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タイトルCryo-EM structure of the vaccinia virus entry fusion complex reveals a multicomponent fusion machinery.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 12, Issue 3, Page eaec0254, Year 2026
掲載日2026年1月16日
著者Chang Sheng-Huei Lin / Ching-An Li / Chun-Hsiung Wang / Chi-Fei Kao / Hsiao-Jung Chiu / Min-Chi Yeh / Hua-De Gao / Meng-Chiao Ho / Hsien-Ming Lee / Wen Chang
PubMed 要旨Membrane fusion is essential for viral entry. Unlike class I-III fusion proteins, vaccinia virus (VACV) uses a multicomponent entry fusion complex (EFC). Using cryo-electron microscopy, we determined ...Membrane fusion is essential for viral entry. Unlike class I-III fusion proteins, vaccinia virus (VACV) uses a multicomponent entry fusion complex (EFC). Using cryo-electron microscopy, we determined the full-length structure of the VACV EFC at near-atomic resolution, revealing a 15-protein asymmetric assembly organized into three layers. The central A16/G9/J5 heterotrimer forms the fusion core, stabilized by conserved PXXCW and Delta motifs, and anchors two A28/H2 adaptor dimers linked to peripheral G3/L5/A21/O3 scaffolds. Structural and evolutionary analyses identify a conserved N-terminal domain in A16 containing a myristoyl-binding pocket and a phenylalanine-rich region that stabilizes the trimer and may regulate lipid engagement. An additional component, F9, binds peripherally to J5, A21, and H2 through Delta-like motifs, reinforcing the prefusion architecture. Together, these results define the VACV EFC as a unique multiprotein fusion machinery and provide a structural framework for understanding the mechanism of poxvirus entry and membrane fusion.
リンクSci Adv / PubMed:41533782 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.05 Å
構造データ

64647

9uzo

EMDB-64647, PDB-9uzo:
Cryo-EM Structure of the Vaccinia Virus Entry/Fusion Complex (EFC) Lacking the F9 Subunit
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.05 Å

64648

9uzp

EMDB-64648, PDB-9uzp:
Cryo-EM Structure of the Vaccinia Virus Entry/Fusion Complex (EFC) Including the F9 Subunit
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.05 Å

由来
  • orthopoxvirus vaccinia (ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN / Vaccinia Virus / Entry-Fusion Complex (EFC) / cryo-EM / Single-particle reconstruction

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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