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タイトルA bacteriophage tubulin forms microtubule-like assemblies with nine protofilaments.
ジャーナル・号・ページStructure, Vol. 34, Issue 3, Page 394-403.e3, Year 2026
掲載日2026年3月5日
著者Dwaipayan Basu / Siyu Chen / Ying-Xing Li / Niklas Klusch / Koe Inlow / Joe Pogliano / Elizabeth Villa / Kevin D Corbett /
PubMed 要旨Tubulin family proteins play central roles in the organization and dynamics of cytoskeletal systems across the Tree of Life. In one family of bacteriophages (phages), tubulin-like proteins called ...Tubulin family proteins play central roles in the organization and dynamics of cytoskeletal systems across the Tree of Life. In one family of bacteriophages (phages), tubulin-like proteins called PhuZ (Phage tubulin/FtsZ) form dynamic filaments that position and rotate an intracellular compartment, the "phage nucleus," in which the phage genome is replicated. PhuZ filaments also mediate trafficking of nascent capsids from the cell periphery to the phage nucleus for genome packaging. PhuZ from the Pseudomonas-infecting phages 201Phi2-1 and PhiKZ form assemblies with three protofilaments. Here, we determine a 2.8 Å resolution structure of PhuZ from the E. coli-infecting phage Goslar, which forms an elaborate "cytoskeletal vortex" in infected cells. We find that in vitro-assembled Goslar PhuZ forms rigid tubes with nine nearly-straight protofilaments. The lateral interactions mediating this assembly are fundamentally different from eukaryotic tubulin, leading to a distinctive overall architecture for Goslar PhuZ filaments.
リンクStructure / PubMed:41468894 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度2.75 - 2.84 Å
構造データ

71729

9pm9

EMDB-71729, PDB-9pm9:
PhuZ Tubulin from phage Goslar (locally refined monomer)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.75 Å

71738

9pmk

EMDB-71738: PhuZ Tubulin Filament from phage Goslar
PDB-9pmk: PhuZ Tubulin Tetramer from phage Goslar
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.84 Å

化合物

ChemComp-G2P:
PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / GMP-CPP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

由来
  • goslarvirus (ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN / Phage / Tubulin / PhuZ

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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