ChemComp-0R5: 2'-deoxy-5-[(4-ethynylphenyl)ethynyl]uridine 5'-(tetrahydrogen tr...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 0R5
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5-[(4-ethynylphenyl)ethynyl]uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)

Chemical information

組成

組成式: C₁₉H₁₉N₂O₁₄P₃ / 原子数: 57 / 化学式量: 592.28 / 形式電荷: 0

その他

4elt

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 0R5 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4ELT

履歴

作成	2012年4月26日
公開	2013年3月27日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(N2C(=O)NC(=O)C(C#Cc1ccc(C#C)cc1)=C2)CC3O
• CACTVS 3.370: O[CH]1C[CH](O[CH]1CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)N2C=C(C#Cc3ccc(cc3)C#C)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C#Cc1ccc(cc1)C#CC2=CN(C(=O)NC2=O)C3CC(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)N2C=C(C#Cc3ccc(cc3)C#C)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C#Cc1ccc(cc1)C#CC2=CN(C(=O)NC2=O)[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C19H19N2O14P3/c1-2-12-3-5-13(6-4-12)7-8-14-10-21(19(24)20-18(14)23)17-9-15(22)16(33-17)11-32-37(28,29)35-38(30,31)34-36(25,26)27/h1,3-6,10,15-17,22H,9,11H2,(H,28,29)(H,30,31)(H,20,23,24)(H2,25,26,27)/t15-,16+,17+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NDHYKBWELLKQHS-GVDBMIGSSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-5-[(4-ethynylphenyl)ethynyl]uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[(2R,3S,5R)-5-[5-[2-(4-ethynylphenyl)ethynyl]-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-4elt:
Snapshot of the large fragment of DNA polymerase I from Thermus Aquaticus processing modified pyrimidines