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Structure paper

タイトルMolecular basis for substrate recognition and transport of mammalian taurine transporters.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 122, Issue 27, Page e2425549122, Year 2025
掲載日2025年7月8日
著者Mingxing Wang / Jin He / Qianwen Cai / Shen-Ao Zhang / Ji She /
PubMed 要旨The taurine transporter (TAUT) mediates cellular taurine uptake, playing a critical role in human health and longevity. In this study, we present cryogenic electron microscopy structures of both ...The taurine transporter (TAUT) mediates cellular taurine uptake, playing a critical role in human health and longevity. In this study, we present cryogenic electron microscopy structures of both mouse and human TAUT in various conformational states. The taurine-bound, occluded forms of mouse and human TAUT reveal the substrate binding pocket and the ion binding sites. The amino group of taurine interacts with Glu406 at the binding site, constituting a key structural feature determining substrate preference. While both imidazole acetic acid and guanidinoethyl sulfonate (GES) inhibit TAUT by competing with taurine for the binding site, GES also functions as a substrate of TAUT. Moreover, mouse TAUT is captured in an inward-open apo conformation, where the tilted movement of transmembrane helix (TM) 1a opens the intracellular gate. Notably, TM6 exhibits two distinct conformational states: the canonical form consisting of two half-helices and a continuous straight helix. In the latter conformation, TM6 partially occupies the substrate binding site, likely promoting taurine release. Together, our findings provide critical insights into the molecular mechanisms by which TAUT recognizes and transports taurine.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:40601627 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.84 - 3.3 Å
構造データ

62434

9kmi

EMDB-62434, PDB-9kmi:
Taurine bound mTAUT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.05 Å

62435

9kmj

EMDB-62435, PDB-9kmj:
Taurine bound hTAUT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

62436

9kmk

EMDB-62436, PDB-9kmk:
apo mTAUT in inward open II state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

62437

9kml

EMDB-62437, PDB-9kml:
apo mTAUT in inward open I state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.11 Å

62438

9kmm

EMDB-62438, PDB-9kmm:
IAA bound mTAUT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

62648

9kyo

EMDB-62648, PDB-9kyo:
GES bound mTAUT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.84 Å

化合物

ChemComp-TAU:
2-AMINOETHANESULFONIC ACID / タウリン

ChemComp-CL:
Unknown entry / クロリド

ChemComp-NA:
Unknown entry / ナトリウムカチオン

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-IZC:
2H-IMIDAZOL-4-YLACETIC ACID / 神経伝達物質*YM

ChemComp-3S5:
Taurocyamine / タウロシアミン

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Transporter / Taurine / Chlorine / Sodium / MEMBRANE PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / SLC6A6

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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