE SQKKDKKHH

+
分子 #37: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 21.678459 KDa
配列文字列:
MAAARAGVLG VRWLQKAARN VVPLGARTAS HITKDMLPGP YPKTPEERAA AAKKYNMRVE DYEPYPDDGT GYGDYPKLPD RSQQERDPW YDWDHPDLRL NWGEPMHWDL DMYIRNRVDT SPTPVNWNLM CKHLFGFVAF MLFMFWVGET YPAYQPVGPK Q YPYNNLYL ERGGDPNKEP EPVVHYEI

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 15.20626 KDa
配列文字列:
MSFPKYEASR LSSLPTTLDP AEYDISSETR KAQAERLAIR SRLKREYQLQ YYDPSRRGVI EDPALVRWTY ARSANIYPNF RPNTKTSLL GALFGIGPLV FWYYVFKTDR DRKEKLIQEG KLDRTFNISY

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 21.827889 KDa
配列文字列:
MAFLSSGAYL THQQKVLRLY KRALRHLESW CIHRDKYRYF ACLLRARFDE HKNEKDMVKA TQLLREAEEE FWHGQHPQPY IFPESPGGT SYERYECYKV PEWCLDDWHP SEKAMYPDYF AKREQWKKLR RESWEREVKQ LQEETPVGGP RTEALPPARK Q GDLPPLWW HIVTRPRERP M

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 16.428846 KDa
配列文字列:
MGAHLARRYL GDASVEPDPL RMPTFPPDYG FPERKEREMV ATQQEMNDAQ LVLQQRDYCA HYLIRFLKCK RDSFPNFLAC KHERHDWDY CEHLDYVKRM KEFERERRLL QRKKRREQRE ADMAKGLGPG EVAPEVAL

+
分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 21.0009 KDa
配列文字列:
MPDSWDKDVY PEPPRRTPAP SPQTSLPNPI TYLTKAFDLL VDRPVTLVRE FIERQHAKNK YYYYHREFRR VPDITECQEK DVLCMFEAE MQWRRDYKVD QEIVNIIQER LKACQQREGE SHRQNCAKEL EQFTQVVKAY QDRYHDLGAH YSARKCLAKQ K QRMLAERK AAKEAAAA

+
分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 17.115508 KDa
配列文字列:
MELLQVLKRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG KNTFWDVDGS MVPPEWHRW LHCMTDDPPT VKPPTARKFI WTNHKFNLSG TPQQYVPYST TRKKIQEWVP PSTPYK

+
分子 #43: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 12.73762 KDa
配列文字列:
M(AYA)SATRFIQW LRNWASGRDL QAKLQLRYQE ISKRTQPPPK LPVGPSHKLS NNYYCTRDGR REAMPPSIVM SSQKVL VAG KPAESSAVAA SEKKAVSPAP PIKRWELSQD EPYL

+
分子 #44: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: cattle (哺乳類) / 組織: Heart
分子量理論値: 11.874492 KDa
配列文字列:
MAASLLLRQG RAGALKTVLL EAGVFRGVAP AVSLSAESGK NEKGLPPNPK KQSPPKKPVS AAPTEPFDNT TYKNLQHHDY STYTFLDLN LDLSKFRMPQ PSSGRESPRH

+
分子 #45: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 5 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #46: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 13 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / リン脂質*YM

+
分子 #47: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER

+
分子 #48: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #49: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE

+
分子 #50: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 4 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #51: DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE

分子名称: DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 3 / 式: LMT
分子量理論値: 510.615 Da
Chemical component information

ChemComp-LMT:
DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE / 可溶化剤*YM

+
分子 #52: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 1 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

+
分子 #53: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #54: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

+
分子 #55: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #56: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butan...

分子名称: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 2 / 式: EHZ
分子量理論値: 584.703 Da
Chemical component information

ChemComp-EHZ:
~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度3 mg/mL
緩衝液pH: 7.14
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMC4H12ClNO3Tris-HCl
150.0 mMNaClSodium Chloride
0.05 %C24H46O11dodecylmaltoside
グリッドモデル: UltrAuFoil R0.6/1 / 支持フィルム - 材質: GOLD / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 90 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR
詳細: Grid also covalently modified by peg-thiol in a nitrogen atmosphere for 48 hours.
凍結凍結剤: ETHANE / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: OTHER / 詳細: Map from unpublished dataset
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 18231
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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