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Structure paper

タイトルProtection against lethal canine distemper virus infection by a dual epitope-targeting synthetic antibody.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 17, Issue 1, Page 103, Year 2026
掲載日2026年1月7日
著者Melanie Scherer / Nadia Djabeur / Oliver Siering / Jean-Marc Jeckelmann / Marianne Wyss / Marina Cresci / Morgane Di Palma Subran / Rainer Riedl / Patrick Chames / Christian K Pfaller / Bevan Sawatsky / Dimitrios Fotiadis / Philippe Plattet /
PubMed 要旨Despite vaccine availability, the morbilliviruses measles virus and canine distemper virus (CDV) are still causing major health impairments in human and animal populations. Here, we identified two ...Despite vaccine availability, the morbilliviruses measles virus and canine distemper virus (CDV) are still causing major health impairments in human and animal populations. Here, we identified two potent, neutralizing single domain antibodies directed against the tetrameric receptor binding (H) protein of CDV. Structural analyses spotlighted two vulnerable sites within the H protein. While the first overlaps with the receptor binding site, the second encompasses amino acid residues of two protomers located at the distal dimeric head interface, which supports distinct mechanisms of neutralization. Upon application of an engineered tetravalent and biparatopic antibody, ferrets were protected at a remarkably low antibody dose (1 mg/kg) administered intra-peritoneally on days 3 and 7 post-exposure of a lethal CDV challenge. Collectively, this study spotlights the power of integrating multiple mechanisms of neutralization in a single format and provides a roadmap to design next-generation therapeutics against morbilliviral infections as well as other infectious pathogens.
リンクNat Commun / PubMed:41501035 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.1 - 4.3 Å
構造データ

EMDB-52020: Cryo-EM consensus map of the canine distemper virus tetrameric attachment H glycoprotein in complex with two different Nanobodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

EMDB-52021: Cryo-EM focused refined map of the canine distemper virus dimer II region of the tetrameric attachment H glycoprotein in complex with two different Nanobodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-52023: Cryo-EM focused refined map of the canine distemper virus dimer I region of the tetrameric attachment H glycoprotein in complex with two different Nanobodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

52024

9hbp

EMDB-52024, PDB-9hbp:
Cryo-EM structure of the canine distemper virus tetrameric attachment H glycoprotein in complex with two different Nanobodies
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

由来
  • morbillivirus canis (ウイルス)
  • lama glama (ラマ)
キーワードVIRAL PROTEIN / canine distemper virus / hemagglutinine / CDV / H-protein / Complex / Nanobody

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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