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- EMDB-14004: Specific features and methylation sites of a plant 80S ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-14004
タイトルSpecific features and methylation sites of a plant 80S ribosome
マップデータ60S, 40S body and 40S head combined map.
試料
  • 複合体: 80S ribosome
    • タンパク質・ペプチド: x 73種
    • RNA: x 7種
  • リガンド: x 8種
キーワードSolanum lycopersicum / cytosolic ribosome / 80S / plant / rRNA / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


pectinesterase / pectinesterase activity / : / cell wall modification / pectin catabolic process / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / MAP kinase activity / protein-RNA complex assembly / translation regulator activity / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) ...pectinesterase / pectinesterase activity / : / cell wall modification / pectin catabolic process / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / MAP kinase activity / protein-RNA complex assembly / translation regulator activity / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / rescue of stalled ribosome / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / 90S preribosome / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of LSU-rRNA / ribosomal large subunit biogenesis / chloroplast / maturation of SSU-rRNA / small-subunit processome / protein kinase C binding / modification-dependent protein catabolic process / rRNA processing / protein tag activity / ribosome biogenesis / ribosome binding / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / protein ubiquitination / intracellular signal transduction / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / positive regulation of protein phosphorylation / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / nucleolus / RNA binding / zinc ion binding / ATP binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能
SPARK domain / SPARK / Pectinesterase, Asp active site / Pectinesterase signature 2. / Pectinesterase, catalytic / Pectinesterase / Pectin lyase fold / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L28e ...SPARK domain / SPARK / Pectinesterase, Asp active site / Pectinesterase signature 2. / Pectinesterase, catalytic / Pectinesterase / Pectin lyase fold / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L28e / Pectin lyase fold/virulence factor / Ribosomal protein L23 / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Mitogen-activated protein (MAP) kinase, conserved site / MAP kinase signature. / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L13e, conserved site / Ribosomal protein L13e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal L38e protein family / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / : / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S27e signature. / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal L40e family / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A
類似検索 - ドメイン・相同性
40S ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S15a-1 / 40S ribosomal protein S27 / Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein / 60S ribosomal protein L32 / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein S15 / KOW domain-containing protein / 40S ribosomal protein S18 / Uncharacterized protein ...40S ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S15a-1 / 40S ribosomal protein S27 / Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein / 60S ribosomal protein L32 / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein S15 / KOW domain-containing protein / 40S ribosomal protein S18 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 60S ribosomal protein L35a / 40S ribosomal protein S19 / Ribosomal protein L37 / Ribosomal eL28/Mak16 domain-containing protein / S5 DRBM domain-containing protein / 40S ribosomal protein S21 / 40S ribosomal protein S16 / 60S ribosomal protein L34 / 60S ribosomal protein L29 / Large ribosomal subunit protein uL6 N-terminal domain-containing protein / Ribosomal protein L19 / 40S ribosomal protein S4 / 40S ribosomal protein S26 / 60S ribosomal protein L36 / Ribosomal protein eL8/eL30/eS12/Gadd45 domain-containing protein / Protein kinase domain-containing protein / Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein / 60S ribosomal protein L27 / 40S ribosomal protein S7 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Large ribosomal subunit protein uL18 C-terminal eukaryotes domain-containing protein / KH type-2 domain-containing protein / Pectinesterase / 40S ribosomal protein S8 / Ribosomal protein L15 / 40S ribosomal protein S6 / Large ribosomal subunit protein uL4 C-terminal domain-containing protein / 40S ribosomal protein S24 / Large ribosomal subunit protein uL15/eL18 domain-containing protein / 60S ribosomal protein L22 / Small ribosomal subunit protein eS1 / 60S ribosomal protein L18a / 60S ribosomal protein L21 / TRASH domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein uS7 domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein eL14 domain-containing protein / 60S ribosomal protein L39 / 60S ribosomal protein L13 / Large ribosomal subunit protein uL6 alpha-beta domain-containing protein / 60S ribosomal protein L31 / Plectin/eS10 N-terminal domain-containing protein / Uncharacterized protein / Ubiquitin-like domain-containing protein / 40S ribosomal protein S28 / 60S ribosomal protein L41 / Small ribosomal subunit protein uS17 N-terminal domain-containing protein / 60S ribosomal protein L11 / 60S ribosomal protein L37a / 60S ribosomal protein L23 / Small ribosomal subunit protein uS15 N-terminal domain-containing protein / 30S ribosomal protein S12, chloroplastic / Thaliana 60S ribosomal protein L7 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL38 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Ribosomal protein S14 / 60S ribosomal protein L10 / Similar to 60S ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L3
類似検索 - 構成要素
生物種Solanum lycopersicum (トマト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.38 Å
データ登録者Cottilli P / Itoh Y / Amunts A
資金援助European Union, 4件
OrganizationGrant number国
Swedish Research CouncilNT_2015-04107European Union
European Research Council (ERC)ERC-2018-StG-805230European Union
Knut and Alice Wallenberg Foundation2018.0080European Union
European Molecular Biology Organization (EMBO)H2020-MSCA-IF-2017European Union
引用ジャーナル: Plant Commun / 年: 2022
タイトル: Cryo-EM structure and rRNA modification sites of a plant ribosome.
著者: Patrick Cottilli / Yuzuru Itoh / Yuko Nobe / Anton S Petrov / Purificación Lisón / Masato Taoka / Alexey Amunts /
要旨: Protein synthesis in crop plants contributes to the balance of food and fuel on our planet, which influences human metabolic activity and lifespan. Protein synthesis can be regulated with respect to ...Protein synthesis in crop plants contributes to the balance of food and fuel on our planet, which influences human metabolic activity and lifespan. Protein synthesis can be regulated with respect to changing environmental cues via the deposition of chemical modifications into rRNA. Here, we present the structure of a plant ribosome from tomato and a quantitative mass spectrometry analysis of its rRNAs. The study reveals fine features of the ribosomal proteins and 71 plant-specific rRNA modifications, and it re-annotates 30 rRNA residues in the available sequence. At the protein level, isoAsp is found in position 137 of uS11, and a zinc finger previously believed to be universal is missing from eL34, suggesting a lower effect of zinc deficiency on protein synthesis in plants. At the rRNA level, the plant ribosome differs markedly from its human counterpart with respect to the spatial distribution of modifications. Thus, it represents an additional layer of gene expression regulation, highlighting the molecular signature of a plant ribosome. The results provide a reference model of a plant ribosome for structural studies and an accurate marker for molecular ecology.
履歴
登録2021年12月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年8月3日-
マップ公開2022年8月3日-
更新2024年4月24日-
現状2024年4月24日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_14004.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_14004.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 600.7 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈60S, 40S body and 40S head combined map.
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.83 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.0352
最小 - 最大-0.31074727 - 0.6420937
平均 (標準偏差)0.0009516912 (±0.0125427935)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ540540540
Spacing540540540
セルA=B=C: 448.19998 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : 80S ribosome

全体名称: 80S ribosome
要素
  • 複合体: 80S ribosome
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: Ribos_L4_asso_C domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L18_c domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L6e_N domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Thaliana 60S ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L7Ae domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L14e domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: Pectinesterase
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL22
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein uL14
    • タンパク質・ペプチド: TRASH domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L23eN domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: KOW domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL31
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL33
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL34
    • タンパク質・ペプチド: Similar to 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL39
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL42
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein eL43
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_L28e domain-containing protein
    • RNA: tRNA
    • RNA: 25S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • RNA: 5.8S rRNA
    • RNA: 18S
    • タンパク質・ペプチド: KH type-2 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_S7 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: S10_plectin domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein eS19
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_S10 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein eS28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS14
    • タンパク質・ペプチド: Mitogen-activated protein kinase
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • RNA: tRNA_1
    • RNA: mRNA
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal_S17_N domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 40S body ribosomal protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: S5 DRBM domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S body ribosomal protein uS4
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a-1
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: SPERMINE
  • リガンド: SPERMIDINE
  • リガンド: 1,4-DIAMINOBUTANE
  • リガンド: beta-D-glucopyranose
  • リガンド: water

+
超分子 #1: 80S ribosome

超分子名称: 80S ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#80
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)

+
分子 #1: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 28.331898 KDa
配列文字列: MGRVIRAQRK GAGSVFKSHT HHRKGPARFR TLDFGERNGY LKGVITEVIH DPGRGAPLAR VTFRHPFRYK HQKELFVAAE GMYTGQFVY CGKKATLMVG NVLPLRSIPE GAVVCNVEHK VGDRGVFARC SGDYAIVISH NPDNGTTRVK LPSGAKKIVP S GCRAMIGQ ...文字列:
MGRVIRAQRK GAGSVFKSHT HHRKGPARFR TLDFGERNGY LKGVITEVIH DPGRGAPLAR VTFRHPFRYK HQKELFVAAE GMYTGQFVY CGKKATLMVG NVLPLRSIPE GAVVCNVEHK VGDRGVFARC SGDYAIVISH NPDNGTTRVK LPSGAKKIVP S GCRAMIGQ VAGGGRTEKP MLKAGNAYHK YRVKRNCWPK VRGVAMNPVE HPHGGGNHQH IGHASTVRRD APPGQKVGLI AA RRTGRLR GQARATAAKA DKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #2: Ribos_L4_asso_C domain-containing protein

分子名称: Ribos_L4_asso_C domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 44.852004 KDa
配列文字列: MATAAAIPTT TVQSLENDMA TDSAAVPLPA VMKAPIRPDV VTYVHSNISK NARQPYAVSR KAGHQTSAES WGTGRAVSRI PRVPGGGTH RAGQGAFGNM CRGGRMFAPT QTWRRWHRKI PVNQKRYAVA SAIAASSVPS LVLARGHRIE SVPELPLVVS D SVEGIEKT ...文字列:
MATAAAIPTT TVQSLENDMA TDSAAVPLPA VMKAPIRPDV VTYVHSNISK NARQPYAVSR KAGHQTSAES WGTGRAVSRI PRVPGGGTH RAGQGAFGNM CRGGRMFAPT QTWRRWHRKI PVNQKRYAVA SAIAASSVPS LVLARGHRIE SVPELPLVVS D SVEGIEKT SNAIKALKQI GAYPDAEKAK DSHAIRPGKG KMRNRRYISR KGPLIVYGTE GAKLVKAFRN IPGVEICHVD RL NLLKLAP GGHLGRFIIW TKCAYEKLDA IYGTFDKPSQ EKKGYLLPRP KMVNADLARI INSDEVQSVV RPIKKDVNKR ATL KKNPLK NLNVLLKLNP YAKTARRMSL LAEAQRVKAK KEKLDKKRHA ITKEEASAIK GASHSWYKTM ISDSDYAEFD NFTK WLGVS Q

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4 C-terminal domain-containing protein

+
分子 #3: Ribosomal protein L3

分子名称: Ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 44.518234 KDa
配列文字列: MSHRKFEHPR HGSLGFLPRK RAARHRGKVK AFPKDDPSKP CKLTAFLGYK AGMTHIVREV EKPGSKLHKK ETCEAVTIVE TPPMVIVGV VGYVKTPRGL RCLNTVWAQH LSEDIKRRFY KNWCKSKKKA FLKYSKKYET DEGKKDIQAQ LEKLKKYACV I RVLAHTQI ...文字列:
MSHRKFEHPR HGSLGFLPRK RAARHRGKVK AFPKDDPSKP CKLTAFLGYK AGMTHIVREV EKPGSKLHKK ETCEAVTIVE TPPMVIVGV VGYVKTPRGL RCLNTVWAQH LSEDIKRRFY KNWCKSKKKA FLKYSKKYET DEGKKDIQAQ LEKLKKYACV I RVLAHTQI RKMKGLKQKK AHLMEIQVNG GSIAQKVDFA YGFFEKQVPV DAVFQKDEMI DIIGVTKGKG YEGVVTRWGV TR LPRKT(HIC)R GLRKVACIGA WHPARVSFTV ARAGQNGYHH RTEMNKKVYK LGKVGQESHT ALTEFDRTEK DITPIGGFP HYGVVKEDYL LIKGCCVGTK KRVVTLRQSL LNQTSRVALE EIKLKFIDTS SKFGHGRFQT TQEKQKFYGR LKA

UniProtKB: Ribosomal protein L3

+
分子 #4: Ribosomal_L18_c domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L18_c domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 34.667316 KDa
配列文字列: MAFIKVQKTR AYFKRFQVKF KRRREGKTDY RARNRLINQD KNKYNTPKYR FVVRFTNKDI IAQIVSASIA GDMILASAYA NELPHYGLE VGLTNYAAAY CTGLLLARRV LKKLEMDEEY EGNLEVNGED YSVEPAESRR PFRALLDVGL LRTTTGNRVF G ALKGALDG ...文字列:
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UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18 C-terminal eukaryotes domain-containing protein

+
分子 #5: Ribosomal_L6e_N domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L6e_N domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 25.621484 KDa
配列文字列: MAAKKTIRNP ELIRGVGKFS RSKMYHKKGL WAIKKKNGGK LPLHEKKPAV AVAAVKPPKF YPADDVKKPL VNKHKPKPTK LRASITPGT VLIILAGRFK GKRVVFLKQL TSGLLLVTGP FKLNGVPLRR VNQAYVIGTS TKVDVSGVNV EKIDDKYFAK Q VEKKQKKG ...文字列:
MAAKKTIRNP ELIRGVGKFS RSKMYHKKGL WAIKKKNGGK LPLHEKKPAV AVAAVKPPKF YPADDVKKPL VNKHKPKPTK LRASITPGT VLIILAGRFK GKRVVFLKQL TSGLLLVTGP FKLNGVPLRR VNQAYVIGTS TKVDVSGVNV EKIDDKYFAK Q VEKKQKKG EGEFFEDKKE EKNVLPQEKK DEQKTVDSAL LKAIEGIPEL KAYLSARFSL KSGMKPHELV F

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6 N-terminal domain-containing protein

+
分子 #6: Thaliana 60S ribosomal protein L7

分子名称: Thaliana 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 28.057986 KDa
配列文字列: MGEGGVVVPE SVLKKQKRNE EWALVKKQEL AVAKKKSVEN RKLIYNRAKQ YAKEYSEQEK ELIRLKREAR LKGGFYVDPE AKLLFIIRI RGINAMPPQT KKILQLLRLR QIFNGVFLKV NKATVNMLHR VEPYVTYGYP NLKSIKELIY KRGYGKVDKQ R IALTDNAV ...文字列:
MGEGGVVVPE SVLKKQKRNE EWALVKKQEL AVAKKKSVEN RKLIYNRAKQ YAKEYSEQEK ELIRLKREAR LKGGFYVDPE AKLLFIIRI RGINAMPPQT KKILQLLRLR QIFNGVFLKV NKATVNMLHR VEPYVTYGYP NLKSIKELIY KRGYGKVDKQ R IALTDNAV VEQVLGKHGI ICIEDLVHEI ITVGPHFKEA NNFLWPFQLK APLGGLKKKR NHYVEGGDAG NRENFINELI RR MN

UniProtKB: Thaliana 60S ribosomal protein L7

+
分子 #7: Ribosomal_L7Ae domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L7Ae domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 29.362148 KDa
配列文字列: MAPKKGVAVS AKKKPEKAKV LNPLFEKRPK QFGIGGALPP KKDVTRNVRW PRNVTLQRKK RILKMRLKVP PALNQFTKTL DKNLATTLF KMLLKYRPED KAAKKERLVK RAQAEAEGKT PETKKPIIVK YGLKHITYLI EQNKAQLVVI AHDVDPIELV V WLPALCRK ...文字列:
MAPKKGVAVS AKKKPEKAKV LNPLFEKRPK QFGIGGALPP KKDVTRNVRW PRNVTLQRKK RILKMRLKVP PALNQFTKTL DKNLATTLF KMLLKYRPED KAAKKERLVK RAQAEAEGKT PETKKPIIVK YGLKHITYLI EQNKAQLVVI AHDVDPIELV V WLPALCRK MEIPYCIVKG KARLGSIVHK KTASALCLTT VKNEDKMEFS RVLEAIKANF NDKYEENRKK WGGGIMGSKS QA RTKAKER VLAKEAAQRL N

UniProtKB: Ribosomal protein eL8/eL30/eS12/Gadd45 domain-containing protein

+
分子 #8: 60S ribosomal protein uL6

分子名称: 60S ribosomal protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 22.004582 KDa
配列文字列: MKTILSSETM DIPDGITIKV KAKQIEVEGP RGKLTRNFKH LNLDFQLIKD EETGKKKLKI DAWFGSRKTT AAIRTALSHV ENLITGVTK GYRYKMRFVY AHFPINASIS GGNKSIEIRN FLGEKKVRKV DMLDGVTVVR SEKVKDELVL DGNDIELVSR S AALINQKC ...文字列:
MKTILSSETM DIPDGITIKV KAKQIEVEGP RGKLTRNFKH LNLDFQLIKD EETGKKKLKI DAWFGSRKTT AAIRTALSHV ENLITGVTK GYRYKMRFVY AHFPINASIS GGNKSIEIRN FLGEKKVRKV DMLDGVTVVR SEKVKDELVL DGNDIELVSR S AALINQKC HVKNKDIRKF LDGIYVSEKG RIAEEE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6 alpha-beta domain-containing protein

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 24.913289 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR QIKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIYDVGMKK KGVDEFPFCV HLVSWEKENV SSEALEAARI ACNKYMTKSA GKDAFHLRV RVHPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGVCARV AIGQVLLSVR CKDGNANHAQ EALRRAKFKF P GRQKIIVS ...文字列:
MGRRPARCYR QIKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIYDVGMKK KGVDEFPFCV HLVSWEKENV SSEALEAARI ACNKYMTKSA GKDAFHLRV RVHPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGVCARV AIGQVLLSVR CKDGNANHAQ EALRRAKFKF P GRQKIIVS RKWGFTKFSR TDYLKYKSEN RIVPDGVNAK LLGCHGRLAA RQPGRAFLEA AN

UniProtKB: 60S ribosomal protein L10

+
分子 #10: 60S ribosomal protein uL5

分子名称: 60S ribosomal protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 20.826176 KDa
配列文字列:
MASEKKLSNP MRDIKVQKLV LNISVGESGD RLTRAAKVLE QLSGQSPVFS KARYTVRSFG IRRNEKIACY VTVRGEKAMQ LLESGLKVK EYELLRRNFS ETGCFGFGIQ EHIDLGIKYD PSTGIYGMDF YVVLERPGYR VARRRRCKSR VGIQHRVTKE D SMKWFQVK YEGVILNKSS NIQ

UniProtKB: 60S ribosomal protein L11

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 23.620619 KDa
配列文字列: MKHNNVIPNG HFKKHWQNYV RTWFNQPARK TRRRAARQKK AATIFPRPTA GSLRPIVHGQ TLKYNMKVRA GRGFSLEELK AAGIPKKLA PTIGIAVDHR RRNRSLEGLQ TNVQRLKTYK AKLVIFPRRA KKVKAGDSSA EELANATQVQ GPYLPIVRDQ P AIELVKIT ...文字列:
MKHNNVIPNG HFKKHWQNYV RTWFNQPARK TRRRAARQKK AATIFPRPTA GSLRPIVHGQ TLKYNMKVRA GRGFSLEELK AAGIPKKLA PTIGIAVDHR RRNRSLEGLQ TNVQRLKTYK AKLVIFPRRA KKVKAGDSSA EELANATQVQ GPYLPIVRDQ P AIELVKIT DEMKSFKAYG KLRIERTNAR HFGARLKRAA EAEKEEKK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L13

+
分子 #12: Ribosomal_L14e domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L14e domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.400435 KDa
配列文字列:
MPFKRFVEIG RVALINYGKD YGRLVVIVDV IDQNRALVDA PDMVRSQMNF KRLSLTDIKI DIKRIPKKKT LVEAMEAADV KTKWENSSW GRKLIVQKRR AALNDFDRFK LMLAKIKRAG VVRQELAKLK KIAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14 domain-containing protein

+
分子 #13: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 24.23327 KDa
配列文字列: MGAYTYVSEL WRKKQSDVMR FLQRVRCWEY RQLPSIVRVT RPTRPDKARR LGYKAKQGYV VYRVRVKRGG RKRPVSKGIV YGKPTNQGV TQLKFQRSKR SVAEERAGRK LGGLKVLNSY WINEDSTYKY FEVILVDQAH AAIRNDPRIN WICNPVHKHR E LRGLTSAG ...文字列:
MGAYTYVSEL WRKKQSDVMR FLQRVRCWEY RQLPSIVRVT RPTRPDKARR LGYKAKQGYV VYRVRVKRGG RKRPVSKGIV YGKPTNQGV TQLKFQRSKR SVAEERAGRK LGGLKVLNSY WINEDSTYKY FEVILVDQAH AAIRNDPRIN WICNPVHKHR E LRGLTSAG KKYRGLRGRG HLHHKARPSR RATWKRNQTL SLRRYR

UniProtKB: Ribosomal protein L15

+
分子 #14: Pectinesterase

分子名称: Pectinesterase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: pectinesterase
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 23.613238 KDa
配列文字列: MVSGSGISAR RIVVDARHHM LGRLSSILAK ELLNGQRVVV VRCEEICLSG GLVRQKMKYL RFLRKRMNTK PSHGPIHFRA PSKILWRTI RGMIPHKTKR GAAALARLKV YEGVPPPYDK IKRMVIPDAL KVLRLQSGHK YCLLGKLSSE VGWNHYDTIK E LENKRKER ...文字列:
MVSGSGISAR RIVVDARHHM LGRLSSILAK ELLNGQRVVV VRCEEICLSG GLVRQKMKYL RFLRKRMNTK PSHGPIHFRA PSKILWRTI RGMIPHKTKR GAAALARLKV YEGVPPPYDK IKRMVIPDAL KVLRLQSGHK YCLLGKLSSE VGWNHYDTIK E LENKRKER AQVAYERRKQ LAKLRVKAEK AAEEKLGPQL AVIEPIKY

UniProtKB: Pectinesterase

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L22, chloroplastic

分子名称: 50S ribosomal protein L22, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 19.785711 KDa
配列文字列:
MVKYSREPDN PTKSCKSRGS SLRVHFKNTR ETAHALRKMP LDKAKSYLED VLAHKQAIPF TRFCRGVGRT AQAKNRHSNG QGRWPVKSA GFILDLLKNA ESNAEVKGLD VDSLYISHIQ VNEAQKQRRR TYRAHGRINP YMSHPCHIEL ILSEKEESVK K EPETQLAP RKAKA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #16: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 20.764543 KDa
配列文字列:
MGIDLVAGGK SKKTKRTAPK SDDVYLKLLV KLYRFLARRT GSKFNAVILK RLFMSKINKP PLSLSRLITY ATGKGDNIVV LVGTVTDDV RAYEVPKIKV CALKFTETAR ARIEKAGGEC LTFDQLALRA PLGQNTLLLR GPKNSREAVK HFGPAPGVPH S HTKPYVRA KGRKFERARG KRNSRGYKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15/eL18 domain-containing protein

+
分子 #17: Ribosomal protein L19

分子名称: Ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 24.786572 KDa
配列文字列: MVSLKLQKRL AASVLKCGRG KVWLDPNEGN EISMANSRQN IRKLVKDGFI IRKPTKIHSR SRARRMKEAK RKGRHSGYGK RKGTREARL PTKVLWMRRL RVLRRLLRKY RESKKIDKHM YHDMYMKVKG NVFKNKRVLM ENIHKTKAEK AREKTLSDQF E ARRAKNKA ...文字列:
MVSLKLQKRL AASVLKCGRG KVWLDPNEGN EISMANSRQN IRKLVKDGFI IRKPTKIHSR SRARRMKEAK RKGRHSGYGK RKGTREARL PTKVLWMRRL RVLRRLLRKY RESKKIDKHM YHDMYMKVKG NVFKNKRVLM ENIHKTKAEK AREKTLSDQF E ARRAKNKA SRERKFARRK KRLAQGPGGE KPVQPAAPAA AAPAQPAQGS KKSKK

UniProtKB: Ribosomal protein L19

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 21.476303 KDa
配列文字列:
MVTYKFHQYQ VVGRALPSEN DEHPKIYRMK LWATNEVRAK SKFWYFLRKL KKVKKSNGQM LAINEIFEKY PTTIKNYGIW LRYQSRTGY HNMYKEYRDT TLNGAVEQMY TEMASRHRVR HHCIQIIKTA TIPAKLCKRE STKQFHDSKI KFPLVFKKVR P PSRKLKTT YKATKPNLFM

UniProtKB: 60S ribosomal protein L18a

+
分子 #19: 60S ribosomal protein eL21

分子名称: 60S ribosomal protein eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 18.715795 KDa
配列文字列:
MPAGHGLRSR TRDSFSRAFR KKGTIALSTY LRIFKIGDYV DIKVNGAIHK GMPHKFYHGR TGRVWNVTKR AVGVEVNKQV RNKILRKRI HVRIEHVQQS RCTEEVRERI KKNDQLKADA KARGEVISTK RQPLGPKPGF MVEGATLETV TPIPYDVVND L KGGY

UniProtKB: 60S ribosomal protein L21

+
分子 #20: 60S ribosomal protein eL22

分子名称: 60S ribosomal protein eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 13.996085 KDa
配列文字列:
MSRAAAAVKG GKKKGASFVI DCSKPVEDSI MEIASLDKFL QERIKVGGKA GALGDSVTVT RDKNKITVTC NSTFSKRYLK YLVKKYLKK NNVRDWLRVI ASNKDRNVYE LRYFNIAENE ADEED

UniProtKB: 60S ribosomal protein L22

+
分子 #21: 60S ribosomal protein uL14

分子名称: 60S ribosomal protein uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.040856 KDa
配列文字列:
MSKRGRGGSA GNKFRMSLGL PVAATVNCAD NTGAKNLYII SVKGIKGRLN RLPSACVGDM VMATVKKGKP DLRKKVMPAV IVRQRKPWR RKDGVFMYFE DNAGVIVNPK GEMKGSAITG PIGKECADLW PRIASAANAI V

UniProtKB: 60S ribosomal protein L23

+
分子 #22: TRASH domain-containing protein

分子名称: TRASH domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 18.712115 KDa
配列文字列:
MMVLKTELCR FSGAKIYPGR GIRFIRSDSQ VFLFVNSKCK HYFHNKLKPS KLTWTAMYRK QHKKDIAQEA AKKRRRTTKK PYSRSIVGA TLEVIQKKRT ERPEVRDAAR EAALREIKER IKKTKDEKKA KKAEVQAKSQ KAGGKGNMSK GGASKGPKLG G GGGKR

UniProtKB: TRASH domain-containing protein

+
分子 #23: Ribosomal_L23eN domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L23eN domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 17.427744 KDa
配列文字列:
MAPAKVDLTK KKDPKAQAVK AAKAVKSGST FKKKSSKIRT KVTFHRPKTL KKDRSPKYPR VSAPGRNRLD QYAILKYPLT TESAMKKIE DNNTLVFIVD IKADKKKIKD AVKKMYDIQI KKVNTLIRPD GTKKAYVRLT PDYDALDVAN KIGII

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein

+
分子 #24: KOW domain-containing protein

分子名称: KOW domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.750533 KDa
配列文字列:
MKYNPRVSSS RRKSRKAHFT APSSVRRVLM SAPLSSELRA KYNVRSMPVR KDDEVQVVRG TYKGREGKVV QVYRKKWVIH IERITREKV NGSTVNVGIN PSKVVVSKLR LDKDRRSLLD RKAKGRAAAD KDKGTKFTTE EIMQAID

UniProtKB: KOW domain-containing protein

+
分子 #25: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.698643 KDa
配列文字列:
MVKFLKPNKA VILLQGKYAG RKAVIVRAFD EGTRDRPYGH CLVAGISKYP KKVIRKDSAK KQAKKSRVKA FIKLVNYNHI MPTRYTLDV DLKDVVNADV LQARDKKVTA AKETKARFEE RFKTGKNRWF FTKLRF

UniProtKB: 60S ribosomal protein L27

+
分子 #26: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.479389 KDa
配列文字列:
MTTRFKKNRK KRGHVSAGHG RIGKHRKHPG GRGNAGGMHH HRILFDKYHP GYFGKVGMRY FHKLRNKFYC PTVNIDTLWS LVPQEVKDK AAANKGTAPL IDVTQFGYFK VLGKGVLPTG QPVVVKAKLI SKNAEKKIKE NGGAVVLTA

UniProtKB: Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 6.989926 KDa
配列文字列:
MAKSKNHTAH NQSYKAHRNG IKKPKSHRHS STKGMDPKFL RNQRYARKHN KKNGETAAEE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L29

+
分子 #28: 60S ribosomal protein eL30

分子名称: 60S ribosomal protein eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 12.367472 KDa
配列文字列:
MVAAKKTKKT HESINNRLAL VMKSGKYTLG YKTVLKTIRS SKGKLVIIAN NCPPLRKSEI EYYAMLAKVG VHHYNGNNVD LGTACGKYY RVSCLSIIDP GDSDIIKSLP SDQ

+
分子 #29: 60S ribosomal protein eL31

分子名称: 60S ribosomal protein eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 13.890225 KDa
配列文字列:
MVEKTKGRKE EVVSREYTIN LHKRLHGCTF KKKAPTAIKE IRKFAQKAMG TKDVRVDVKL NKQIWSRGIR SVPRRVRVRI ARKRNDDED AKEELYSLVT VAEIPAEGLK GLGTKIIEDE E

UniProtKB: 60S ribosomal protein L31

+
分子 #30: 60S ribosomal protein eL32

分子名称: 60S ribosomal protein eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.673507 KDa
配列文字列:
MAVPLLNKKV VKKRVKRFIR PQSDRRITVK ESWRRPKGID SRVRRKFKGC VLMPNIGYGS DKKTRHYLPN GFKKFVVHNA SELEILMMH NRTYCAEIAH NVSTRKRKEI VERAAQLDVV ITNKLARLHS QEDE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L32

+
分子 #31: 60S ribosomal protein eL33

分子名称: 60S ribosomal protein eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 12.952167 KDa
配列文字列:
MVKGRQGERI RLYVRGTVLG YKRSKSNQYP NTSLIQIEGV NTKEEVDWYL GKRLGYIYKA KTKKNNSHYR CIWGKVCRPH GNSGVVRAK FKSNLPPKSM GAKVRVFMYP SNI

UniProtKB: 60S ribosomal protein L35a

+
分子 #32: 60S ribosomal protein eL34

分子名称: 60S ribosomal protein eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 13.815384 KDa
配列文字列:
MVQRLTYRKR HSYATKSNQH RVVKTPGGKL IYQTTKKRAN GPKCPVTGKR IQGIPHLRPA EYKRSRLSRN RRTVNRAYGG VLSGSAVRE RIIRAFLVEE QKIVKKVLKI QKAKEKLASK S

UniProtKB: 60S ribosomal protein L34

+
分子 #33: Similar to 60S ribosomal protein L35

分子名称: Similar to 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 14.324415 KDa
配列文字列:
MARIKVHELR NKSKTELLAQ LKDLKAELAL LRVAKVTGGA PNKLSKIKVV RLSIAQVLTV ISQKQKAALR EVYKNKKYLP LDLRPKKTR AIRKRLTKHQ SSLKTEREKK KEMYFPLRKY AIKV

UniProtKB: Similar to 60S ribosomal protein L35

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 12.406898 KDa
配列文字列:
MAPKQPNTGI SVGLNKGHVV TKKELAPRPS DRKGKTSKRI HFVRSLIREV AGFAPYEKRI TELLKVGKDK RALKVAKRKL GTHKRAKKK REEMSSVLRK MRATGGGEKK K

UniProtKB: 60S ribosomal protein L36

+
分子 #35: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 10.809628 KDa
配列文字列:
MGKGTGSFGK RRNKTHTLCV RCGRRSFHLQ KSRCSACAYP AARLRSYNWS VKAIRRKTTG TGRMRYLRNV PRRFKTNFRE GTEAAPRKK GTAASA

UniProtKB: Ribosomal protein L37

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 8.101704 KDa
配列文字列:
MPKQIHEIKD FLLTARRKDA RTVKIKKNKD MVKFKVRCSK YLYTLCVSDF EKADKLKQSL PPGLSVQDL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL38

+
分子 #37: 60S ribosomal protein eL39

分子名称: 60S ribosomal protein eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 6.489813 KDa
配列文字列:
MPSHKSFMIK KKLAKKQRQN RPIPYWIRMR TDNTIRYNAK RRHWRRTKLG F

UniProtKB: 60S ribosomal protein L39

+
分子 #38: Ubiquitin

分子名称: Ubiquitin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 14.745399 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVESS DTIDNVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLADYN IQKESTLHLV LRLRGGIIEP SLMALARKY NQEKMICRKC YARLHPRAVN CRKRKCGHSN QLRPKKKIK

UniProtKB: Ubiquitin-like domain-containing protein

+
分子 #39: 60S ribosomal protein eL42

分子名称: 60S ribosomal protein eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 12.037346 KDa
配列文字列:
MVNVPKTKKT YCKSKECKKH TLHKVTQYKK GKDSLAAQGK RRYDRKQSGY GGQTKPVFHK KAKTTKKIVL RLQCQGCKHV SQHPIKRCK HFEIGGDKKG KGTSLF

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #40: 60S ribosomal protein eL43

分子名称: 60S ribosomal protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 10.280108 KDa
配列文字列:
MTKRTKKAGI VGKYGTRYGA SLRKQIKKME VSQHSKYFCE FCGKYAVKRK AVGIWGCKDC GKVKAGGAYT LNTASAVTVR STIRRLREQ TES

UniProtKB: 60S ribosomal protein L37a

+
分子 #41: Ribosomal_L28e domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_L28e domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.018641 KDa
配列文字列:
M(THC)TVPGQLVW EIVKKNNSFL VKEFGNGTAG VVFSKEPNNL YNLHSYKHSG LANKKTVTIQ PDGKDKSVLL ATSKTK KQN KPSRLLNKSV MKKEFSRMAK AVTNQVGDNY YRPDLKKAAL ARLSAVHRSL KVTKSGAKKR NRQA

UniProtKB: Ribosomal eL28/Mak16 domain-containing protein

+
分子 #47: KH type-2 domain-containing protein

分子名称: KH type-2 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 26.828357 KDa
配列文字列: MAKQSVQMSK KRKFVADGVF FAELNEVLTR ELAEDGYSGV EVRVTPMRTE IIIRATRTQN VLGDKGRRIR ELTSVVQKRF NFDENTVEL YAEKVNNRGL CAIAQAESLR YKLLGGLAVR RACYGVLRFI MESGAKGCEV IVSGKLRAQR AKSMKFKDGY M ISSGQPVK ...文字列:
MAKQSVQMSK KRKFVADGVF FAELNEVLTR ELAEDGYSGV EVRVTPMRTE IIIRATRTQN VLGDKGRRIR ELTSVVQKRF NFDENTVEL YAEKVNNRGL CAIAQAESLR YKLLGGLAVR RACYGVLRFI MESGAKGCEV IVSGKLRAQR AKSMKFKDGY M ISSGQPVK EYIDSAVRHV LLRQGVLGIK VKIMLDWDPK GKQGPTTPLP DLVTIHPPKE EEEYLRLPVA APVEIDPPIV V

UniProtKB: KH type-2 domain-containing protein

+
分子 #48: Ribosomal_S7 domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_S7 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 23.686199 KDa
配列文字列: MEEASVVAVD NQKPQQEKPH TDVLLFNRWS YDGVQIADMS VEDYITATAN KHPTYMPHTA GRYQAKRFRK AQCPIVERLT NSLMMHGRN NGKKLMAVRI IKHAMEIIHL LTDQNPIQVI VDAVINSGPR EDATRIGSAG VVRRQAVDIS PLRRVNQAIY L LTTGARES ...文字列:
MEEASVVAVD NQKPQQEKPH TDVLLFNRWS YDGVQIADMS VEDYITATAN KHPTYMPHTA GRYQAKRFRK AQCPIVERLT NSLMMHGRN NGKKLMAVRI IKHAMEIIHL LTDQNPIQVI VDAVINSGPR EDATRIGSAG VVRRQAVDIS PLRRVNQAIY L LTTGARES AFRNIKTIAE CLADELINAA KGSSNSYAIK KKDEIERVAK ANR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7 domain-containing protein

+
分子 #49: S10_plectin domain-containing protein

分子名称: S10_plectin domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 19.882539 KDa
配列文字列:
MIIPEKNRRE ISKYLFQEGV CFAKKDYNLA KHPNIDVPNL QVIKLMQSFK SKEYVRETFA WMHYYWYLTN DGIEFLRTYL NLPSEIVPA TLKKSAKPLG RPMGGPPGDR PRGPPRFEGD RPRFGDRDGY RAGPRGPPGE FGGEKGGAPA DYQPAFRGGG G RPGFGRGA GGFGGAPPSS SS

UniProtKB: Plectin/eS10 N-terminal domain-containing protein

+
分子 #50: 40S ribosomal protein uS19

分子名称: 40S ribosomal protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 17.352471 KDa
配列文字列:
MAEVEADVAT GQPRKRTFKK FSYRGVDLDS LLDMSTDELV KLYPARPRRR FQRGLKRKPM ALIKKLRKAK REAPQGEKPE VVRTHLRNM IIVPEMIGSV IGIYNGKTFN QIEVKPEMIS HYLAEFSISY KPVKHGRPGI GATHSSRFIP LK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S15

+
分子 #51: 40S ribosomal protein uS9

分子名称: 40S ribosomal protein uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.805812 KDa
配列文字列:
MQAAPATVES VQCFGRKKTA VAVTHCKRGR GLIKINGVPI ELVQPEILRY KAFEPILLLG RHRFAGVDMR IRVKGGGHTS QIYAIRQSI AKALVAFYQK YVDEQQKKEI KDILIRYDRT LLVADPRRCE PKKFGGRGAR SRFQKSYR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S16

+
分子 #52: 40S ribosomal protein uS13

分子名称: 40S ribosomal protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 17.574461 KDa
配列文字列:
MSLVANEEFQ HILRVQNTNV DGKQKIMFAL TSIKGIGRRF ANIACKKADI DMNKRAGELT AAELDSLMVV VANPRQFKIP DWFLNRQKD YKDGKFSQVT SNALDMKLRD DLERLKKIRN HRGLRHYWGL RVRGQHTKTT GRRGKTVGVS KKR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S18

+
分子 #53: 40S ribosomal protein eS19

分子名称: 40S ribosomal protein eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.056355 KDa
配列文字列:
MEPARSVKDV SPHDFVKAYA AHLKRSGKLE LPEWTDIVKT GKLKELAPYD PDWYYIRAAS MARKIYLRGG IGVGGFRRIY GGNQRNGSR PRHFCKSSGS VARHILQQLQ TMNIIDFDPK GGRRITSNGQ RDLDQVAGRI SAAN

UniProtKB: 40S ribosomal protein S19

+
分子 #54: Ribosomal_S10 domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_S10 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 13.735125 KDa
配列文字列:
MAAYAAMKPT KPGLEEPAEM IHKIRITLSS KNVKNLEKVC ADLVRGAKDK RLRVKGPVRM PTKVLNITTR KSPCGEGTNT WDRFELRVH KRVIDLFSSP DVVKQITSIT IEPGVEVEVT IAES

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein

+
分子 #55: 40S ribosomal protein eS28

分子名称: 40S ribosomal protein eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 7.551849 KDa
配列文字列:
MESVTKHAIV IKIMGRTGSR GQVTQVRVKF LDDQNRFIMR NVKGPVREGD ILTLLESERE ARRLR

UniProtKB: 40S ribosomal protein S28

+
分子 #56: 40S ribosomal protein uS14

分子名称: 40S ribosomal protein uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 6.455581 KDa
配列文字列:
MGHSNIWNAH PKNYGPGSRT CRVCGNPHAI IRKYGLMCCR QCFRSNAKEI GFIKYR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #57: Mitogen-activated protein kinase

分子名称: Mitogen-activated protein kinase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: mitogen-activated protein kinase
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 35.993617 KDa
配列文字列: MSQESLVLRG TMKAHTDWVT AIATPIDNSD MIVTSSRDKS IIVWSLTKDG SQYGVPRRRL TGHGHFVEDV VLSSDGMFAL SGSWDGELR LWDLQAGTTA RRFVGHTKDV LSVAFSVDNR QIVSASRDKT IKLWNTLGEC KYTIQEQDSH SDWVSCVRFS P NNLQPTIV ...文字列:
MSQESLVLRG TMKAHTDWVT AIATPIDNSD MIVTSSRDKS IIVWSLTKDG SQYGVPRRRL TGHGHFVEDV VLSSDGMFAL SGSWDGELR LWDLQAGTTA RRFVGHTKDV LSVAFSVDNR QIVSASRDKT IKLWNTLGEC KYTIQEQDSH SDWVSCVRFS P NNLQPTIV SGSWDRTVKI WNLTNCKLRS TLAGHSGYVN TVAVSPDGSL CASGGKDGVI LLWDLAEGKK LYSLDAGSII HT LCFSPNR YWLCAATESS IKIWDLESKS IVVDLKVDLK QESEMFGTAA TDSKTKVIYC TSLSWSADGS TLFSGYTDGL IRV WGIGRY

UniProtKB: Protein kinase domain-containing protein

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 11.995226 KDa
配列文字列:
MAPKKEKAPP PSSKPAKSGG GKQKKKKWSK GKQKEKVNNM VLFDKGTYDK LITEAPKYKL ITPSVLSDRL RISGSLARKA IRELMAKGL IRMVSAHASQ QIYTRATNT

UniProtKB: 40S ribosomal protein S25

+
分子 #61: 60S ribosomal protein L41

分子名称: 60S ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 3.445437 KDa
配列文字列:
MRAKWKKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L41

+
分子 #62: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 32.21625 KDa
配列文字列: MATQDVRTLS TKEADIQMML AAEVHLGTKN CDFQMERYAF KRRNDGIYII NLGKTWEKLQ MAARVIVAIE NPQDIIVQSA RPYGQRAVL KFAQYTGAHA IAGRHTPGTF TNQLQTSYSE PRLLILTDPR TDHQPIKEAA LGNIPTIAFC DTDSPMRYVD I GIPANNKG ...文字列:
MATQDVRTLS TKEADIQMML AAEVHLGTKN CDFQMERYAF KRRNDGIYII NLGKTWEKLQ MAARVIVAIE NPQDIIVQSA RPYGQRAVL KFAQYTGAHA IAGRHTPGTF TNQLQTSYSE PRLLILTDPR TDHQPIKEAA LGNIPTIAFC DTDSPMRYVD I GIPANNKG KHSIGVLFWI LARMVLQMRG AINQGPKWDV MVDLFFYREP EEAKEQEEEV PAIADYADYS ASAALGGDWT SS QIPEAQW TADAAAPAVG GGWAGDGAAD GGWDAAAAPA PVPLPVPDVA PTSGATGWE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 29.741465 KDa
配列文字列: MAVGKNKRIS KGKKGGKKKA ADPYAKKDWY DIKAPSVFEV RNVGKTLVTR TQGTKIASEG LKHRVFEVSL ADLQNDEDHS FRKIRLRAE DVQGRNVLTN FHGMDFTTDK LRSLVKKWQS LIEAHVDVKT TDSYTLRMFC IAFTKKRPNQ QKRTCYAQSS Q IRQIRRKM ...文字列:
MAVGKNKRIS KGKKGGKKKA ADPYAKKDWY DIKAPSVFEV RNVGKTLVTR TQGTKIASEG LKHRVFEVSL ADLQNDEDHS FRKIRLRAE DVQGRNVLTN FHGMDFTTDK LRSLVKKWQS LIEAHVDVKT TDSYTLRMFC IAFTKKRPNQ QKRTCYAQSS Q IRQIRRKM VEIMRNQAQS CDLKDLVLKF IPESIGREIE KATSSIFPLQ NVFIRKVKIL KAPKFDLGRL MEVHGDYSED VG VKVDRPA EDIATEPTEV VGA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 29.95915 KDa
配列文字列: MARGLKKHLK RLNAPKHWML DKLGGAFAPK PSSGPHKSRE CLPLVIILRN RLKYALTYRE VISILMQRQV MVDGKVRTDK TYPAGFMDV VTIPKTNESF RLLYDTKGRF RLHSLRDEEA KFKLCKVRSV QFGQKGIPYL NTYDGRTIRY PDPLIKANDT I KLDLDSNK ...文字列:
MARGLKKHLK RLNAPKHWML DKLGGAFAPK PSSGPHKSRE CLPLVIILRN RLKYALTYRE VISILMQRQV MVDGKVRTDK TYPAGFMDV VTIPKTNESF RLLYDTKGRF RLHSLRDEEA KFKLCKVRSV QFGQKGIPYL NTYDGRTIRY PDPLIKANDT I KLDLDSNK IVDFIKFDVG NVVMVTGGRN RGRVGILKNR EKHKGSFETV HIQDSQGHEF ATRLGNVFTL GKGSKPWVSL PK GKGIKLS IIEEARKRMA AQSATPA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S4

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 22.088475 KDa
配列文字列: MYTSKQKIHK DKAAEPSEHE VSVGQAFFDL ENTNQELKSE LKDLYINSAT QIDVSGNRKA VVIHVPYRLR KAFRKVHVRL VRELEKKFS GKDVIFIATR RIVRPPKRGS AAQRPRTRTL TSVHDAILED LVVPAEIVGK RTRYRVDGSK IMKVYLDPKE R NNTEYKLE ...文字列:
MYTSKQKIHK DKAAEPSEHE VSVGQAFFDL ENTNQELKSE LKDLYINSAT QIDVSGNRKA VVIHVPYRLR KAFRKVHVRL VRELEKKFS GKDVIFIATR RIVRPPKRGS AAQRPRTRTL TSVHDAILED LVVPAEIVGK RTRYRVDGSK IMKVYLDPKE R NNTEYKLE TFSAVYRKLS GKDVVFEYPI TEA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S7

+
分子 #66: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 24.918656 KDa
配列文字列: MGISRDSMHK RRATGGKKKS WRKKRKYELG RQPANTKISS NKTVRRIRVR GGNVKWRALR LDTGNFSWGS EAVTRKTRIL DVVYNASNN ELVRTQTLVK SAIVQVDAAP FKQWYLQHYG IDIGRKKKGA AKKETTTEEG DAAEEAKKSN HVVRKIENRQ A DRKLDSHL ...文字列:
MGISRDSMHK RRATGGKKKS WRKKRKYELG RQPANTKISS NKTVRRIRVR GGNVKWRALR LDTGNFSWGS EAVTRKTRIL DVVYNASNN ELVRTQTLVK SAIVQVDAAP FKQWYLQHYG IDIGRKKKGA AKKETTTEEG DAAEEAKKSN HVVRKIENRQ A DRKLDSHL EEQFASGRLL ACISSRPGQC GRADGYILEG KELEFYMKKL QKKKGKASGA SA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S8

+
分子 #67: Ribosomal_S17_N domain-containing protein

分子名称: Ribosomal_S17_N domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 17.740814 KDa
配列文字列:
MAEQTEKAFL KQPGVFLSSK KTGKGKRPGK GGNRYFKSIG LGFKTPREAT EGTYIDKKCP FTGNVSIRGR ILAGTCHSAK MNRTIIVRR NYLHYVKKYQ RYEKRHSNIP AHISPCFRVK EGDHVTIGQC RPLSKTVRFN VLKVIPAGSG GVGKKAFTGM

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17 N-terminal domain-containing protein

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.265969 KDa
配列文字列:
MGRVRTKTVK KSSRQVIERY YSKMTLDFHT NKKILEEVAI IPSKRLRNKI AGFSTHLMKR IQKGPVRGIS LKLQEEERER RMDFVPEES AIKTDLIEVD KETLDMLSAL GMSDLPGVVK QAAEPQAVAA LPSYGRGGGG FGRKY

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #69: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 9.163203 KDa
配列文字列:
MQNDEGQNMD LYIPRKCSAT NRLITSKDHA SVQLNVGHLD ESGVYTGQFT TYALCGFIRA QGDADSAMDR LWQKKKAEVG QQ

UniProtKB: 40S ribosomal protein S21

+
分子 #70: 40S body ribosomal protein uS12

分子名称: 40S body ribosomal protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.771567 KDa
配列文字列:
MGKTRGMGAG RKLKSHRRRQ RWADKSYKKS HLGNEWKKPF AGSSHAKGIV LEKIGIEAKQ PNSAIRKCAR VQLIKNGKKI AAFVPNDGC LNYIEENDEV LIAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVSGVSL LALFKEKKEK PRS

UniProtKB: 30S ribosomal protein S12, chloroplastic

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 14.608212 KDa
配列文字列:
MTFKRRNGGR NKHGRGHVKF IRCSNCGKCC PKDKAIKRFL VRNIVEQAAV RDVQEACAFE LYTLPKLYLK MQYCVSCAIH SKVVRVRSR TDRRVREPPQ RFRRPRDDLP KTGQAPRPAG GPPAAPRT

UniProtKB: 40S ribosomal protein S26

+
分子 #72: S5 DRBM domain-containing protein

分子名称: S5 DRBM domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 30.630678 KDa
配列文字列: MAERGAGDRG GFGRGFGGRG GRGGDRGGRG RGGRRPRRET EEEKWVPVTK LGRLVKDGKI RSLEQIYLHS LPIKEFQIID TLIGPSLKD EVMKIMPVQK QTRAGQRTRF KAFVVVGDGN GHVGLGVKCS KEVATAIRGG IILAKLSVIP VRRGYWGNKI G KPHTVPCK ...文字列:
MAERGAGDRG GFGRGFGGRG GRGGDRGGRG RGGRRPRRET EEEKWVPVTK LGRLVKDGKI RSLEQIYLHS LPIKEFQIID TLIGPSLKD EVMKIMPVQK QTRAGQRTRF KAFVVVGDGN GHVGLGVKCS KEVATAIRGG IILAKLSVIP VRRGYWGNKI G KPHTVPCK VTGKCGSVTV RMVPAPRGAG IVAARVPKKV LQFAGIEDVF TSSRGSTKTL GNFVKATFDC LMKTYGFLTP DF WKETRFT KSPFQEYFDI LAKPANKVIV YATEEAAPER VEA

UniProtKB: S5 DRBM domain-containing protein

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 28.38423 KDa
配列文字列: MKFNIANPTT GCQKKLEIDD DQKLRAFFDK RISQEVSGDS LGEEFKGYVF KIMGGCDKQG FPMKQGVLTP GRVRLLLYRG TPCFRGYGR RNGERRRKSV RGCIVSPDLS VLNLVIVKKG ENDLPGLTDT EKPRMRGPKR ASKIRKLFNL SKEDDVRKYV N TYRRNFTT ...文字列:
MKFNIANPTT GCQKKLEIDD DQKLRAFFDK RISQEVSGDS LGEEFKGYVF KIMGGCDKQG FPMKQGVLTP GRVRLLLYRG TPCFRGYGR RNGERRRKSV RGCIVSPDLS VLNLVIVKKG ENDLPGLTDT EKPRMRGPKR ASKIRKLFNL SKEDDVRKYV N TYRRNFTT KTGKNASKAP KIQRLVTPLT LQRKRARIAD KKKRIAKAKS EAADYQKLLA SRLKEQRERR SESLAKKRSR LS AASKPSI AA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S6

+
分子 #74: 40S body ribosomal protein uS4

分子名称: 40S body ribosomal protein uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 23.051686 KDa
配列文字列: MVHVSFYRNY GKTFKKPRRP YEKERLDAEL KLVGEYGLRC KRELWRVQYA LSRIRNAARM LLTLDEKDPR RIFEGEALLR RMNRYGLLD ESQNKLDYVL ALTVENFLER RLQTLVFKTG MAKSIHHARV LIRQRHIRVG RQVVNVASFM VRVDSQKHID F SLTSPFGG ...文字列:
MVHVSFYRNY GKTFKKPRRP YEKERLDAEL KLVGEYGLRC KRELWRVQYA LSRIRNAARM LLTLDEKDPR RIFEGEALLR RMNRYGLLD ESQNKLDYVL ALTVENFLER RLQTLVFKTG MAKSIHHARV LIRQRHIRVG RQVVNVASFM VRVDSQKHID F SLTSPFGG GRPGRVKRKN QKSAAKKAAG GDGDEEDEE

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #75: 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

分子名称: 30S ribosomal protein S15, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 17.099254 KDa
配列文字列:
MGRMHSRGKG ISASALPYKR TPPSWLKISA PDVEDNICKF AKKGLTPSQI GVILRDSHGI AQVKSVTGSK ILRILKAHGL APEIPEDLY HLIKKAVAIR KHLERNRKDK DSKFRLILVE SRIHRLARYY KKTKKLPPVW KYESTTASTL VA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15 N-terminal domain-containing protein

+
分子 #76: Ribosomal protein S14

分子名称: Ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 16.389855 KDa
配列文字列:
MSKRRTREPK EETVTLGPSV REGELVFGVA HIFASFNDTF IHVTDLSGRE TMVRITGGMK VKADRDESSP YAAMLAAQDV SQRCKELGI NALHIKLRAT GGNKTKTPGP GAQSALRALA RSGMKIGRIE DVTPIPT(IAS)ST RRKGGRRGRR L

UniProtKB: Ribosomal protein S14

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 15.445315 KDa
配列文字列:
MADKAVTIRT RKFMTNRLLA RKQFIIDVLH PGRANVSKAE LKEKLSRMYE VKDPNAIFVF KFRTHFGGGK STGFGLIYDS VENAKKYEP KYRLIRNGLD TKVEKSRKQM KERKNRAKKV RGVKKTKAGD AKKK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S24

+
分子 #78: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 9.620199 KDa
配列文字列:
MVLPNDVDLL NPPAEHEKKK HKLKRLVQSP NSFFMDVKCQ GCFNITTVFS HSQTVVVCGN CQTVLCQPTG GRARLIEGCS FRRKGD

UniProtKB: 40S ribosomal protein S27

+
分子 #79: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 6.953253 KDa
配列文字列:
MGKVHGSLAR AGKVRGQTPK VAKQDKKKKP RGRAHKRMQY NRRFVTAVVG FGKKRGPNSS EK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S30

+
分子 #80: 40S ribosomal protein S15a-1

分子名称: 40S ribosomal protein S15a-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 14.551979 KDa
配列文字列:
MVRVSVLNDA LKSMYNAEKA GKAQVELRPS SKVIIKFLIV MQKHGYIGDF QYVDDHRVGK IVVELNGRLN KCGVISPRFD VGVATIEGW TARLLPSRQF GYIVLTTSAG IMDHEEARRK NVGGKVLGFF Y

UniProtKB: 40S ribosomal protein S15a-1

+
分子 #42: tRNA

分子名称: tRNA / タイプ: rna / ID: 42 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 589.43 Da
配列文字列:
CA

+
分子 #43: 25S rRNA

分子名称: 25S rRNA / タイプ: rna / ID: 43 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 1.098453 MDa
配列文字列: GCGACCCCAG GUCAGGCGGG AUUACCCGCU GAGU(PSU)UAAGC AUA(OMU)CAA(OMU)AA GCGGAGGAAA AGAAACU (PSU)A CAAGGAUUCC CCUAGUAACG GCGAGCGAAC CGGGAACAGC CCAGCCUUAG AAUCGGGCGG CUCCGUCGUC CGAA (OMU)UGUA ...文字列:
GCGACCCCAG GUCAGGCGGG AUUACCCGCU GAGU(PSU)UAAGC AUA(OMU)CAA(OMU)AA GCGGAGGAAA AGAAACU (PSU)A CAAGGAUUCC CCUAGUAACG GCGAGCGAAC CGGGAACAGC CCAGCCUUAG AAUCGGGCGG CUCCGUCGUC CGAA (OMU)UGUA GUCUGGAGAA GCGUCCUCAG CGGCGGACCG GGCCCAAGUC CCCUGGAAGG GGGCGCCGGA GAGGGUGAGA G CCCCGUCG UGCCCGGACC CUGUCGCACC ACGAGGCGCU GUCUACGAGU CGGGUUGUUU GGGAAUGCAG CCCAAAUCGG GC GGUGAAU UCCGUCCAAG GCUAAAUACU GGCGAGAGAC CGAUAGCGAA CAAGUACCGC GAGGGAAAGA UG(A2M)AAAGGA CU(PSU)UGAAAAG AGAGUCAAAG AGU(OMG)CUUGAA AUUGUCGGGA GGGAAGCGGA UGGGGGCCGG CGAUGCGCCC CG GUCGGAU GUGGAACGGC GACGAGCCGG UCCGCCGAUC GACUCGGGGC GUGGACCAGC GUGGAUUGGG GGGGCGGCCA AAG CCCGGG CUCUCGAUAC GCCCGUGGAA CGCCGUCUCC CCGAUUGUGG AAGGCAGCGC GCGCCUCCGG CGUGCUUCGG CAUC UGCGC GCUCCGGACG CUGGCCUGUG GGCUCCCCAU UCGACCCGUC UUG(1MA)AAC(A2M)CG GACCAAGGAG U(OMC) (OMU)GACAUG UGUGCGAGUC AACGGGCGAG UAAACCCGUA AGGCGUAAGG AAGCUGAUUG GUGGGAUCCC CCUGAGGGG UGCACCGCCG ACCGACCUUG AUCUUCUGAG AAGGGUUCGA GUGUGAGCAU ACC(OMU)GUCGGG ACCC(OMG)A(A2M)A G AUGGUGA(A2M)C(PSU) AUGCCUGAGC GGGGCGAAGC CAGAGGAAAC UCUGGUGGAG GCCCGCAGCG AUACUG(A2M) CG UGCAAA(PSU)CGU UCGUCUGACU UGGGUAUAG(OMG) GGCGAAAGAC UAAUCGAACC GUCUAGU(A2M)GC UGGUUC CCU CCGAAGUUUC CC(PSU)CAGGAUA GCUGGAGCUC GCGUGCGAGU UCUA(PSU)CGGGU AAAGCCAA(PSU)G AUUAG AGGC CUCGGGGGCG CAACGCCCUC GACCUAU(PSU)CU CAAACUU(PSU)AA A(OMU)AGGUAGGA CGGCGCGGCU GCUU UGUUG AGCCGCGCCA CGGAAUCAAG AGCUCCAAGU GGGCCAU(PSU)(PSU)(PSU) UGGUAAGC(A2M)G AACUGGCGA UGCGGGAUGA ACCGGAAGCC GGGUUACGGU GCCAAACUGC GCGCUAACCU AGAUCCCACA AAGGGUGUUG GUCGA(PSU) UAA GACAGCAGGA CGGUGGUCAU GGAAGUCGAA AUCCGCUAAG GAGUGUGUAA CAACUCACCU GCCGAAUCAA CUAGCCC CG AAAAUGGAUG GCGCUUAAGC GCGCGACCUA CACCCGGCCG UCGGGGCAAG UGCCAGGCCC CGAUG(A2M)GUAG GAGG GCGCG GCGGUCGCUG CAAAACCUUG GGCGCGAGCC UGGGCGGAGC GGCCGUCGGU GCAGAU(OMC)UUG GUGGUAGU (A2M) (OMG)CAAAUAUUC AAA(PSU)GAGAA(OMC) U(PSU)UGAAGGCC GAAGAGGGGA AAGGUUCCAU GUGAACGGC ACUUGCACAU GGGUUAG(OMU)CG AUCCUAAGGG UCGGGGGAAC CCCGACAGAU AGCGCGUUUC GCGCGUACUC CGAAAG GGA AUCGGGUUAA AAUUCCUGAA CCGGGACGUG GCGGUUGACG GCAACGUUAG GAAGUCCGGA GACGUCGGCG GGAGCCU CG GGAAGAGUUA UCUUUUCUGU UUAACAGCCU GCCCACCCUG GAAUCGGCUC AGCCGGAGGU AGGGUCCAGC GGCUGGAA G AGCACCGCAC GUCGCGUGGU GUCCGGUGCG CUCCCGGCGG CCCUUGAAAA UCCGGAGGAC CGAAUGCCGU CCACGCCCG GUCGUACUCA UAA(OMC)CG(OMC)AUC A(OMG)GUCU(OMC)CAA GGUGAACAGC CUCUGGUCGA UGGAACAA(OMU)G UAGGCAAGG GAAG(PSU)CGGCA AAAUGGAUCC GUAACUUCGG GAAAAGGAUU GGCUCUGAGG GCUGGGCACG GGGGUCC CA GUCCCGAACC CGUCGGCUGU CGGUGGACUG CUCGAGCUGC UCCCGCGGCG AGAGCGGGUC GCCGCGUGCC GGCCGGGG G ACGGACUGGG AACGGUUCCU UCGGGGGCCU UCCCCGGGCG UCGAACAGCC AACUCAGAAC UGG(OMU)ACGGAC AAG (OMG)(OMG)G(A2M)AU CCGAC(PSU)G(PSU)UU AAUUAAAACA AAGCAUUGCG AUGGUCCCAA CGGAUGUUUA CGCA AUGUG AUU(PSU)CUGCC(OMC) AGUGCUCUGA AUG(PSU)CAAAGU GA(A2M)GAAA(PSU)UC AACCAAGC(OMG)C G GGUAAACG GCGGGAG(PSU)A(A2M) C(PSU)A(PSU)GAC(PSU)C(PSU) CUUAAGGUAG C(5MC)AA(A2M)UGCCU C(OMG)UCAU(OMC)UA AUUAGUGACG CGCAUGAA(PSU)G GA(PSU)UA(A2M)CGAG (A2M)UUCCCACUG U(OMC)C CUGUCU AC(OMU)A(PSU)CCAGC GAAACCACAG (OMC)CAAGGGAAC GGGCUUGGCA GAAUCA(OMG)CGG (OMG)GAA AGAAG ACCCU(OMG)(OMU)UGA GC(PSU)UGAC(OMU)CU AGUCCGAC(PSU)U UGUGAAAUGA CUUGAGAGGU GUAGU AUAA GUGGGAGCCG AAAGGCGAAA GUGAAAUACC ACUACUUUUA ACGUUAUUUU ACUUA(PSU)UCCG UGAAUCGGAA GC GGGGCAC UGCCCCUCUU UUUGGACCCA AGGCUCGCUU CGCGGGCCGA UCCGGGCGGA AGACAUUGUC AGGUGGGGAG UU (PSU)GGCUG(OMG) GGCGGCACAU CUGUUAAAAG (A2M)UAACGCAGG (OMU)(OMG)UCCUAAGA UGAGCUCAAC GAG AACAGA AAU(OMC)UCGUGU GGAACAGAAG GGUAAAAGCU CGU(PSU)UGAU(OMU)C UGAUUUCCAG (OMU)ACGAA (OMU)AC GAACCG(PSU)GAA AGCGUGGCCU AACGAUCCUU UAGACCUUCG GAAUUCGAAG CUA(OMG)A(OMG)GUGU C AGAAAAGU UACCACAG(OMG)G AUAACUGGC(PSU) UGUGGCAGC(OMC) AAGCGU(PSU)CAU AGCGACG(PSU)UG CU UUUUGA(PSU) CCUU(5MC)GAUGU CGG(OMC)(PSU)CU(OMU)CC UAUCAUUG(PSU)G AAGCAGAAUU CACCA (A2M)GUG UU(OMG)GAU(OMU)(OMG)(PSU)U CACCCACCAA UAGGGAACG(PSU) G(A2M)G(OMC)UGGG(UR3)U (PSU)AGA(OMC)CGUC GUGAGACAGG U(PSU)AGUUUUAC CCUACUGA(PSU)G ACAGUGUCGC AAUAGUAAUU CAACC UAGU ACGAGAGGAA CCGUUGAUUC ACACAAUUGG CCAUCGCGCU UGGUUGAAAA GCCAGUGGCG CGAAGCUACC GUGUGC UGG AUUAUGAC(PSU)G AACGCCUCUA AGUCAGAAUC CGGGCUAGAA GCGACGCAUG CGCCCGCCGU CCGCUUGCCG ACC CGCAGU AGGGGCCUUU GGCCCCCAAG GGCACGUGUC GUUGGCUAAG UCGCCGCGAC GGAAGCGUCG CGGUGACCGC CUUG AAGUA CAAUUUCCAU CGAGCGGCGG GUAGAAUCCU UUGCAGACGA C(OMU)UAAAUACG CGACGGGGUA UUGUAAGUGG C AGAGUGGC CUUGCUGCCA CGAUCCACUG AGAUUCAGCC CUUUGUCGCU CCGAUUCGU

GENBANK: GENBANK: OK073662.1

+
分子 #44: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 44 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 38.634941 KDa
配列文字列:
GGAUGCGAUC AUACCAGCAC UAACGCACCG GAUCCCAUCA GAACUCCGAA GUUAAGCGUG CUUGGGCGAG AGUAGUACUA GGAUGGGUG ACCCCCUGGG AAGUCCUCGU GUUGCAUCCC U

GENBANK: GENBANK: X55697.1

+
分子 #45: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 45 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 53.173613 KDa
配列文字列:
ACAAACGACU CUCGGCAACG GA(PSU)AUCUCGG CUCUCGCAUC GAUGAAG(A2M)AC GUAGCGAAAU GCGAUACUUG GU GUGAAU(PSU) (OMG)CAGAAUCCC GUGAACCAUC GAGUCUUUGA ACGCAAGUUG CGCCCGAAGC CAUUUGGCCG AGGGC ACGU CUGCCUGGGC GUCACGC

GENBANK: GENBANK: MH573911.1

+
分子 #46: 18S

分子名称: 18S / タイプ: rna / ID: 46 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 583.609125 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAU(A2M)UG CUUGUCU(OMC)AA AGAUUAAGCC AUGCAUGUGU AAGUAUGAAC AA AUUCAGA CUGUGAAACU GCGAAUGGCU CAU(PSU)AAAUCA G(PSU)UAUAGUUU G(PSU)U(OMU)GAUGGU AUCUACU AC U(OMC) ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAU(A2M)UG CUUGUCU(OMC)AA AGAUUAAGCC AUGCAUGUGU AAGUAUGAAC AA AUUCAGA CUGUGAAACU GCGAAUGGCU CAU(PSU)AAAUCA G(PSU)UAUAGUUU G(PSU)U(OMU)GAUGGU AUCUACU AC U(OMC)GGAUAACC GUAGUAAUUC UAG(A2M)GCUAAU ACGUGCAACA AACCCCGACU UCUGGAAGGG AUGCAUUUA (PSU)UAGAUAAAA GGUCGACGCG GGCUCUGCCC GUUGCUGC(OMG)A UGAUUCA(PSU)GA (PSU)AACUCGACG GAUC GCACG GCCAUCGUGC CGGCGACGCA UCA(PSU)UCAAA(PSU) UUCUGCCCUA UCAACUUUCG AUGGUAGGAU AGUGGCC UA CCAUGGUGGU GACGGG(PSU)GAC GGAGAAUUAG GGUUCGA(PSU)UC CGGAGA(OMG)GGA GCCUGAGAAA CGGCUA CCA CAU(OMC)CAAGGA AGGCAGCAGG CGCGC(A2M)AAUU ACCCAA(PSU)CCU GACACGGGGA GGU(A2M)GUGA (OMC) AAUAAAUAAC AAUACCGGGC UCUAUGAGUC UGGUAAUUGG AAUGAGUACA AUCUAAAUCC CUUAACGAGG (A2M) UCCAUUGG AGGGCAAGUC UGGUGCCAGC AGCCGCGG(OMU)A A(PSU)UCCAGCUC CAAUA(OMG)CGUA (UY1)A (PSU)UUAAGU UG(OMU)UGCAGUU (A2M)AAAAGCUCG UAG(PSU)UGGACU UUGGGAUGGG CCGGCCGGUC CGCCCUA GG UGUGCACCGG UCGUCUCGUC CCUUCUGUCG GCGAUGCGCU CCUGGCCUUA AUUGGCCGGG UCGUGCCUCC GGCGCUGU U ACU(PSU)UGAAGA AA(PSU)UAGAGUG CUCAAAGCAA GCCUACGCUC UGUAUACAUU (A2M)GCAUGGGA(PSU) AAC AUUAUA GGAUUUCGGU CCUAUUACGU UGGCCUUCGG GAUCGGAGUA AUGAUUAACA GGGACAGUCG GGGGCAUUCG UAUU UCAUA GUCAGAGGUG AAAU(PSU)CUUGG AUUUAUGAAA GACGAACAAC UGCGAAAGCA U(PSU)(PSU)GCCAAGG AUG UUUUCA UUAAUCAAGA (A2M)CGAAAGUUG GGGGCUCGAA GACGA(PSU)CAGA UACCG(OMU)CCUA GUCUCAACCA (PSU)AAACGAUG CCGACCAGGG AUCGGCGGAU GUUGCUUUUA GGACUCCGCC GGCACCUUAU GAGAAAUCAA AGUUUUU GG G(PSU)UCCGGGGG GAGUA(PSU)GGUC GCAAGGCUGA AACUUAAAGG AAUUGACGGA AGGGCACCAC CAGGAGUGGA GCC(PSU)GCGGC (PSU)UAAUU(PSU)GAC (I2T)CAACACGGG GAAACU(PSU)ACC AGG(PSU)(OMC)CAGAC AUA GUAAGG AUUGACAGAC UGAGAGCUCU UUCUUGAUUC (OMU)A(OMU)GGGUGG(OMU) G(OMG)UGCAUGGC (4AC)GUU CUUAG U(PSU)GGUGGAGC GA(PSU)UUG(PSU)CUG G(PSU)UAAUUCCG UUAACGA(A2M)CG AGACCUCAGC CUGCU AACU AGCUAUGCGG AGGUAUCCCU UCGCGGCCAG CU(OMU)CUUAGAG GGACUACGGC CUUUUAGGCC GCGGAAGUUU GA GGCAAUA ACA(OMG)GUCUGU GAUGCCC(OMU)UA GAUGUUCUGG GCCGCACGCG CGCUACACUG AUGUA(PSU)UCAA C GAGCUUAU AGCCUUGGCC GACAGGCCCG GGUAAUCUUU GAAAUU(PSU)CA(PSU) CGUGAUGGGG AUAGAUCAUU GCAA UUGU(PSU) GGUCUUCAAC G(A2M)G(7MG)AAUUCC UAGUAAGCGC GAGUCAUCAG CUCGCGUUGA CUACGUCCCU GCC CUU(PSU)GU ACACACCG(OMC)C CGUCGCUCCU ACCGAUUGAA UGAUCCGGUG AAAUGUUCGG AUCGCGGCGA CGUGGG CGG UUCGCUGCCC GCGACGUCGC GAGAAGUCCA UUGAACCUUA UCAUUUAGAG GA(A2M)GGAGAAG UCGUA(6MZ)CAA GGUUUC(4AC)GUA GGUG(MA6)(MA6)CCUG CGGAAGGAUC AUUG

+
分子 #59: tRNA_1

分子名称: tRNA_1 / タイプ: rna / ID: 59 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 4.470731 KDa
配列文字列:
AGGCUGAUAA CCUA

+
分子 #60: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 60 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Solanum lycopersicum (トマト)
分子量理論値: 895.596 Da
配列文字列:
AUC

+
分子 #81: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 81 / コピー数: 119 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #82: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 82 / コピー数: 364 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #83: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 83 / コピー数: 6 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #84: SPERMINE

分子名称: SPERMINE / タイプ: ligand / ID: 84 / コピー数: 3 / 式: SPM
分子量理論値: 202.34 Da
Chemical component information

ChemComp-SPM:
SPERMINE / スペルミン

+
分子 #85: SPERMIDINE

分子名称: SPERMIDINE / タイプ: ligand / ID: 85 / コピー数: 1 / 式: SPD
分子量理論値: 145.246 Da
Chemical component information

ChemComp-SPD:
SPERMIDINE / スペルミジン

+
分子 #86: 1,4-DIAMINOBUTANE

分子名称: 1,4-DIAMINOBUTANE / タイプ: ligand / ID: 86 / コピー数: 1 / 式: PUT
分子量理論値: 88.151 Da
Chemical component information

ChemComp-PUT:
1,4-DIAMINOBUTANE / プトレシン

+
分子 #87: beta-D-glucopyranose

分子名称: beta-D-glucopyranose / タイプ: ligand / ID: 87 / コピー数: 1 / 式: BGC
分子量理論値: 180.156 Da
Chemical component information

ChemComp-BGC:
beta-D-glucopyranose / β-D-グルコピラノ-ス

+
分子 #88: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 88 / コピー数: 4728 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 30.2 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
最大 デフォーカス（公称値）: 2.8000000000000003 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

3883

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.38 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 335806
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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