[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルAntibodies elicited by hepatitis E vaccination in humans confer cross-genus protection against rat hepatitis E virus.
ジャーナル・号・ページJ Hepatol, Vol. 83, Issue 5, Page 1046-1056, Year 2025
掲載日2025年6月24日
著者Zihao Chen / Liqin Liu / Jianwen Situ / Guanghui Li / Shaoqi Guo / Qi Lai / Shusheng Wu / Yanan Jiang / Jingyan Fan / Zimin Tang / Yu Li / Guiping Wen / Siling Wang / Dong Ying / Yonghao Liang / Stanley Siu-Fung Ho / Xiaodan Ma / James Yiu-Hung Tsoi / Estie Hon-Kiu Shun / Nicholas Foo-Siong Chew / Weihui Ma / Weiwei Mao / Tingting Li / Zhenqin Chen / Mujin Fang / Yingbin Wang / Hai Yu / Fa Zhang / Anna Jinxia Zhang / Shaowei Li / Ningshao Xia / Siddharth Sridhar / Qingbing Zheng / Zizheng Zheng /
PubMed 要旨BACKGROUND & AIMS: Paslahepevirus balayani (bHEV), also known as hepatitis E virus (HEV), encompasses eight genotypes, five of which infect humans. Rats are natural reservoirs of Rocahepevirus ratti ...BACKGROUND & AIMS: Paslahepevirus balayani (bHEV), also known as hepatitis E virus (HEV), encompasses eight genotypes, five of which infect humans. Rats are natural reservoirs of Rocahepevirus ratti genotype 1 (HEV-r-1; rat HEV; rHEV), which has recently been implicated in viral hepatitis. Despite the antigenic divergence between bHEV and rHEV, studies on shared protective antibodies remain rare.
手法: Polyclonal and monoclonal antibody responses against bHEV and rHEV were analyzed using antibody enzyme-linked immunosorbent assays. The efficacy of six potent bHEV-elicited cross-reactive antibodies in preventing rHEV infection was evaluated via challenge assays in rats. Cryo-electron microscopy was performed to assess the structural basis for the differential protective efficacy of the six antibodies. The viral lysis ability of these antibodies was assessed by separately reacting purified HEV-b-1 and HEV-r-1 virions with each antibody.
RESULTS: We determined that antibody responses to bHEV infection and vaccination possess limited cross-reactivity to rHEV and identified two cross-reactive antigenic sites within the E2s domain. Structural analysis and animal challenge studies pinpointed potent cross-reactive antibodies targeting antigenic site 1, indicating its prophylactic efficacy against rHEV. Conversely, antibodies recognizing antigenic site 2 were found to facilitate viral lysis of bHEV but not rHEV.
CONCLUSIONS: These findings underscore the importance of antigenic site 1 in the design of broad-spectrum vaccines and therapeutics to mitigate the impact of diverse HEV genotypes on human health.
IMPACT AND IMPLICATIONS: Rat HEV (rHEV) spillover to humans represents an unprecedented threat. Significant antigenic differences between rHEV and bHEV (Paslahepevirus balayani) may exacerbate the impact of viral hepatitis. Our study reveals that cross-reactive human antibodies can offer protection against rHEV infection. Cross-protective antibodies targeting antigenic site 1 can be used to guide the development of practical strategies for preventing rHEV infection.
リンクJ Hepatol / PubMed:40571163
手法EM (単粒子)
解像度2.38 - 2.91 Å
構造データ

EMDB-61503, PDB-9jie:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab C6
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.76 Å

EMDB-61504, PDB-9jif:
Hepatitis E virus capsid protein E2s domain (genotype I) in complex with Fab C6
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.79 Å

EMDB-61505, PDB-9jig:
Hepatitis E virus capsid protein E2s domain (genotype IV) in complex with Fab C6
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.38 Å

EMDB-61506, PDB-9jii:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab C158
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.54 Å

EMDB-61507, PDB-9jij:
Hepatitis E virus capsid protein E2s domain (genotype I) in complex with Fab C158
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.64 Å

EMDB-61508, PDB-9jik:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab C127
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.91 Å

EMDB-61509, PDB-9jil:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab C131
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.44 Å

EMDB-61510, PDB-9jim:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab C145
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.86 Å

EMDB-61511, PDB-9jin:
Rat hepatitis E virus capsid protein E2s domain in complex with Fab H4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.56 Å

EMDB-61512, PDB-9jio:
Hepatitis E virus capsid protein E2s domain (genotype I) in complex with Fab H4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.87 Å

由来
  • rocahepevirus ratti (ウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • Paslahepevirus balayani (ウイルス)
  • hepatitis e virus genotype 1 (isolate human/burma) (ウイルス)
  • hepatitis e virus (E 型肝炎ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Hepatitis E virus / Capsid protein / E2s domain / Immune complex / C6 antibody / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / C158 antibody / C127 antibody / C131 antibody / C145 antibody / H4 antibody

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る